More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_09311 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0946  ATP-dependent metalloprotease FtsH  83.05 
 
 
584 aa  960    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10151  cell division protein FtsH4  83.05 
 
 
584 aa  983    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.745337  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09311  cell division protein FtsH4  100 
 
 
584 aa  1162    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.679797  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10141  cell division protein FtsH4  83.42 
 
 
584 aa  958    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09061  cell division protein FtsH4  55.58 
 
 
577 aa  623  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0625866  hitchhiker  0.0000226946 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14591  cell division protein FtsH4  51.33 
 
 
619 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.584936 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1322  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.61 
 
 
598 aa  594  1e-168  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.358408  normal  0.0936427 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1152  peptidase M41, FtsH  50.35 
 
 
599 aa  586  1e-166  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0998  FtsH peptidase  48.86 
 
 
632 aa  567  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.438302  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10341  cell division protein FtsH4  50.71 
 
 
575 aa  544  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.194795  hitchhiker  0.000108584 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0353  peptidase M41, FtsH  50.53 
 
 
575 aa  545  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.209104  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5220  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.78 
 
 
631 aa  535  1e-151  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.53 
 
 
640 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2444  FtsH peptidase  48 
 
 
633 aa  530  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000343724  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.53 
 
 
640 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3253  FtsH peptidase  47.92 
 
 
667 aa  527  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.586375  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0614  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.12 
 
 
628 aa  525  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0630  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.12 
 
 
628 aa  525  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4594  FtsH peptidase  47.4 
 
 
628 aa  521  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.8 
 
 
628 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.711705 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.96 
 
 
655 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3590  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.67 
 
 
631 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4255  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.33 
 
 
632 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3190  FtsH peptidase  45.33 
 
 
628 aa  507  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0440312  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0942  FtsH peptidase  44.58 
 
 
630 aa  507  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  46.32 
 
 
617 aa  505  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3058  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.58 
 
 
628 aa  504  1e-141  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539417  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0293  FtsH peptidase  53.65 
 
 
640 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  46.55 
 
 
617 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09651  FtsH ATP-dependent protease-like protein  53.86 
 
 
640 aa  504  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.116112  normal  0.424003 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  45.64 
 
 
617 aa  501  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08411  FtsH ATP-dependent protease-like protein  52.21 
 
 
637 aa  501  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02481  cell division protein FtsH2  45.5 
 
 
602 aa  501  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  45.66 
 
 
637 aa  501  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0508625  hitchhiker  0.00322552 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02581  cell division protein FtsH2  44.97 
 
 
619 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1438  FtsH peptidase  48.08 
 
 
639 aa  496  1e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.226378  normal  0.078862 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  44.99 
 
 
613 aa  498  1e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.3 
 
 
616 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1595  cell division protein FtsH2  45.39 
 
 
615 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.169685  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  51.8 
 
 
638 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.3 
 
 
616 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.96 
 
 
616 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03061  cell division protein FtsH2  45.39 
 
 
615 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  44.96 
 
 
613 aa  489  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0751  FtsH peptidase  50.51 
 
 
637 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08031  FtsH ATP-dependent protease-like protein  50.4 
 
 
637 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08041  FtsH ATP-dependent protease-like protein  50.2 
 
 
637 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0315531  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3755  FtsH peptidase  46.05 
 
 
613 aa  491  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23831  cell division protein FtsH2  45.07 
 
 
615 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0657792 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1061  peptidase M41, FtsH  50.2 
 
 
642 aa  485  1e-136  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498037  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0357  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.71 
 
 
613 aa  486  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0125367  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2043  peptidase M41, FtsH  44.27 
 
 
617 aa  483  1e-135  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0301  FtsH peptidase  44.27 
 
 
616 aa  483  1e-135  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35099  predicted protein  46.03 
 
 
651 aa  479  1e-134  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.235498  decreased coverage  0.000591243 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.58 
 
 
612 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.25 
 
 
602 aa  470  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17504  predicted protein  44.25 
 
 
673 aa  464  1e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.93 
 
 
627 aa  462  1e-129  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  44.5 
 
 
645 aa  463  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.7 
 
 
643 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.76 
 
 
615 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0983  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.91 
 
 
657 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000296667  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29118  AAA-metalloprotease FtsH, chloroplast precursor  49.89 
 
 
632 aa  459  9.999999999999999e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.32 
 
 
611 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.64 
 
 
647 aa  455  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  45.05 
 
 
614 aa  456  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.77 
 
 
655 aa  456  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  44.99 
 
 
647 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000163816  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  44.64 
 
 
647 aa  455  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  44.99 
 
 
647 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  44.95 
 
 
643 aa  456  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  44.64 
 
 
644 aa  455  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  44.64 
 
 
647 aa  455  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  44.7 
 
 
659 aa  457  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.91 
 
 
798 aa  456  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  44.82 
 
 
647 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3592  ATP-dependent metalloprotease  44.99 
 
 
647 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00319823  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0801  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.17 
 
 
651 aa  457  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000253513  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.52 
 
 
639 aa  457  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.74 
 
 
639 aa  458  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  44.99 
 
 
647 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  44.64 
 
 
644 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  44.68 
 
 
633 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1197  cell division protein FtsH  44.88 
 
 
649 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.08 
 
 
672 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3288  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.05 
 
 
657 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000787677  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3424  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.05 
 
 
657 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000853792  decreased coverage  0.000155742 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.59 
 
 
640 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  44.25 
 
 
649 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  44.64 
 
 
644 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 
620 aa  453  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1121  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.05 
 
 
652 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000570756  unclonable  0.00000000000918847 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  44.64 
 
 
644 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  44.5 
 
 
612 aa  454  1.0000000000000001e-126  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1019  membrane protease FtsH catalytic subunit  45.05 
 
 
657 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000780208  hitchhiker  0.000608132 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3568  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.62 
 
 
657 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000520805  hitchhiker  0.00000681699 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0592  cell division protein FtsH  44.71 
 
 
660 aa  455  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000468831  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.78 
 
 
621 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  51.92 
 
 
681 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.28 
 
 
635 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>