More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_333 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  99 
 
 
608 aa  1001    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  97.19 
 
 
604 aa  985    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62 
 
 
639 aa  635    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.12 
 
 
643 aa  707    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  100 
 
 
499 aa  1005    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.92 
 
 
651 aa  634  1e-180  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0253083  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.58 
 
 
615 aa  628  1e-179  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.58 
 
 
656 aa  628  1e-179  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.69 
 
 
653 aa  622  1e-177  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.17 
 
 
638 aa  622  1e-177  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.95 
 
 
640 aa  623  1e-177  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.29 
 
 
607 aa  617  1e-175  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  61.88 
 
 
656 aa  614  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.59 
 
 
602 aa  612  9.999999999999999e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.76 
 
 
657 aa  608  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  59.67 
 
 
637 aa  611  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  61.84 
 
 
654 aa  609  1e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.53 
 
 
620 aa  606  9.999999999999999e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.49 
 
 
672 aa  605  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  60.43 
 
 
627 aa  606  9.999999999999999e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.08 
 
 
635 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.74 
 
 
608 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  57.92 
 
 
614 aa  601  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.85 
 
 
753 aa  600  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  57.8 
 
 
608 aa  600  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.13 
 
 
679 aa  599  1e-170  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.66 
 
 
632 aa  598  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60 
 
 
611 aa  599  1e-170  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.69 
 
 
651 aa  600  1e-170  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  60.17 
 
 
633 aa  595  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.03 
 
 
639 aa  595  1e-169  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  59.96 
 
 
633 aa  595  1e-169  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  59.96 
 
 
633 aa  595  1e-169  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  59.96 
 
 
633 aa  595  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  58.94 
 
 
616 aa  598  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  59.96 
 
 
633 aa  595  1e-169  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  57.79 
 
 
759 aa  597  1e-169  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  59.96 
 
 
633 aa  596  1e-169  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  59.96 
 
 
633 aa  595  1e-169  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.25 
 
 
630 aa  595  1e-169  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.49 
 
 
621 aa  594  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  59.96 
 
 
633 aa  595  1e-169  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.38 
 
 
633 aa  594  1e-168  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  59.45 
 
 
682 aa  592  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  59.96 
 
 
633 aa  593  1e-168  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  58.52 
 
 
665 aa  592  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  61.6 
 
 
753 aa  594  1e-168  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.84 
 
 
685 aa  591  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.259213 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.57 
 
 
652 aa  593  1e-168  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0627  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.9 
 
 
682 aa  588  1e-167  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0250398  normal  0.798069 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.31 
 
 
676 aa  590  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.91 
 
 
599 aa  589  1e-167  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.29 
 
 
743 aa  588  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1784  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.26 
 
 
660 aa  586  1e-166  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0518301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.25 
 
 
672 aa  586  1e-166  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0085  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.79 
 
 
619 aa  586  1e-166  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0128077  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.54 
 
 
697 aa  585  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.54 
 
 
697 aa  585  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.37 
 
 
798 aa  585  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.31 
 
 
612 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.9 
 
 
669 aa  581  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.09 
 
 
614 aa  582  1.0000000000000001e-165  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.17 
 
 
610 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1990  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.55 
 
 
659 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.144891  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.11 
 
 
612 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  61.46 
 
 
645 aa  582  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  56.59 
 
 
673 aa  582  1.0000000000000001e-165  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.37 
 
 
656 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32090  membrane protease FtsH catalytic subunit  56.65 
 
 
684 aa  580  1e-164  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0358  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.16 
 
 
652 aa  578  1e-164  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0391  peptidase M41, FtsH  58.37 
 
 
662 aa  580  1e-164  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0150338  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02030  membrane protease FtsH catalytic subunit  56.24 
 
 
783 aa  578  1e-164  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000829689  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.06 
 
 
601 aa  579  1e-164  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.06 
 
 
601 aa  580  1e-164  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.46 
 
 
617 aa  578  1e-164  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.77 
 
 
610 aa  579  1e-164  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0426  FtsH peptidase  57.52 
 
 
652 aa  578  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.405966  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.53 
 
 
781 aa  580  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00418248 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.8 
 
 
630 aa  579  1e-164  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  56.43 
 
 
700 aa  576  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0616  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.34 
 
 
662 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2987  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.44 
 
 
669 aa  576  1.0000000000000001e-163  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.832035  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1416  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.14 
 
 
794 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0495193  normal  0.256654 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  58.28 
 
 
693 aa  575  1.0000000000000001e-163  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.69 
 
 
671 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.066161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0835  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.67 
 
 
671 aa  576  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0343776  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2896  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.43 
 
 
750 aa  575  1.0000000000000001e-163  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0642  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.49 
 
 
616 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.1 
 
 
637 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.06 
 
 
635 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.4 
 
 
687 aa  576  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.62 
 
 
637 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.77 
 
 
671 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.56 
 
 
684 aa  572  1.0000000000000001e-162  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.59 
 
 
643 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13642  cell division protein ftsH (membrane-bound protease)  59.2 
 
 
760 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052338 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0151  Mername-AA223 peptidase  56.2 
 
 
689 aa  573  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0538  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.85 
 
 
659 aa  573  1.0000000000000001e-162  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673684  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  56.45 
 
 
649 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.35 
 
 
630 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>