More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_03061 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009363  OSTLU_35099  predicted protein  62.44 
 
 
651 aa  721    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.235498  decreased coverage  0.000591243 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02481  cell division protein FtsH2  86.21 
 
 
602 aa  1063    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0357  ATP-dependent metalloprotease FtsH  73.54 
 
 
613 aa  895    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0125367  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3058  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.32 
 
 
628 aa  674    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539417  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1595  cell division protein FtsH2  99.84 
 
 
615 aa  1238    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.169685  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  73.21 
 
 
613 aa  892    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3190  FtsH peptidase  57.39 
 
 
628 aa  677    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0440312  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.23 
 
 
628 aa  657    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.711705 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  73.33 
 
 
616 aa  882    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  83.44 
 
 
617 aa  1064    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2043  peptidase M41, FtsH  82.14 
 
 
617 aa  1000    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0301  FtsH peptidase  82.6 
 
 
616 aa  996    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  83.6 
 
 
617 aa  1065    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  75.45 
 
 
613 aa  954    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0942  FtsH peptidase  56.01 
 
 
630 aa  662    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17504  predicted protein  59.22 
 
 
673 aa  665    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5220  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.76 
 
 
631 aa  640    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.09 
 
 
615 aa  652    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23831  cell division protein FtsH2  84.55 
 
 
615 aa  986    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0657792 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0630  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.58 
 
 
628 aa  646    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  73.5 
 
 
612 aa  903    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  72.91 
 
 
616 aa  884    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03061  cell division protein FtsH2  100 
 
 
615 aa  1241    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4255  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.71 
 
 
632 aa  678    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  73.33 
 
 
616 aa  882    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3755  FtsH peptidase  73.16 
 
 
613 aa  893    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4594  FtsH peptidase  55.96 
 
 
628 aa  660    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02581  cell division protein FtsH2  82.85 
 
 
619 aa  1048    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0614  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.58 
 
 
628 aa  646    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  83.93 
 
 
617 aa  1066    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2444  FtsH peptidase  54.46 
 
 
633 aa  633  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000343724  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  54.14 
 
 
637 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0508625  hitchhiker  0.00322552 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.19 
 
 
602 aa  632  1e-180  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08031  FtsH ATP-dependent protease-like protein  52.72 
 
 
637 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1000  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.75 
 
 
656 aa  631  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000544697  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0983  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.1 
 
 
657 aa  629  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000296667  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1197  cell division protein FtsH  52.72 
 
 
649 aa  626  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1121  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.29 
 
 
652 aa  627  1e-178  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000570756  unclonable  0.00000000000918847 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2841  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.72 
 
 
657 aa  628  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000356985  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3288  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.55 
 
 
657 aa  627  1e-178  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000787677  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3246  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.55 
 
 
657 aa  627  1e-178  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000231825  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08041  FtsH ATP-dependent protease-like protein  52.56 
 
 
637 aa  627  1e-178  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0315531  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.69 
 
 
655 aa  627  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3424  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.55 
 
 
657 aa  627  1e-178  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000853792  decreased coverage  0.000155742 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0801  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.78 
 
 
651 aa  625  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000253513  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.59 
 
 
639 aa  621  1e-177  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0751  FtsH peptidase  52.56 
 
 
637 aa  623  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.61 
 
 
620 aa  621  1e-177  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  52.61 
 
 
659 aa  623  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.35 
 
 
650 aa  623  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000774852  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1019  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.72 
 
 
657 aa  625  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000780208  hitchhiker  0.000608132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1084  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.72 
 
 
657 aa  624  1e-177  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000445375  normal  0.0888545 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08411  FtsH ATP-dependent protease-like protein  52.55 
 
 
637 aa  624  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1023  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.55 
 
 
657 aa  623  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000161981  hitchhiker  0.0000832625 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  52.37 
 
 
647 aa  620  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000470783  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  52.63 
 
 
644 aa  620  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000683259  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  51.96 
 
 
647 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3568  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.12 
 
 
657 aa  618  1e-176  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000520805  hitchhiker  0.00000681699 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  52.2 
 
 
650 aa  619  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.63 
 
 
647 aa  615  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3612  ATP-dependent metalloprotease  52.55 
 
 
644 aa  616  1e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000242003  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  51.8 
 
 
647 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000163816  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  51.63 
 
 
647 aa  615  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0293  FtsH peptidase  53.09 
 
 
640 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.84 
 
 
657 aa  615  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09651  FtsH ATP-dependent protease-like protein  53.41 
 
 
640 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.116112  normal  0.424003 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1438  FtsH peptidase  55.83 
 
 
639 aa  616  1e-175  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.226378  normal  0.078862 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3985  ATP-dependent metalloprotease  52.2 
 
 
647 aa  618  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000069949  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0998  FtsH peptidase  54.79 
 
 
632 aa  617  1e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.438302  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  51.63 
 
 
647 aa  615  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  51.63 
 
 
647 aa  615  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3592  ATP-dependent metalloprotease  51.8 
 
 
647 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00319823  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  51.63 
 
 
647 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.8 
 
 
650 aa  615  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  51.8 
 
 
647 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  51.89 
 
 
644 aa  615  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3592  ATP-dependent metalloprotease  51.47 
 
 
647 aa  613  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000114537  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  51.64 
 
 
649 aa  612  9.999999999999999e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  51.89 
 
 
644 aa  615  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  51.99 
 
 
658 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  51.89 
 
 
644 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.03 
 
 
655 aa  614  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.67 
 
 
630 aa  615  9.999999999999999e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  51.56 
 
 
660 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000182706  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  51.89 
 
 
644 aa  615  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.02 
 
 
640 aa  609  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.65 
 
 
637 aa  608  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3352  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.47 
 
 
654 aa  610  1e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000888182  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.02 
 
 
640 aa  609  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  51.73 
 
 
643 aa  611  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  51.74 
 
 
638 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  51.38 
 
 
608 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  53.47 
 
 
645 aa  606  9.999999999999999e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  53.82 
 
 
638 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  50.65 
 
 
651 aa  605  9.999999999999999e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  51.76 
 
 
614 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  51.96 
 
 
633 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  51.96 
 
 
633 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  51.96 
 
 
633 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.37 
 
 
639 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>