More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0751 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_09651  FtsH ATP-dependent protease-like protein  80.51 
 
 
640 aa  1049    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.116112  normal  0.424003 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08031  FtsH ATP-dependent protease-like protein  97.01 
 
 
637 aa  1248    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3058  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.1 
 
 
628 aa  919    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539417  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.45 
 
 
628 aa  913    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.711705 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0630  ATP-dependent metalloprotease FtsH  71.28 
 
 
628 aa  891    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  81.32 
 
 
638 aa  1045    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0293  FtsH peptidase  80.35 
 
 
640 aa  1049    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08411  FtsH ATP-dependent protease-like protein  93.41 
 
 
637 aa  1223    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  54.15 
 
 
613 aa  640    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2444  FtsH peptidase  64.79 
 
 
633 aa  768    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000343724  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3190  FtsH peptidase  69.86 
 
 
628 aa  931    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0440312  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5220  ATP-dependent metalloprotease FtsH  66.72 
 
 
631 aa  778    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1061  peptidase M41, FtsH  77.88 
 
 
642 aa  998    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498037  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1438  FtsH peptidase  80.44 
 
 
639 aa  1057    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.226378  normal  0.078862 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08041  FtsH ATP-dependent protease-like protein  96.86 
 
 
637 aa  1250    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0315531  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  53.83 
 
 
617 aa  642    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0751  FtsH peptidase  100 
 
 
637 aa  1282    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  53.83 
 
 
613 aa  653    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0942  FtsH peptidase  70.96 
 
 
630 aa  941    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0998  FtsH peptidase  60.75 
 
 
632 aa  676    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.438302  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  53.59 
 
 
617 aa  644    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.2 
 
 
612 aa  642    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4255  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.91 
 
 
632 aa  912    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.71 
 
 
640 aa  751    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.59 
 
 
616 aa  645    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0614  ATP-dependent metalloprotease FtsH  71.28 
 
 
628 aa  891    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  79.72 
 
 
637 aa  1063    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0508625  hitchhiker  0.00322552 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.24 
 
 
655 aa  743    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29118  AAA-metalloprotease FtsH, chloroplast precursor  60.33 
 
 
632 aa  716    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.71 
 
 
640 aa  751    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3253  FtsH peptidase  59.7 
 
 
667 aa  688    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.586375  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3755  FtsH peptidase  54.24 
 
 
613 aa  642    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4594  FtsH peptidase  69.18 
 
 
628 aa  920    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02481  cell division protein FtsH2  56.54 
 
 
602 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3590  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.24 
 
 
631 aa  689    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  53.43 
 
 
617 aa  643    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0357  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.15 
 
 
613 aa  640    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0125367  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.77 
 
 
616 aa  632  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.77 
 
 
616 aa  632  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02581  cell division protein FtsH2  53.02 
 
 
619 aa  627  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2043  peptidase M41, FtsH  53.99 
 
 
617 aa  618  1e-176  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0301  FtsH peptidase  53.99 
 
 
616 aa  615  1e-175  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1595  cell division protein FtsH2  55.57 
 
 
615 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.169685  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23831  cell division protein FtsH2  56.87 
 
 
615 aa  605  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0657792 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03061  cell division protein FtsH2  55.57 
 
 
615 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14591  cell division protein FtsH4  53.28 
 
 
619 aa  593  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.584936 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35099  predicted protein  52.5 
 
 
651 aa  579  1e-164  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.235498  decreased coverage  0.000591243 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.12 
 
 
630 aa  575  1.0000000000000001e-162  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.34 
 
 
602 aa  572  1.0000000000000001e-162  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.28 
 
 
639 aa  568  1e-161  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1322  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.61 
 
 
598 aa  567  1e-160  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.358408  normal  0.0936427 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  49.2 
 
 
627 aa  567  1e-160  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.23 
 
 
651 aa  567  1e-160  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0253083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  48.43 
 
 
633 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  48.27 
 
 
633 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  48.43 
 
 
633 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  48.43 
 
 
633 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  48.43 
 
 
633 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1152  peptidase M41, FtsH  59.46 
 
 
599 aa  562  1.0000000000000001e-159  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  48.43 
 
 
633 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.21 
 
 
638 aa  564  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.06 
 
 
615 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  48.27 
 
 
633 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  48.43 
 
 
633 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.76 
 
 
635 aa  560  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.88 
 
 
632 aa  560  1e-158  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.82 
 
 
611 aa  558  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.32 
 
 
640 aa  558  1e-158  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  48.43 
 
 
633 aa  559  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.28 
 
 
656 aa  558  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  49.44 
 
 
616 aa  558  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.84 
 
 
651 aa  557  1e-157  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.72 
 
 
633 aa  555  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  46.86 
 
 
608 aa  548  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  47.92 
 
 
681 aa  550  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.35 
 
 
621 aa  550  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.6 
 
 
640 aa  546  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.68 
 
 
645 aa  547  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.25 
 
 
643 aa  548  1e-154  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  46.25 
 
 
638 aa  542  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.22 
 
 
637 aa  545  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  47.19 
 
 
693 aa  542  1e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  47 
 
 
665 aa  545  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.91 
 
 
640 aa  542  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.62 
 
 
637 aa  545  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.63 
 
 
640 aa  545  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.46 
 
 
639 aa  543  1e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.63 
 
 
657 aa  542  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.43 
 
 
642 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.65 
 
 
610 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  45.8 
 
 
641 aa  541  9.999999999999999e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.32 
 
 
610 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.3 
 
 
630 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.73 
 
 
620 aa  539  9.999999999999999e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.75 
 
 
642 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.58 
 
 
652 aa  540  9.999999999999999e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.75 
 
 
642 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.16 
 
 
640 aa  536  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17504  predicted protein  49.91 
 
 
673 aa  538  1e-151  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.82 
 
 
650 aa  538  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000774852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>