More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_10341 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_10341  cell division protein FtsH4  100 
 
 
575 aa  1160    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.194795  hitchhiker  0.000108584 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0353  peptidase M41, FtsH  98.61 
 
 
575 aa  1150    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.209104  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14591  cell division protein FtsH4  54.9 
 
 
619 aa  644    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.584936 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1152  peptidase M41, FtsH  54.38 
 
 
599 aa  602  1.0000000000000001e-171  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1322  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.82 
 
 
598 aa  603  1.0000000000000001e-171  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.358408  normal  0.0936427 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09061  cell division protein FtsH4  52.52 
 
 
577 aa  599  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0625866  hitchhiker  0.0000226946 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10151  cell division protein FtsH4  50.98 
 
 
584 aa  567  1e-160  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.745337  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10141  cell division protein FtsH4  50.9 
 
 
584 aa  559  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0946  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.81 
 
 
584 aa  555  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0998  FtsH peptidase  48.58 
 
 
632 aa  554  1e-156  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.438302  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09311  cell division protein FtsH4  50.54 
 
 
584 aa  548  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.679797  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.64 
 
 
628 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.711705 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0614  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.11 
 
 
628 aa  508  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0630  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.11 
 
 
628 aa  508  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3190  FtsH peptidase  46.68 
 
 
628 aa  508  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0440312  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  46.05 
 
 
613 aa  507  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0942  FtsH peptidase  46.71 
 
 
630 aa  506  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4255  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.53 
 
 
632 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.91 
 
 
640 aa  502  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4594  FtsH peptidase  46.13 
 
 
628 aa  505  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.91 
 
 
640 aa  502  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3058  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.33 
 
 
628 aa  504  1e-141  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539417  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5220  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47 
 
 
631 aa  501  1e-140  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02481  cell division protein FtsH2  46.84 
 
 
602 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.37 
 
 
655 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3253  FtsH peptidase  46.99 
 
 
667 aa  495  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.586375  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2444  FtsH peptidase  50.41 
 
 
633 aa  492  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000343724  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  45.8 
 
 
617 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  44.56 
 
 
637 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0508625  hitchhiker  0.00322552 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.74 
 
 
616 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.74 
 
 
616 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1438  FtsH peptidase  43.77 
 
 
639 aa  489  1e-137  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.226378  normal  0.078862 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02581  cell division protein FtsH2  45.12 
 
 
619 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  45.01 
 
 
617 aa  488  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.05 
 
 
612 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3590  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.23 
 
 
631 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  45.45 
 
 
617 aa  488  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08041  FtsH ATP-dependent protease-like protein  43.89 
 
 
637 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0315531  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  46.28 
 
 
613 aa  482  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2043  peptidase M41, FtsH  45.73 
 
 
617 aa  482  1e-135  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0751  FtsH peptidase  43.94 
 
 
637 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08411  FtsH ATP-dependent protease-like protein  42.95 
 
 
637 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08031  FtsH ATP-dependent protease-like protein  43.37 
 
 
637 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.38 
 
 
616 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09651  FtsH ATP-dependent protease-like protein  44.44 
 
 
640 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.116112  normal  0.424003 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1061  peptidase M41, FtsH  43.94 
 
 
642 aa  481  1e-134  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498037  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0301  FtsH peptidase  45.55 
 
 
616 aa  480  1e-134  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23831  cell division protein FtsH2  45.34 
 
 
615 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0657792 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0293  FtsH peptidase  44.27 
 
 
640 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0357  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.82 
 
 
613 aa  477  1e-133  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0125367  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  52.5 
 
 
638 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3755  FtsH peptidase  45.47 
 
 
613 aa  478  1e-133  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1595  cell division protein FtsH2  45.1 
 
 
615 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.169685  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03061  cell division protein FtsH2  45.1 
 
 
615 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.45 
 
 
615 aa  458  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.74 
 
 
639 aa  456  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.94 
 
 
656 aa  450  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.68 
 
 
655 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1197  cell division protein FtsH  41.23 
 
 
649 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35099  predicted protein  43.33 
 
 
651 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.235498  decreased coverage  0.000591243 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1019  membrane protease FtsH catalytic subunit  41.4 
 
 
657 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000780208  hitchhiker  0.000608132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1084  membrane protease FtsH catalytic subunit  41.4 
 
 
657 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000445375  normal  0.0888545 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3568  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.62 
 
 
657 aa  445  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000520805  hitchhiker  0.00000681699 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  43.98 
 
 
638 aa  443  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  42.48 
 
 
647 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  48.16 
 
 
608 aa  444  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.35 
 
 
620 aa  442  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.97 
 
 
602 aa  444  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  41.77 
 
 
659 aa  445  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  43.61 
 
 
643 aa  443  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1000  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.28 
 
 
656 aa  445  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000544697  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29118  AAA-metalloprotease FtsH, chloroplast precursor  50 
 
 
632 aa  445  1e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0085  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.33 
 
 
619 aa  442  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0128077  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.32 
 
 
652 aa  443  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1023  membrane protease FtsH catalytic subunit  41.23 
 
 
657 aa  444  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000161981  hitchhiker  0.0000832625 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  41.8 
 
 
650 aa  442  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  42.3 
 
 
644 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.3 
 
 
647 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3288  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.93 
 
 
657 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000787677  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  42.12 
 
 
647 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3424  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.93 
 
 
657 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000853792  decreased coverage  0.000155742 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  42.3 
 
 
647 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  42.3 
 
 
647 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  42.3 
 
 
644 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.11 
 
 
643 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3246  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.93 
 
 
657 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000231825  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  42.3 
 
 
647 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2841  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.05 
 
 
657 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000356985  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.56 
 
 
640 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.43 
 
 
640 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  48.14 
 
 
645 aa  440  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3592  ATP-dependent metalloprotease  42.3 
 
 
647 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00319823  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  42.3 
 
 
644 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  42.3 
 
 
647 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000163816  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  42.3 
 
 
644 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.93 
 
 
640 aa  440  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.46 
 
 
611 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  41.26 
 
 
612 aa  440  9.999999999999999e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1121  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.93 
 
 
652 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000570756  unclonable  0.00000000000918847 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.59 
 
 
650 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000774852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>