More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_17504 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_02481  cell division protein FtsH2  59.28 
 
 		 602 aa  686    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58 
 
 		 616 aa  645    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17504  predicted protein  100 
 
 		 673 aa  1370    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.5 
 
 		 616 aa  639    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.84 
 
 		 612 aa  644    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1595  cell division protein FtsH2  59.63 
 
 		 615 aa  664    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.169685  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  58.43 
 
 		 617 aa  680    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  59.11 
 
 		 613 aa  651    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2043  peptidase M41, FtsH  58.88 
 
 		 617 aa  656    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0301  FtsH peptidase  59.09 
 
 		 616 aa  658    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  58.6 
 
 		 617 aa  679    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  59.38 
 
 		 613 aa  664    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58 
 
 		 616 aa  645    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03061  cell division protein FtsH2  59.63 
 
 		 615 aa  664    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02581  cell division protein FtsH2  58.15 
 
 		 619 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0357  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.12 
 
 		 613 aa  653    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0125367  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23831  cell division protein FtsH2  58.6 
 
 		 615 aa  640    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0657792 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35099  predicted protein  56.35 
 
 		 651 aa  636    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.235498  decreased coverage  0.000591243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3755  FtsH peptidase  59.03 
 
 		 613 aa  645    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  57.98 
 
 		 617 aa  681    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4255  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.9 
 
 		 632 aa  585  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.95 
 
 		 628 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.711705 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3190  FtsH peptidase  52.63 
 
 		 628 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0440312  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0942  FtsH peptidase  52.17 
 
 		 630 aa  573  1.0000000000000001e-162  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3058  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.46 
 
 		 628 aa  572  1.0000000000000001e-162  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539417  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0630  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.78 
 
 		 628 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0614  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.78 
 
 		 628 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4594  FtsH peptidase  51.34 
 
 		 628 aa  572  1e-161  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0751  FtsH peptidase  50.43 
 
 		 637 aa  552  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08031  FtsH ATP-dependent protease-like protein  50.43 
 
 		 637 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08041  FtsH ATP-dependent protease-like protein  50.6 
 
 		 637 aa  551  1e-155  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0315531  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1438  FtsH peptidase  50.73 
 
 		 639 aa  551  1e-155  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.226378  normal  0.078862 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0998  FtsH peptidase  47.84 
 
 		 632 aa  551  1e-155  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.438302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08411  FtsH ATP-dependent protease-like protein  50.6 
 
 		 637 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  48.81 
 
 		 637 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0508625  hitchhiker  0.00322552 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.21 
 
 		 655 aa  548  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5220  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.42 
 
 		 631 aa  544  1e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09651  FtsH ATP-dependent protease-like protein  51.36 
 
 		 640 aa  542  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.116112  normal  0.424003 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0293  FtsH peptidase  51.36 
 
 		 640 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  51.03 
 
 		 647 aa  542  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  50.52 
 
 		 649 aa  542  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0801  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.86 
 
 		 651 aa  544  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000253513  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.74 
 
 		 615 aa  544  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.87 
 
 		 650 aa  542  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3612  ATP-dependent metalloprotease  51.55 
 
 		 644 aa  543  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000242003  normal  0.275176 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  50.69 
 
 		 644 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.69 
 
 		 647 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3592  ATP-dependent metalloprotease  50.52 
 
 		 647 aa  539  9.999999999999999e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000114537  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  50.69 
 
 		 647 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  50.69 
 
 		 647 aa  539  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3352  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.52 
 
 		 654 aa  541  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000888182  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2444  FtsH peptidase  48.11 
 
 		 633 aa  541  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000343724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  50.69 
 
 		 644 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  50.69 
 
 		 647 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  50.69 
 
 		 644 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.92 
 
 		 640 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.34 
 
 		 655 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  50.86 
 
 		 647 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3592  ATP-dependent metalloprotease  50.86 
 
 		 647 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00319823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  50.69 
 
 		 644 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  50.86 
 
 		 647 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000163816  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.48 
 
 		 637 aa  541  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.92 
 
 		 640 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  50.69 
 
 		 647 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3568  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.69 
 
 		 657 aa  536  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000520805  hitchhiker  0.00000681699 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  50.35 
 
 		 643 aa  538  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3985  ATP-dependent metalloprotease  50.17 
 
 		 647 aa  532  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000069949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29118  AAA-metalloprotease FtsH, chloroplast precursor  53.3 
 
 		 632 aa  535  1e-150  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  50.35 
 
 		 647 aa  534  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000470783  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3590  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.66 
 
 		 631 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  49.65 
 
 		 650 aa  533  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  50.35 
 
 		 644 aa  534  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000683259  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2841  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.52 
 
 		 657 aa  533  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000356985  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1197  cell division protein FtsH  50.17 
 
 		 649 aa  531  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0592  cell division protein FtsH  49.32 
 
 		 660 aa  528  1e-149  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000468831  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1121  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.17 
 
 		 652 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000570756  unclonable  0.00000000000918847 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.74 
 
 		 627 aa  529  1e-149  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3424  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.35 
 
 		 657 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000853792  decreased coverage  0.000155742 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  50.44 
 
 		 659 aa  531  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3288  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.35 
 
 		 657 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000787677  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  50.17 
 
 		 612 aa  531  1e-149  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1019  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.17 
 
 		 657 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000780208  hitchhiker  0.000608132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1084  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.17 
 
 		 657 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000445375  normal  0.0888545 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  51.3 
 
 		 639 aa  531  1e-149  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0983  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 		 657 aa  531  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000296667  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3246  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.35 
 
 		 657 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000231825  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  50.42 
 
 		 638 aa  529  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0703  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.09 
 
 		 650 aa  530  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0142787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  50.26 
 
 		 641 aa  525  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1061  peptidase M41, FtsH  50.77 
 
 		 642 aa  528  1e-148  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498037  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.66 
 
 		 676 aa  527  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.04 
 
 		 639 aa  525  1e-148  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1023  membrane protease FtsH catalytic subunit  50 
 
 		 657 aa  528  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000161981  hitchhiker  0.0000832625 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  48.31 
 
 		 616 aa  524  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.22 
 
 		 602 aa  522  1e-147  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3253  FtsH peptidase  55.67 
 
 		 667 aa  525  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.586375  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  49.22 
 
 		 638 aa  522  1e-146  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  49.57 
 
 		 660 aa  521  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000182706  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.61 
 
 		 650 aa  520  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000774852  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  49.66 
 
 		 665 aa  520  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>