More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0998 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_3058  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.54 
 
 
628 aa  728    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539417  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0630  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.72 
 
 
628 aa  699    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08041  FtsH ATP-dependent protease-like protein  60.89 
 
 
637 aa  679    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0315531  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4255  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.16 
 
 
632 aa  716    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.29 
 
 
628 aa  716    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.711705 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0293  FtsH peptidase  56.09 
 
 
640 aa  654    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  60.74 
 
 
638 aa  653    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08031  FtsH ATP-dependent protease-like protein  60.71 
 
 
637 aa  674    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2444  FtsH peptidase  61.69 
 
 
633 aa  741    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000343724  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3190  FtsH peptidase  61.87 
 
 
628 aa  738    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0440312  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3590  ATP-dependent metalloprotease FtsH  66.02 
 
 
631 aa  799    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1061  peptidase M41, FtsH  59.54 
 
 
642 aa  652    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498037  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1152  peptidase M41, FtsH  59.12 
 
 
599 aa  638    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08411  FtsH ATP-dependent protease-like protein  60.21 
 
 
637 aa  674    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1322  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.32 
 
 
598 aa  639    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.358408  normal  0.0936427 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1438  FtsH peptidase  62.32 
 
 
639 aa  685    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.226378  normal  0.078862 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0751  FtsH peptidase  60.75 
 
 
637 aa  676    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  56.01 
 
 
613 aa  637    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0942  FtsH peptidase  60.65 
 
 
630 aa  709    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0998  FtsH peptidase  100 
 
 
632 aa  1270    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.438302  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  57 
 
 
637 aa  666    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0508625  hitchhiker  0.00322552 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.82 
 
 
640 aa  731    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.53 
 
 
655 aa  723    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5220  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.4 
 
 
631 aa  738    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09651  FtsH ATP-dependent protease-like protein  59.68 
 
 
640 aa  653    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.116112  normal  0.424003 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3253  FtsH peptidase  69.78 
 
 
667 aa  827    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.586375  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4594  FtsH peptidase  60.62 
 
 
628 aa  717    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0614  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.72 
 
 
628 aa  699    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14591  cell division protein FtsH4  58.82 
 
 
619 aa  669    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.584936 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.82 
 
 
640 aa  731    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.81 
 
 
612 aa  632  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  55.35 
 
 
613 aa  625  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  54.47 
 
 
617 aa  625  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  54.3 
 
 
617 aa  625  1e-178  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3755  FtsH peptidase  58.02 
 
 
613 aa  625  1e-178  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0357  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.02 
 
 
613 aa  623  1e-177  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0125367  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  54.3 
 
 
617 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02581  cell division protein FtsH2  53.8 
 
 
619 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02481  cell division protein FtsH2  55.85 
 
 
602 aa  618  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.89 
 
 
616 aa  611  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2043  peptidase M41, FtsH  55.12 
 
 
617 aa  608  1e-173  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.89 
 
 
616 aa  611  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.19 
 
 
616 aa  609  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0301  FtsH peptidase  56.33 
 
 
616 aa  607  9.999999999999999e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23831  cell division protein FtsH2  56.82 
 
 
615 aa  606  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0657792 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1595  cell division protein FtsH2  54.79 
 
 
615 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.169685  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03061  cell division protein FtsH2  54.79 
 
 
615 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09061  cell division protein FtsH4  51.33 
 
 
577 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0625866  hitchhiker  0.0000226946 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10151  cell division protein FtsH4  48.68 
 
 
584 aa  569  1e-161  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.745337  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.21 
 
 
602 aa  563  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29118  AAA-metalloprotease FtsH, chloroplast precursor  52.13 
 
 
632 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09311  cell division protein FtsH4  48.76 
 
 
584 aa  562  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.679797  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10141  cell division protein FtsH4  48.57 
 
 
584 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.17 
 
 
630 aa  559  1e-158  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0946  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.1 
 
 
584 aa  561  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.43 
 
 
615 aa  557  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.26 
 
 
639 aa  553  1e-156  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  51.3 
 
 
616 aa  549  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.68 
 
 
639 aa  549  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  49.58 
 
 
633 aa  546  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  49.58 
 
 
633 aa  546  1e-154  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  49.58 
 
 
633 aa  546  1e-154  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0353  peptidase M41, FtsH  48.58 
 
 
575 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.209104  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  49.91 
 
 
633 aa  546  1e-154  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  49.58 
 
 
633 aa  546  1e-154  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  49.58 
 
 
633 aa  546  1e-154  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17504  predicted protein  47.84 
 
 
673 aa  545  1e-154  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  49.58 
 
 
633 aa  546  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  49.58 
 
 
633 aa  543  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35099  predicted protein  49.59 
 
 
651 aa  543  1e-153  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.235498  decreased coverage  0.000591243 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  50.09 
 
 
633 aa  544  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.91 
 
 
633 aa  542  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10341  cell division protein FtsH4  48.58 
 
 
575 aa  544  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.194795  hitchhiker  0.000108584 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.2 
 
 
656 aa  541  9.999999999999999e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.92 
 
 
632 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.21 
 
 
611 aa  538  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.24 
 
 
635 aa  537  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.24 
 
 
652 aa  538  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  48.14 
 
 
608 aa  535  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.31 
 
 
643 aa  534  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.3 
 
 
620 aa  534  1e-150  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.38 
 
 
653 aa  531  1e-149  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.73 
 
 
612 aa  528  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  53.88 
 
 
627 aa  530  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.43 
 
 
638 aa  530  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.38 
 
 
651 aa  529  1e-149  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0253083  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  47.83 
 
 
614 aa  528  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.84 
 
 
640 aa  527  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.53 
 
 
630 aa  526  1e-148  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.11 
 
 
651 aa  525  1e-148  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.91 
 
 
610 aa  528  1e-148  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.63 
 
 
612 aa  527  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.12 
 
 
637 aa  522  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.39 
 
 
614 aa  523  1e-147  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  47.38 
 
 
681 aa  523  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.35 
 
 
599 aa  523  1e-147  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.34 
 
 
657 aa  522  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.36 
 
 
610 aa  525  1e-147  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0085  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.91 
 
 
619 aa  524  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0128077  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.61 
 
 
642 aa  521  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>