More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0185 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  82.41 
 
 		 403 aa  639    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  79.75 
 
 		 404 aa  659    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  100 
 
 		 405 aa  825    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  80.25 
 
 		 405 aa  666    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  81.73 
 
 		 405 aa  679    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  63.59 
 
 		 407 aa  479  1e-134  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  62.07 
 
 		 410 aa  481  1e-134  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  61.92 
 
 		 406 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  60.98 
 
 		 407 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  58.15 
 
 		 410 aa  451  1e-125  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1266  proteasome-activating nucleotidase  54.98 
 
 		 404 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  51.8 
 
 		 413 aa  427  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  53.58 
 
 		 390 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  55.15 
 
 		 387 aa  403  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  53.87 
 
 		 389 aa  404  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  53.35 
 
 		 386 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  51.6 
 
 		 415 aa  394  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  52.79 
 
 		 408 aa  386  1e-106  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  52.11 
 
 		 429 aa  384  1e-105  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  51.06 
 
 		 404 aa  378  1e-104  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  54.6 
 
 		 407 aa  377  1e-103  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  51.08 
 
 		 407 aa  375  1e-103  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  51.08 
 
 		 407 aa  375  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  51.6 
 
 		 407 aa  375  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  48.28 
 
 		 412 aa  369  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  47.29 
 
 		 436 aa  369  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  48.4 
 
 		 412 aa  366  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  47.53 
 
 		 431 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  47.19 
 
 		 393 aa  353  2e-96  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  46.97 
 
 		 412 aa  353  2e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  46.88 
 
 		 426 aa  354  2e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  47.45 
 
 		 394 aa  350  3e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  47.98 
 
 		 379 aa  348  7e-95  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  47.57 
 
 		 422 aa  346  4e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  50.77 
 
 		 438 aa  345  8.999999999999999e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02213  proteasome regulatory particle subunit Rpt2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07050)  47.15 
 
 		 460 aa  335  7e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0288941 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  47.77 
 
 		 443 aa  335  1e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54032  26S protease regulatory subunit 4 homolog (TAT-binding homolog 5)  47.56 
 
 		 434 aa  332  1e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0833723 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  56.88 
 
 		 284 aa  331  1e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  44.03 
 
 		 402 aa  326  6e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  44.62 
 
 		 389 aa  323  3e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  45.36 
 
 		 389 aa  323  4e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  48.32 
 
 		 429 aa  321  9.999999999999999e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  54.68 
 
 		 425 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  44.57 
 
 		 464 aa  318  1e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  52.88 
 
 		 450 aa  315  6e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  43.09 
 
 		 417 aa  315  9e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  42.53 
 
 		 407 aa  311  1e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  42.86 
 
 		 414 aa  311  1e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  50.17 
 
 		 405 aa  310  2e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  47.52 
 
 		 446 aa  310  2e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564069 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  49.65 
 
 		 443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137848 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  44.29 
 
 		 422 aa  309  5e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30067  predicted protein  44.63 
 
 		 403 aa  308  1.0000000000000001e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  49.01 
 
 		 447 aa  307  2.0000000000000002e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9090  predicted protein  52.1 
 
 		 431 aa  306  5.0000000000000004e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  50.87 
 
 		 398 aa  305  9.000000000000001e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  47.56 
 
 		 465 aa  303  4.0000000000000003e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  41.62 
 
 		 400 aa  300  4e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  46.04 
 
 		 410 aa  299  6e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  48.95 
 
 		 427 aa  295  8e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  48.59 
 
 		 421 aa  293  4e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  46.88 
 
 		 393 aa  289  5.0000000000000004e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  47.2 
 
 		 416 aa  278  1e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.89 
 
 		 732 aa  269  8e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  57.21 
 
 		 718 aa  268  2e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.92 
 
 		 756 aa  265  1e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  53.14 
 
 		 754 aa  260  3e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.28 
 
 		 757 aa  258  1e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.19 
 
 		 808 aa  258  2e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.74 
 
 		 740 aa  257  2e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  53.59 
 
 		 742 aa  256  5e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.19 
 
 		 810 aa  256  5e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.73 
 
 		 769 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.74 
 
 		 743 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.91 
 
 		 727 aa  253  3e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.88 
 
 		 754 aa  253  3e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  53.16 
 
 		 742 aa  254  3e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.24 
 
 		 754 aa  253  3e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.97 
 
 		 768 aa  253  3e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.52 
 
 		 763 aa  253  4.0000000000000004e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.61 
 
 		 804 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.45 
 
 		 754 aa  253  6e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.2 
 
 		 738 aa  252  7e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  48.34 
 
 		 764 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.74 
 
 		 740 aa  252  8.000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  53.91 
 
 		 806 aa  252  9.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.71 
 
 		 731 aa  252  9.000000000000001e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.12 
 
 		 731 aa  252  9.000000000000001e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.06 
 
 		 735 aa  251  1e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.86 
 
 		 739 aa  251  1e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  51.42 
 
 		 739 aa  250  3e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  52.61 
 
 		 754 aa  249  4e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  47.1 
 
 		 722 aa  249  4e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  53.62 
 
 		 776 aa  249  5e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.37 
 
 		 760 aa  249  7e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.72 
 
 		 721 aa  249  8e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.31 
 
 		 730 aa  248  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.09 
 
 		 731 aa  248  1e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  50 
 
 		 763 aa  247  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>