More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1984 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4836  Microtubule-severing ATPase  68.85 
 
 		 641 aa  815    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1984  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 		 659 aa  1306    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.614445 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.64 
 
 		 666 aa  636    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1606  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.61 
 
 		 660 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  49.92 
 
 		 608 aa  547  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  47.95 
 
 		 614 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  49.66 
 
 		 640 aa  531  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.83 
 
 		 637 aa  530  1e-149  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.43 
 
 		 652 aa  528  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.59 
 
 		 671 aa  525  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.43 
 
 		 656 aa  523  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.25 
 
 		 676 aa  522  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.08 
 
 		 621 aa  523  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0706  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.52 
 
 		 618 aa  521  1e-146  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.437381 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.57 
 
 		 612 aa  520  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  48.22 
 
 		 665 aa  520  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.25 
 
 		 612 aa  521  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  47.63 
 
 		 637 aa  515  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.3 
 
 		 607 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.53 
 
 		 630 aa  512  1e-144  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1207  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.97 
 
 		 643 aa  513  1e-144  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.91 
 
 		 635 aa  514  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.56 
 
 		 617 aa  514  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.88 
 
 		 635 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0074  cell division protein  49.21 
 
 		 645 aa  509  1e-143  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  47.88 
 
 		 635 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2460  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.05 
 
 		 635 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.91 
 
 		 636 aa  511  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.39 
 
 		 645 aa  511  1e-143  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107147  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.83 
 
 		 633 aa  508  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33311  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.72 
 
 		 647 aa  508  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.81 
 
 		 631 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0703  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.36 
 
 		 650 aa  508  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0142787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00158  cell division protease FtsH  49.82 
 
 		 646 aa  504  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.56 
 
 		 639 aa  503  1e-141  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.31 
 
 		 634 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0879  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.63 
 
 		 629 aa  503  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200568  normal  0.0679699 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.74 
 
 		 630 aa  505  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1262  FtsH peptidase  46.7 
 
 		 629 aa  502  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.92 
 
 		 647 aa  503  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.49 
 
 		 673 aa  503  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1223  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.49 
 
 		 651 aa  499  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.514183  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0777  cell division protein FtsH  48.06 
 
 		 628 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1512  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.06 
 
 		 628 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0580139  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.06 
 
 		 628 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427373  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  49.06 
 
 		 649 aa  500  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0580  cell division protein FtsH  48.06 
 
 		 628 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.51431  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0571  cell division protein FtsH  48.06 
 
 		 628 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.68 
 
 		 637 aa  501  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1615  cell division protein FtsH  48.06 
 
 		 628 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24975  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.55 
 
 		 631 aa  499  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2776  cell division protein FtsH  47.89 
 
 		 628 aa  499  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182791  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2862  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.64 
 
 		 629 aa  501  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1288  cell division protein FtsH  48.06 
 
 		 628 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.725972  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  45.45 
 
 		 645 aa  499  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.36 
 
 		 652 aa  499  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  46.34 
 
 		 638 aa  497  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3452  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.92 
 
 		 660 aa  497  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380893  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  48.89 
 
 		 644 aa  498  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  46.64 
 
 		 626 aa  497  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2170  peptidase M41, FtsH  46.35 
 
 		 627 aa  495  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415072  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1268  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.46 
 
 		 631 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.972429  normal  0.432924 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4439  FtsH peptidase  47.63 
 
 		 632 aa  497  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0483  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.03 
 
 		 631 aa  496  1e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000161272  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0816  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.46 
 
 		 627 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1186  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.64 
 
 		 631 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.21079 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  47.24 
 
 		 639 aa  497  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1174  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.64 
 
 		 631 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.378107  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1297  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.46 
 
 		 631 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17526  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  47.24 
 
 		 644 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.24 
 
 		 647 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1180  cell division protein FtsH  46.6 
 
 		 617 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334987  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  46.73 
 
 		 647 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  46.9 
 
 		 647 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  45.37 
 
 		 649 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  46.9 
 
 		 647 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000163816  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.18 
 
 		 640 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  48.27 
 
 		 613 aa  493  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  47.24 
 
 		 644 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  47.29 
 
 		 616 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1012  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.27 
 
 		 616 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  47.24 
 
 		 647 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  48.35 
 
 		 617 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3044  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.48 
 
 		 646 aa  495  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000897526  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  47.85 
 
 		 617 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  47.24 
 
 		 644 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0091  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.07 
 
 		 625 aa  493  9.999999999999999e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00172576  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1467  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.27 
 
 		 644 aa  492  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  47.24 
 
 		 644 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  47.24 
 
 		 647 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3592  ATP-dependent metalloprotease  46.9 
 
 		 647 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00319823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  48.02 
 
 		 617 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.44 
 
 		 650 aa  494  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  47.24 
 
 		 647 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3248  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.27 
 
 		 616 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  45.96 
 
 		 612 aa  493  9.999999999999999e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.93 
 
 		 617 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00193369  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1020  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.8 
 
 		 659 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000208375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3592  ATP-dependent metalloprotease  47.07 
 
 		 647 aa  491  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000114537  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.86 
 
 		 638 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>