More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0159 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1984  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.74 
 
 
659 aa  669    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.614445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4836  Microtubule-severing ATPase  63.41 
 
 
641 aa  708    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 
666 aa  1318    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302131  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1606  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.02 
 
 
660 aa  592  1e-168  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.67 
 
 
673 aa  530  1e-149  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  45.95 
 
 
608 aa  528  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.97 
 
 
640 aa  528  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.39 
 
 
645 aa  523  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.34 
 
 
676 aa  520  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.89 
 
 
639 aa  521  1e-146  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  44.86 
 
 
614 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.09 
 
 
621 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.5 
 
 
652 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.2 
 
 
647 aa  518  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.32 
 
 
640 aa  512  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.27 
 
 
607 aa  513  1e-144  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.39 
 
 
612 aa  512  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  45.87 
 
 
665 aa  514  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.52 
 
 
630 aa  513  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  45.23 
 
 
649 aa  512  1e-144  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.5 
 
 
628 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427373  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.22 
 
 
612 aa  511  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.33 
 
 
631 aa  509  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  45.07 
 
 
644 aa  510  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1512  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.5 
 
 
628 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0580139  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0571  cell division protein FtsH  46.5 
 
 
628 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0777  cell division protein FtsH  46.5 
 
 
628 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0580  cell division protein FtsH  46.5 
 
 
628 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.51431  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1186  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.33 
 
 
631 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.21079 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0879  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.17 
 
 
629 aa  509  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200568  normal  0.0679699 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1615  cell division protein FtsH  46.5 
 
 
628 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24975  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.33 
 
 
615 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  46.81 
 
 
617 aa  511  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4439  FtsH peptidase  46.33 
 
 
632 aa  510  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172586  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0483  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.93 
 
 
631 aa  511  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000161272  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2776  cell division protein FtsH  46.67 
 
 
628 aa  509  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182791  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  46.81 
 
 
617 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  45.75 
 
 
631 aa  509  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1262  FtsH peptidase  45.83 
 
 
629 aa  509  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1288  cell division protein FtsH  46.5 
 
 
628 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.725972  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  45.61 
 
 
637 aa  512  1e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0816  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.17 
 
 
627 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1268  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.17 
 
 
631 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.972429  normal  0.432924 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.13 
 
 
642 aa  509  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1174  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.33 
 
 
631 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.378107  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1297  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.17 
 
 
631 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17526  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.02 
 
 
652 aa  510  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.62 
 
 
636 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  45.71 
 
 
641 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.13 
 
 
642 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.65 
 
 
640 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  45.04 
 
 
640 aa  505  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0706  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.03 
 
 
618 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.437381 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.13 
 
 
642 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.87 
 
 
637 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  45.07 
 
 
764 aa  508  9.999999999999999e-143  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.32 
 
 
643 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.53 
 
 
671 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2262  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.71 
 
 
641 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000538209  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2862  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.48 
 
 
629 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198246  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1223  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.4 
 
 
651 aa  507  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.514183  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  46.95 
 
 
639 aa  507  9.999999999999999e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0703  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.15 
 
 
650 aa  503  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0142787  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.15 
 
 
635 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  46.32 
 
 
617 aa  504  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  43.15 
 
 
635 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.36 
 
 
637 aa  504  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.5 
 
 
647 aa  503  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.18 
 
 
601 aa  503  1e-141  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.05 
 
 
601 aa  503  1e-141  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  44.09 
 
 
681 aa  503  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  46.62 
 
 
638 aa  500  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3452  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.19 
 
 
660 aa  499  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380893  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  44.61 
 
 
640 aa  502  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  46.09 
 
 
626 aa  501  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.98 
 
 
640 aa  501  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.32 
 
 
640 aa  500  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2460  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.99 
 
 
635 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.15 
 
 
656 aa  501  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.64 
 
 
638 aa  501  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02581  cell division protein FtsH2  46.58 
 
 
619 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2182  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.93 
 
 
621 aa  499  1e-140  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.863514  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.82 
 
 
650 aa  499  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  44.48 
 
 
649 aa  499  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.82 
 
 
647 aa  496  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  44.65 
 
 
643 aa  497  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.4 
 
 
620 aa  498  1e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.14 
 
 
647 aa  498  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  45.15 
 
 
647 aa  497  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1133  membrane protease FtsH catalytic subunit  45.38 
 
 
630 aa  497  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0177636  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  44.98 
 
 
647 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000163816  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  44.82 
 
 
647 aa  496  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  44.98 
 
 
647 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  44.82 
 
 
644 aa  497  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  44.82 
 
 
644 aa  497  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  44.82 
 
 
644 aa  497  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3592  ATP-dependent metalloprotease  44.98 
 
 
647 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00319823  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  44.82 
 
 
647 aa  497  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  44.98 
 
 
647 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  43.78 
 
 
612 aa  496  1e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>