More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0812 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  67 
 
 		 644 aa  835    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  66.94 
 
 		 647 aa  837    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.85 
 
 		 621 aa  703    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1770  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.21 
 
 		 651 aa  833    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.292571  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  59.97 
 
 		 614 aa  731    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4718  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.83 
 
 		 637 aa  871    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518421  normal  0.0121069 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  62.1 
 
 		 640 aa  775    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  70.88 
 
 		 638 aa  919    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  57.02 
 
 		 652 aa  697    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1526  ATP-dependent zinc metallopeptidase  57.92 
 
 		 628 aa  716    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0580  cell division protein FtsH  57.99 
 
 		 628 aa  724    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.51431  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3452  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.34 
 
 		 660 aa  829    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380893  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0811  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.09 
 
 		 663 aa  817    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.569146  hitchhiker  0.0043584 
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  60.03 
 
 		 644 aa  702    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1197  cell division protein FtsH  66.29 
 
 		 649 aa  830    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4497  cell division protein FtsH  67.46 
 
 		 634 aa  856    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.554573  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0571  cell division protein FtsH  57.99 
 
 		 628 aa  724    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1512  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.99 
 
 		 628 aa  724    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0580139  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.99 
 
 		 628 aa  724    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427373  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0777  cell division protein FtsH  57.99 
 
 		 628 aa  724    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2842  cell division protease ftsH  66.72 
 
 		 639 aa  819    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2711  cell division protease ftsH  66.72 
 
 		 639 aa  819    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4187  peptidase M41, FtsH  67.93 
 
 		 634 aa  855    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000128423  normal  0.66671 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1738  membrane protease FtsH catalytic subunit  62.03 
 
 		 628 aa  681    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83044  normal  0.291569 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  62.1 
 
 		 626 aa  778    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  65.18 
 
 		 647 aa  833    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  64.25 
 
 		 650 aa  828    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3615  membrane protease FtsH catalytic subunit  67.89 
 
 		 640 aa  854    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0280177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2170  peptidase M41, FtsH  58.91 
 
 		 627 aa  728    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415072  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0879  FtsH peptidase  52.92 
 
 		 611 aa  651    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1133  membrane protease FtsH catalytic subunit  62.98 
 
 		 630 aa  762    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0177636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  60.1 
 
 		 640 aa  703    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.72 
 
 		 655 aa  760    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1615  cell division protein FtsH  57.99 
 
 		 628 aa  724    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24975  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  70.84 
 
 		 641 aa  886    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0772  membrane protease FtsH catalytic subunit  70.11 
 
 		 635 aa  857    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000087079  normal  0.0618887 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0665  membrane protease FtsH catalytic subunit  53.52 
 
 		 633 aa  647    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735845  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  55.92 
 
 		 616 aa  697    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1288  cell division protein FtsH  57.99 
 
 		 628 aa  724    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.725972  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4439  FtsH peptidase  58.15 
 
 		 632 aa  726    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2841  ATP-dependent metalloprotease FtsH  66.72 
 
 		 657 aa  833    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000356985  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  55.1 
 
 		 764 aa  691    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3612  ATP-dependent metalloprotease  64.74 
 
 		 644 aa  838    Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000242003  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  61.39 
 
 		 641 aa  772    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  57.96 
 
 		 608 aa  714    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.4 
 
 		 656 aa  695    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  57.93 
 
 		 665 aa  701    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0812  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 		 651 aa  1335    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0310743  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6874  cell division protein FtsH  58.62 
 
 		 638 aa  692    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0972491 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  65.84 
 
 		 651 aa  840    Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0366  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60 
 
 		 641 aa  710    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.444728  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0483  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.7 
 
 		 631 aa  778    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000161272  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.15 
 
 		 640 aa  737    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  61.23 
 
 		 639 aa  773    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2776  cell division protein FtsH  57.83 
 
 		 628 aa  724    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182791  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4584  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.73 
 
 		 634 aa  867    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.17 
 
 		 638 aa  713    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0076  membrane protease FtsH catalytic subunit  57.96 
 
 		 644 aa  682    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.597348  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.6 
 
 		 636 aa  692    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1098  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.59 
 
 		 610 aa  650    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0627303  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0535  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.97 
 
 		 627 aa  677    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000788844  unclonable  0.00000000175333 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.81 
 
 		 639 aa  762    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2720  membrane protease FtsH catalytic subunit  61.93 
 
 		 641 aa  740    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.83 
 
 		 638 aa  709    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  64.4 
 
 		 631 aa  793    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  61.71 
 
 		 640 aa  767    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1262  FtsH peptidase  56.23 
 
 		 629 aa  725    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1000  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.83 
 
 		 656 aa  830    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000544697  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.83 
 
 		 638 aa  705    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.71 
 
 		 655 aa  802    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.312439  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.63 
 
 		 638 aa  715    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2020  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.03 
 
 		 628 aa  681    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.185769 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2188  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.75 
 
 		 649 aa  726    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350229  normal  0.438236 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.45 
 
 		 627 aa  811    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  54.49 
 
 		 637 aa  649    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.11 
 
 		 637 aa  635    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.698046  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.83 
 
 		 647 aa  672    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0816  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.88 
 
 		 627 aa  719    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1013  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.33 
 
 		 621 aa  711    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.86 
 
 		 617 aa  691    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1571  ATP-dependent metalloprotease FtsH  65.74 
 
 		 656 aa  832    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000144806  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.48 
 
 		 645 aa  727    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  66.61 
 
 		 655 aa  826    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1023  membrane protease FtsH catalytic subunit  66.56 
 
 		 657 aa  833    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000161981  hitchhiker  0.0000832625 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  60.2 
 
 		 649 aa  704    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  64.98 
 
 		 612 aa  813    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2318  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.52 
 
 		 633 aa  647    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0771513  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0566  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.21 
 
 		 633 aa  642    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1019  membrane protease FtsH catalytic subunit  66.19 
 
 		 657 aa  834    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000780208  hitchhiker  0.000608132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1084  membrane protease FtsH catalytic subunit  66.19 
 
 		 657 aa  833    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000445375  normal  0.0888545 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  67.9 
 
 		 639 aa  861    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0983  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.93 
 
 		 657 aa  847    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000296667  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3246  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.09 
 
 		 657 aa  840    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000231825  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2412  membrane protease FtsH catalytic subunit  55.43 
 
 		 628 aa  659    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.278023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1174  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.06 
 
 		 631 aa  724    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.378107  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62860  cell division protein FtsH  70 
 
 		 639 aa  853    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  56.48 
 
 		 673 aa  742    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1297  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.83 
 
 		 631 aa  724    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17526  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.57 
 
 		 652 aa  682    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.33 
 
 		 642 aa  762    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>