More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_41778 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  100 
 
 		 284 aa  573  1.0000000000000001e-162  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  84.75 
 
 		 443 aa  493  9.999999999999999e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  80.92 
 
 		 438 aa  476  1e-133  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54032  26S protease regulatory subunit 4 homolog (TAT-binding homolog 5)  76.41 
 
 		 434 aa  446  1.0000000000000001e-124  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0833723 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02213  proteasome regulatory particle subunit Rpt2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07050)  74.39 
 
 		 460 aa  441  1e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0288941 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  58.58 
 
 		 402 aa  332  3e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  56.88 
 
 		 405 aa  331  6e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  55.02 
 
 		 404 aa  321  7e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  57.84 
 
 		 389 aa  320  9.999999999999999e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  55.84 
 
 		 389 aa  318  3.9999999999999996e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  56.73 
 
 		 404 aa  316  2e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  54.65 
 
 		 429 aa  314  8e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  53.16 
 
 		 403 aa  314  9.999999999999999e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  55.76 
 
 		 412 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  55.34 
 
 		 417 aa  312  2.9999999999999996e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  53.68 
 
 		 450 aa  311  5.999999999999999e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  54.74 
 
 		 407 aa  311  1e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  56.88 
 
 		 408 aa  309  4e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  54.14 
 
 		 446 aa  308  8e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564069 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  51.67 
 
 		 405 aa  307  1.0000000000000001e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  55.26 
 
 		 422 aa  306  2.0000000000000002e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  55.26 
 
 		 410 aa  306  2.0000000000000002e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  55.76 
 
 		 412 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  55.32 
 
 		 407 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  54.84 
 
 		 407 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  53.48 
 
 		 414 aa  306  3e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  57.99 
 
 		 398 aa  306  3e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  51.67 
 
 		 405 aa  306  4.0000000000000004e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  54.84 
 
 		 407 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  54.84 
 
 		 407 aa  305  6e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  52.04 
 
 		 387 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1266  proteasome-activating nucleotidase  54.24 
 
 		 404 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  53.36 
 
 		 393 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  54.28 
 
 		 436 aa  302  4.0000000000000003e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30067  predicted protein  57.89 
 
 		 403 aa  301  6.000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  52.43 
 
 		 422 aa  301  6.000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.592005 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  54.14 
 
 		 443 aa  301  7.000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  54.41 
 
 		 394 aa  299  3e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  53.53 
 
 		 412 aa  298  5e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  50.72 
 
 		 405 aa  298  9e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  48.76 
 
 		 413 aa  297  1e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  50.56 
 
 		 431 aa  296  2e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  49.81 
 
 		 386 aa  296  3e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  53.26 
 
 		 464 aa  295  6e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  50.56 
 
 		 390 aa  294  1e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  50 
 
 		 465 aa  292  3e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  51.1 
 
 		 447 aa  291  6e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  50.72 
 
 		 421 aa  291  8e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  51.7 
 
 		 407 aa  291  1e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  50.18 
 
 		 426 aa  291  1e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  49.82 
 
 		 393 aa  290  2e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  50.56 
 
 		 389 aa  290  2e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  51.1 
 
 		 415 aa  290  2e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  50.73 
 
 		 425 aa  290  2e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  50.93 
 
 		 406 aa  288  5.0000000000000004e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  49.45 
 
 		 379 aa  288  6e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  50.55 
 
 		 427 aa  287  1e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  49.07 
 
 		 410 aa  286  2e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  49.07 
 
 		 407 aa  285  4e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  49.82 
 
 		 400 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9090  predicted protein  50.9 
 
 		 431 aa  283  2.0000000000000002e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  48.94 
 
 		 429 aa  280  1e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  48.33 
 
 		 410 aa  278  1e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  48.73 
 
 		 416 aa  271  1e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.54 
 
 		 743 aa  236  4e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  49.79 
 
 		 740 aa  235  6e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.1 
 
 		 742 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.66 
 
 		 740 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.74 
 
 		 718 aa  232  6e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.59 
 
 		 732 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.66 
 
 		 742 aa  231  1e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.1 
 
 		 781 aa  229  6e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.56 
 
 		 781 aa  228  6e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.12 
 
 		 800 aa  228  8e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.17 
 
 		 739 aa  227  1e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.83 
 
 		 769 aa  227  2e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.56 
 
 		 768 aa  227  2e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.23 
 
 		 757 aa  226  3e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.23 
 
 		 784 aa  226  3e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  48.28 
 
 		 754 aa  224  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.33 
 
 		 727 aa  223  2e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45.57 
 
 		 754 aa  223  3e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.7 
 
 		 756 aa  223  4e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.79 
 
 		 754 aa  222  6e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  47.37 
 
 		 763 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  46.53 
 
 		 764 aa  219  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.98 
 
 		 719 aa  219  3e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.69 
 
 		 721 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.08 
 
 		 723 aa  218  7e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45.26 
 
 		 754 aa  218  1e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  46.52 
 
 		 722 aa  217  1e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.02 
 
 		 804 aa  217  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.14 
 
 		 738 aa  216  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  47.6 
 
 		 776 aa  217  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.25 
 
 		 715 aa  217  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.72 
 
 		 763 aa  217  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50 
 
 		 731 aa  217  2e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.57 
 
 		 731 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.21 
 
 		 754 aa  216  4e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.28 
 
 		 731 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>