More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0690 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  56.27 
 
 		 644 aa  664    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.27 
 
 		 647 aa  664    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.94 
 
 		 641 aa  720    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  55.41 
 
 		 650 aa  645    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.93 
 
 		 640 aa  736    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  56.32 
 
 		 614 aa  680    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4718  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.28 
 
 		 637 aa  636    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518421  normal  0.0121069 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  52.9 
 
 		 658 aa  636    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  55.39 
 
 		 638 aa  665    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  52.88 
 
 		 644 aa  659    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000683259  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.32 
 
 		 638 aa  733    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2841  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.2 
 
 		 657 aa  640    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000356985  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3452  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.68 
 
 		 660 aa  641    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380893  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  60.59 
 
 		 644 aa  752    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1197  cell division protein FtsH  55.37 
 
 		 649 aa  642    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3985  ATP-dependent metalloprotease  52.72 
 
 		 647 aa  656    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000069949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1440  cell division protein  56.78 
 
 		 650 aa  643    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  52.52 
 
 		 651 aa  638    Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.57 
 
 		 655 aa  652    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  53.47 
 
 		 643 aa  664    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.91 
 
 		 642 aa  741    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  54.5 
 
 		 647 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.91 
 
 		 642 aa  739    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4584  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.28 
 
 		 634 aa  635    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  54.56 
 
 		 626 aa  646    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0566  ATP-dependent metalloprotease FtsH  82.85 
 
 		 633 aa  1025    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  54.42 
 
 		 641 aa  639    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  56.27 
 
 		 647 aa  664    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0879  FtsH peptidase  55.18 
 
 		 611 aa  662    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1133  membrane protease FtsH catalytic subunit  56.66 
 
 		 630 aa  656    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0177636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  60.23 
 
 		 640 aa  724    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  57.71 
 
 		 764 aa  740    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.52 
 
 		 640 aa  716    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  53.47 
 
 		 641 aa  649    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3568  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.57 
 
 		 657 aa  642    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000520805  hitchhiker  0.00000681699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0665  membrane protease FtsH catalytic subunit  83.33 
 
 		 633 aa  1030    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735845  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  56.19 
 
 		 616 aa  656    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.52 
 
 		 640 aa  640    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.13 
 
 		 640 aa  737    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.23 
 
 		 652 aa  712    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  56.27 
 
 		 644 aa  664    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  52.88 
 
 		 647 aa  659    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000470783  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  53.57 
 
 		 639 aa  651    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  54.72 
 
 		 608 aa  682    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0690  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 		 631 aa  1274    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.827702  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  53.93 
 
 		 665 aa  669    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0812  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.92 
 
 		 651 aa  635    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0310743  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3612  ATP-dependent metalloprotease  54.82 
 
 		 644 aa  662    Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000242003  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2318  ATP-dependent metalloprotease FtsH  83.33 
 
 		 633 aa  1030    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0771513  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3592  ATP-dependent metalloprotease  54.5 
 
 		 647 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00319823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.1 
 
 		 626 aa  694    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.765362 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.54 
 
 		 621 aa  657    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.69 
 
 		 640 aa  739    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  54.66 
 
 		 647 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1506  ATP-dependent metallopeptidase HflB  56.78 
 
 		 647 aa  645    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  55.88 
 
 		 659 aa  650    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.99 
 
 		 656 aa  683    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.16 
 
 		 638 aa  733    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0076  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.77 
 
 		 644 aa  685    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.597348  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.48 
 
 		 636 aa  671    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1098  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.39 
 
 		 610 aa  653    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0627303  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0979  FtsH peptidase  77.8 
 
 		 641 aa  932    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0714  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.96 
 
 		 634 aa  635    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.87442  normal  0.0617842 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.88 
 
 		 645 aa  739    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.5 
 
 		 638 aa  723    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  53.43 
 
 		 631 aa  661    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1023  membrane protease FtsH catalytic subunit  55.03 
 
 		 657 aa  640    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000161981  hitchhiker  0.0000832625 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.06 
 
 		 640 aa  738    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1262  FtsH peptidase  52.79 
 
 		 629 aa  636    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0366  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.78 
 
 		 641 aa  726    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.444728  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1000  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.57 
 
 		 656 aa  645    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000544697  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.99 
 
 		 638 aa  726    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3288  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.61 
 
 		 657 aa  641    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000787677  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.36 
 
 		 638 aa  730    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  61.12 
 
 		 649 aa  754    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.37 
 
 		 634 aa  635    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.36 
 
 		 627 aa  650    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  56.27 
 
 		 647 aa  664    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  78.81 
 
 		 637 aa  947    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.698046  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.39 
 
 		 647 aa  696    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3592  ATP-dependent metalloprotease  56.1 
 
 		 647 aa  662    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000114537  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  56.27 
 
 		 647 aa  664    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6874  cell division protein FtsH  63.1 
 
 		 638 aa  747    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0972491 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1223  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.47 
 
 		 651 aa  741    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.514183  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  60.62 
 
 		 645 aa  757    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.87 
 
 		 650 aa  640    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000774852  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1115  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.61 
 
 		 638 aa  889    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48117  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  56.15 
 
 		 612 aa  655    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3246  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.61 
 
 		 657 aa  641    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000231825  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1019  membrane protease FtsH catalytic subunit  55.37 
 
 		 657 aa  643    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000780208  hitchhiker  0.000608132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1084  membrane protease FtsH catalytic subunit  55.37 
 
 		 657 aa  643    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000445375  normal  0.0888545 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  54.74 
 
 		 639 aa  646    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0983  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.39 
 
 		 657 aa  658    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000296667  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  54.5 
 
 		 640 aa  644    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2412  membrane protease FtsH catalytic subunit  60.25 
 
 		 628 aa  699    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.278023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4719  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.44 
 
 		 634 aa  637    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3424  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.61 
 
 		 657 aa  641    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000853792  decreased coverage  0.000155742 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.34 
 
 		 652 aa  662    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.68 
 
 		 617 aa  642    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  56.26 
 
 		 673 aa  672    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>