More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0946 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0946  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 
584 aa  1163    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10151  cell division protein FtsH4  94.69 
 
 
584 aa  1104    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.745337  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09061  cell division protein FtsH4  57.19 
 
 
577 aa  636    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0625866  hitchhiker  0.0000226946 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10141  cell division protein FtsH4  94.18 
 
 
584 aa  1068    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09311  cell division protein FtsH4  83.05 
 
 
584 aa  959    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.679797  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14591  cell division protein FtsH4  52.76 
 
 
619 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.584936 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1322  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.46 
 
 
598 aa  609  1e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.358408  normal  0.0936427 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1152  peptidase M41, FtsH  51.07 
 
 
599 aa  589  1e-167  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0998  FtsH peptidase  49.2 
 
 
632 aa  567  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.438302  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0353  peptidase M41, FtsH  50.99 
 
 
575 aa  548  1e-155  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.209104  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10341  cell division protein FtsH4  50.99 
 
 
575 aa  547  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.194795  hitchhiker  0.000108584 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.57 
 
 
628 aa  531  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.711705 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3253  FtsH peptidase  47.25 
 
 
667 aa  530  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.586375  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.34 
 
 
640 aa  528  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.34 
 
 
640 aa  528  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5220  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.87 
 
 
631 aa  528  1e-148  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4594  FtsH peptidase  46.15 
 
 
628 aa  525  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3190  FtsH peptidase  45.3 
 
 
628 aa  519  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0440312  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4255  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.47 
 
 
632 aa  519  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2444  FtsH peptidase  47.06 
 
 
633 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000343724  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0614  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.98 
 
 
628 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0942  FtsH peptidase  44.41 
 
 
630 aa  512  1e-144  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0630  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.98 
 
 
628 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.18 
 
 
655 aa  515  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08411  FtsH ATP-dependent protease-like protein  46.61 
 
 
637 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3058  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.97 
 
 
628 aa  505  1e-141  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539417  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3590  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.28 
 
 
631 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1438  FtsH peptidase  45.13 
 
 
639 aa  501  1e-140  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.226378  normal  0.078862 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  45.3 
 
 
637 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0508625  hitchhiker  0.00322552 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08041  FtsH ATP-dependent protease-like protein  45.9 
 
 
637 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0315531  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08031  FtsH ATP-dependent protease-like protein  45.64 
 
 
637 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0293  FtsH peptidase  52.27 
 
 
640 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02481  cell division protein FtsH2  44.66 
 
 
602 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0751  FtsH peptidase  45.39 
 
 
637 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  45.08 
 
 
613 aa  489  1e-137  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09651  FtsH ATP-dependent protease-like protein  52.48 
 
 
640 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.116112  normal  0.424003 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  44.6 
 
 
638 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  44.19 
 
 
617 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  45.02 
 
 
617 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  44.64 
 
 
617 aa  488  1e-136  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1595  cell division protein FtsH2  44.99 
 
 
615 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.169685  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1061  peptidase M41, FtsH  44.79 
 
 
642 aa  485  1e-135  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498037  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02581  cell division protein FtsH2  44.68 
 
 
619 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03061  cell division protein FtsH2  44.99 
 
 
615 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.39 
 
 
616 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23831  cell division protein FtsH2  44.76 
 
 
615 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0657792 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.73 
 
 
616 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  44.58 
 
 
613 aa  476  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2043  peptidase M41, FtsH  44.48 
 
 
617 aa  476  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0301  FtsH peptidase  44.66 
 
 
616 aa  477  1e-133  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.73 
 
 
616 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.07 
 
 
655 aa  478  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.9 
 
 
612 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  44.83 
 
 
659 aa  476  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3755  FtsH peptidase  45.71 
 
 
613 aa  476  1e-133  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0357  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.44 
 
 
613 aa  473  1e-132  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0125367  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3568  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.9 
 
 
657 aa  473  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000520805  hitchhiker  0.00000681699 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  44.96 
 
 
650 aa  473  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.04 
 
 
610 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  45.38 
 
 
612 aa  469  1.0000000000000001e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.22 
 
 
610 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1197  cell division protein FtsH  44.05 
 
 
649 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  44.72 
 
 
647 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1019  membrane protease FtsH catalytic subunit  44.23 
 
 
657 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000780208  hitchhiker  0.000608132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1084  membrane protease FtsH catalytic subunit  44.23 
 
 
657 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000445375  normal  0.0888545 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0983  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.54 
 
 
657 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000296667  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.27 
 
 
640 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1023  membrane protease FtsH catalytic subunit  44.23 
 
 
657 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000161981  hitchhiker  0.0000832625 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17504  predicted protein  44.5 
 
 
673 aa  466  9.999999999999999e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  44.37 
 
 
644 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.37 
 
 
647 aa  462  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3288  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.83 
 
 
657 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000787677  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  44.37 
 
 
644 aa  462  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3246  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.83 
 
 
657 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000231825  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.09 
 
 
642 aa  462  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  44.54 
 
 
647 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.44 
 
 
640 aa  464  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.27 
 
 
642 aa  463  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2841  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.52 
 
 
657 aa  462  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000356985  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35099  predicted protein  44.5 
 
 
651 aa  462  1e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.235498  decreased coverage  0.000591243 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.27 
 
 
642 aa  463  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1000  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.54 
 
 
656 aa  463  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000544697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  44.37 
 
 
644 aa  462  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  44.72 
 
 
647 aa  465  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000163816  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3424  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.83 
 
 
657 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000853792  decreased coverage  0.000155742 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  44.37 
 
 
647 aa  462  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  44.37 
 
 
647 aa  462  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  44.37 
 
 
647 aa  462  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0801  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.37 
 
 
651 aa  465  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000253513  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3592  ATP-dependent metalloprotease  44.72 
 
 
647 aa  465  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00319823  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  44.37 
 
 
644 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  44.72 
 
 
647 aa  465  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.72 
 
 
650 aa  462  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1121  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.52 
 
 
652 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000570756  unclonable  0.00000000000918847 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3612  ATP-dependent metalloprotease  44.72 
 
 
644 aa  464  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000242003  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  44.76 
 
 
614 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.95 
 
 
672 aa  460  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  44.54 
 
 
644 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000683259  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 
614 aa  459  9.999999999999999e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  44.54 
 
 
649 aa  460  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>