More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0660 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  78.26 
 
 
622 aa  1003    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2182  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.42 
 
 
621 aa  754    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.863514  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0660  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 
620 aa  1264    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.464509  normal  0.415833 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0706  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.58 
 
 
618 aa  587  1e-166  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.437381 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.74 
 
 
607 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.1 
 
 
637 aa  560  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.57 
 
 
647 aa  559  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.01 
 
 
652 aa  561  1e-158  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.42 
 
 
636 aa  556  1e-157  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.63 
 
 
676 aa  557  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.22 
 
 
630 aa  555  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3044  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.23 
 
 
646 aa  557  1e-157  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000897526  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.99 
 
 
645 aa  554  1e-156  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107147  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  49.26 
 
 
665 aa  553  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0074  cell division protein  48.74 
 
 
645 aa  553  1e-156  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  48.29 
 
 
638 aa  551  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  47.56 
 
 
660 aa  550  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000182706  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  47.2 
 
 
658 aa  551  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.99 
 
 
639 aa  550  1e-155  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00158  cell division protease FtsH  49.17 
 
 
646 aa  549  1e-155  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.3 
 
 
640 aa  550  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.32 
 
 
615 aa  551  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1207  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.82 
 
 
643 aa  546  1e-154  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390556  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1467  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49 
 
 
644 aa  545  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179606  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  46.3 
 
 
612 aa  546  1e-154  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42890  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.77 
 
 
637 aa  545  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  46.76 
 
 
614 aa  542  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  47.36 
 
 
651 aa  544  1e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.32 
 
 
610 aa  543  1e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.75 
 
 
616 aa  544  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  47.6 
 
 
613 aa  543  1e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.43 
 
 
602 aa  543  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.47 
 
 
643 aa  542  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.32 
 
 
610 aa  543  1e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4718  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.7 
 
 
637 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518421  normal  0.0121069 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.47 
 
 
639 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  46.47 
 
 
639 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0714  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.6 
 
 
634 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.87442  normal  0.0617842 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  46.57 
 
 
608 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  46.23 
 
 
641 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.6 
 
 
656 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  46.22 
 
 
693 aa  540  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.05 
 
 
637 aa  541  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62860  cell division protein FtsH  48.44 
 
 
639 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5471  cell division protein FtsH  48.44 
 
 
642 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.72 
 
 
634 aa  538  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4584  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.7 
 
 
634 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794949  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  45.88 
 
 
652 aa  535  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  46.39 
 
 
764 aa  537  1e-151  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0772  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.21 
 
 
635 aa  536  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000087079  normal  0.0618887 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  47.58 
 
 
616 aa  538  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3615  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.38 
 
 
640 aa  537  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0280177  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.03 
 
 
651 aa  537  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0253083  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  46.74 
 
 
637 aa  538  1e-151  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.97 
 
 
601 aa  535  1e-151  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.03 
 
 
671 aa  537  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.96 
 
 
621 aa  536  1e-151  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.7 
 
 
612 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02481  cell division protein FtsH2  48.3 
 
 
602 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  45.5 
 
 
647 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1606  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.74 
 
 
660 aa  534  1e-150  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  46.9 
 
 
627 aa  533  1e-150  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0703  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.62 
 
 
650 aa  532  1e-150  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0142787  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.9 
 
 
601 aa  534  1e-150  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4719  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.28 
 
 
634 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3592  ATP-dependent metalloprotease  45.5 
 
 
647 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00319823  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  45.5 
 
 
647 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000163816  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  45.86 
 
 
644 aa  529  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.86 
 
 
647 aa  529  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.75 
 
 
640 aa  529  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.14 
 
 
616 aa  531  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  45.32 
 
 
647 aa  529  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.56 
 
 
630 aa  530  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.09 
 
 
611 aa  531  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  45.67 
 
 
626 aa  531  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  45.86 
 
 
647 aa  529  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1133  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.77 
 
 
630 aa  530  1e-149  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0177636  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  45.34 
 
 
647 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  45.86 
 
 
644 aa  529  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  47.36 
 
 
641 aa  530  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  45.34 
 
 
647 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  45.86 
 
 
644 aa  529  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.14 
 
 
616 aa  531  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.03 
 
 
655 aa  528  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.15 
 
 
647 aa  531  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.38 
 
 
645 aa  531  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  46.29 
 
 
681 aa  531  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  45.86 
 
 
647 aa  529  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.52 
 
 
673 aa  531  1e-149  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  45.86 
 
 
644 aa  529  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.6 
 
 
617 aa  525  1e-148  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.83 
 
 
612 aa  528  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.32 
 
 
643 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4497  cell division protein FtsH  47.61 
 
 
634 aa  527  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.554573  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4187  peptidase M41, FtsH  46.99 
 
 
634 aa  528  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000128423  normal  0.66671 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.57 
 
 
620 aa  527  1e-148  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.67 
 
 
612 aa  528  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  45.65 
 
 
640 aa  528  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  46.52 
 
 
639 aa  527  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  44.86 
 
 
649 aa  525  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>