More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_52887 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  79.7 
 
 		 465 aa  647    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  100 
 
 		 427 aa  865    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  68.18 
 
 		 464 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  69.27 
 
 		 425 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9090  predicted protein  63.33 
 
 		 431 aa  534  1e-150  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  45 
 
 		 436 aa  325  1e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  50.63 
 
 		 407 aa  323  3e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  50.32 
 
 		 407 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  45.41 
 
 		 412 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  50.32 
 
 		 407 aa  320  3e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  42.46 
 
 		 412 aa  316  6e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  49.37 
 
 		 407 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  43.15 
 
 		 379 aa  312  6.999999999999999e-84  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  42.23 
 
 		 443 aa  311  1e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  41.29 
 
 		 394 aa  310  2.9999999999999997e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  41.03 
 
 		 393 aa  309  5e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  42.7 
 
 		 412 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  48.12 
 
 		 410 aa  306  5.0000000000000004e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  48.81 
 
 		 410 aa  304  2.0000000000000002e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  46.86 
 
 		 438 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  41.29 
 
 		 431 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  48.72 
 
 		 450 aa  301  1e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  43.16 
 
 		 404 aa  301  1e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  46.69 
 
 		 408 aa  299  6e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  42.04 
 
 		 405 aa  299  7e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  50.53 
 
 		 407 aa  299  8e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  49.48 
 
 		 403 aa  298  2e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54032  26S protease regulatory subunit 4 homolog (TAT-binding homolog 5)  41.6 
 
 		 434 aa  296  3e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0833723 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02213  proteasome regulatory particle subunit Rpt2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07050)  41.69 
 
 		 460 aa  296  5e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0288941 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  48.63 
 
 		 402 aa  296  5e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  50 
 
 		 407 aa  295  9e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  48.95 
 
 		 405 aa  295  9e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  48.36 
 
 		 389 aa  294  2e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  47.47 
 
 		 405 aa  293  4e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  44 
 
 		 422 aa  293  4e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  36.91 
 
 		 389 aa  292  6e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  45.77 
 
 		 429 aa  292  7e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  47.64 
 
 		 446 aa  291  1e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564069 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  41.28 
 
 		 405 aa  291  2e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  48.24 
 
 		 443 aa  290  3e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  47.75 
 
 		 404 aa  290  3e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  37.53 
 
 		 414 aa  288  1e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  40.99 
 
 		 426 aa  288  1e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  50.55 
 
 		 284 aa  287  2e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  47.46 
 
 		 389 aa  288  2e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1266  proteasome-activating nucleotidase  47.6 
 
 		 404 aa  287  2e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  45.09 
 
 		 447 aa  287  2.9999999999999996e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  39.76 
 
 		 386 aa  286  4e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  48.08 
 
 		 407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  51.92 
 
 		 415 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  47.97 
 
 		 398 aa  282  8.000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  41.13 
 
 		 387 aa  281  1e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  42.94 
 
 		 390 aa  280  4e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  45.42 
 
 		 393 aa  279  6e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  44.92 
 
 		 400 aa  278  1e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  36.03 
 
 		 417 aa  278  1e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  41.43 
 
 		 410 aa  277  2e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  46.85 
 
 		 406 aa  276  6e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  37.8 
 
 		 422 aa  274  2.0000000000000002e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30067  predicted protein  47.28 
 
 		 403 aa  272  8.000000000000001e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  46.1 
 
 		 413 aa  268  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  46.62 
 
 		 421 aa  267  2.9999999999999995e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  44.77 
 
 		 416 aa  265  2e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  43 
 
 		 429 aa  259  8e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.7 
 
 		 650 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0690  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.61 
 
 		 631 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.827702  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2318  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.41 
 
 		 633 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0771513  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0665  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.41 
 
 		 633 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735845  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.54 
 
 		 608 aa  213  5.999999999999999e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0566  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.41 
 
 		 633 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  46.25 
 
 		 608 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  43.54 
 
 		 499 aa  212  7.999999999999999e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.49 
 
 		 740 aa  212  9e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.12 
 
 		 742 aa  212  1e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  42.75 
 
 		 742 aa  212  1e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1076  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.83 
 
 		 701 aa  211  2e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  42.38 
 
 		 743 aa  211  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.54 
 
 		 604 aa  211  2e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1034  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.64 
 
 		 510 aa  211  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.79 
 
 		 732 aa  211  3e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.14 
 
 		 633 aa  210  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  44.75 
 
 		 633 aa  210  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  44.75 
 
 		 633 aa  210  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  44.75 
 
 		 633 aa  210  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  44.75 
 
 		 633 aa  210  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.53 
 
 		 614 aa  210  4e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  44.75 
 
 		 633 aa  210  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  44.75 
 
 		 633 aa  210  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  44.75 
 
 		 633 aa  210  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.28 
 
 		 637 aa  210  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.698046  normal  0.908613 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.78 
 
 		 759 aa  210  5e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1115  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.17 
 
 		 638 aa  210  5e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48117  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2043  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.35 
 
 		 687 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000823852 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0353  peptidase M41, FtsH  41.88 
 
 		 575 aa  209  6e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.209104  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10341  cell division protein FtsH4  42.91 
 
 		 575 aa  209  6e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.194795  hitchhiker  0.000108584 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0232  hypothetical protein  47.35 
 
 		 691 aa  209  6e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.64 
 
 		 740 aa  209  7e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.02 
 
 		 714 aa  209  7e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1229  cell division protein  43.2 
 
 		 646 aa  209  9e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.22 
 
 		 601 aa  209  9e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>