More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0566 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  56.13 
 
 
644 aa  667    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.13 
 
 
647 aa  667    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.2 
 
 
641 aa  727    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55 
 
 
647 aa  642    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  57.43 
 
 
614 aa  692    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4718  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.28 
 
 
637 aa  649    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518421  normal  0.0121069 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3424  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.42 
 
 
657 aa  655    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000853792  decreased coverage  0.000155742 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  55.25 
 
 
638 aa  671    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3288  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.42 
 
 
657 aa  655    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000787677  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1526  ATP-dependent zinc metallopeptidase  54.24 
 
 
628 aa  642    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155575  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  53.6 
 
 
651 aa  658    Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3452  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.91 
 
 
660 aa  645    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380893  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  60.66 
 
 
644 aa  748    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1197  cell division protein FtsH  55.91 
 
 
649 aa  652    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4497  cell division protein FtsH  53.27 
 
 
634 aa  641    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.554573  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0566  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 
633 aa  1278    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3612  ATP-dependent metalloprotease  54.47 
 
 
644 aa  660    Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000242003  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2841  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.32 
 
 
657 aa  654    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000356985  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  53.5 
 
 
659 aa  656    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2842  cell division protease ftsH  54.55 
 
 
639 aa  636    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2711  cell division protease ftsH  54.55 
 
 
639 aa  636    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4187  peptidase M41, FtsH  53.11 
 
 
634 aa  640    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000128423  normal  0.66671 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4584  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.28 
 
 
634 aa  649    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794949  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  55.31 
 
 
626 aa  661    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2318  ATP-dependent metalloprotease FtsH  98.74 
 
 
633 aa  1266    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0771513  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  55.57 
 
 
650 aa  647    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2170  peptidase M41, FtsH  53.8 
 
 
627 aa  645    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415072  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0879  FtsH peptidase  53.45 
 
 
611 aa  651    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1133  membrane protease FtsH catalytic subunit  56.66 
 
 
630 aa  663    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0177636  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  59.84 
 
 
640 aa  717    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  53.88 
 
 
639 aa  645    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1440  cell division protein  54.33 
 
 
650 aa  650    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  53.62 
 
 
641 aa  659    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0772  membrane protease FtsH catalytic subunit  53.91 
 
 
635 aa  643    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000087079  normal  0.0618887 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0665  membrane protease FtsH catalytic subunit  98.74 
 
 
633 aa  1266    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735845  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  55.3 
 
 
616 aa  659    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  53.15 
 
 
640 aa  636    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  56.13 
 
 
647 aa  667    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0811  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.73 
 
 
663 aa  654    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.569146  hitchhiker  0.0043584 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  61.1 
 
 
649 aa  751    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.28 
 
 
655 aa  659    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  56.93 
 
 
608 aa  698    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  55.18 
 
 
665 aa  673    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0812  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.05 
 
 
651 aa  645    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0310743  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3615  membrane protease FtsH catalytic subunit  53 
 
 
640 aa  637    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0280177  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1223  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.76 
 
 
651 aa  749    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.514183  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1013  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.55 
 
 
621 aa  637    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.34 
 
 
626 aa  707    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.765362 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  59.5 
 
 
640 aa  747    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1770  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.73 
 
 
651 aa  636    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.292571  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1506  ATP-dependent metallopeptidase HflB  54.17 
 
 
647 aa  652    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5471  cell division protein FtsH  57 
 
 
642 aa  650    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0690  ATP-dependent metalloprotease FtsH  82.98 
 
 
631 aa  1026    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.827702  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.07 
 
 
638 aa  726    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0076  membrane protease FtsH catalytic subunit  59.35 
 
 
644 aa  696    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.597348  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.75 
 
 
636 aa  665    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1098  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.43 
 
 
610 aa  651    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0627303  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0979  FtsH peptidase  79.18 
 
 
641 aa  934    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.44 
 
 
642 aa  757    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.01 
 
 
645 aa  743    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.67 
 
 
638 aa  719    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  53.04 
 
 
631 aa  666    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.39 
 
 
640 aa  718    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  56.13 
 
 
644 aa  667    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.02 
 
 
656 aa  671    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1000  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.4 
 
 
656 aa  663    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000544697  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.07 
 
 
638 aa  721    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4719  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.27 
 
 
634 aa  652    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.01 
 
 
638 aa  714    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  59.52 
 
 
652 aa  727    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2188  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.56 
 
 
649 aa  647    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350229  normal  0.438236 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.51 
 
 
627 aa  651    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  55.93 
 
 
647 aa  662    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000470783  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  79.15 
 
 
637 aa  951    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.698046  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.97 
 
 
647 aa  717    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  56.13 
 
 
647 aa  667    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6874  cell division protein FtsH  60.89 
 
 
638 aa  726    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0972491 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0366  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.99 
 
 
641 aa  717    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.444728  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1571  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.65 
 
 
656 aa  644    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000144806  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  60.47 
 
 
645 aa  754    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1115  ATP-dependent metalloprotease FtsH  73.5 
 
 
638 aa  919    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48117  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3246  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.42 
 
 
657 aa  655    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000231825  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  55.98 
 
 
612 aa  664    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  58.75 
 
 
764 aa  759    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1019  membrane protease FtsH catalytic subunit  56.25 
 
 
657 aa  653    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000780208  hitchhiker  0.000608132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1084  membrane protease FtsH catalytic subunit  56.25 
 
 
657 aa  653    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000445375  normal  0.0888545 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  54.19 
 
 
639 aa  659    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0983  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.91 
 
 
657 aa  663    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000296667  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2412  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.32 
 
 
628 aa  685    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.278023  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  53.25 
 
 
643 aa  662    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62860  cell division protein FtsH  57 
 
 
639 aa  650    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.97 
 
 
617 aa  647    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.57 
 
 
650 aa  657    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000774852  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.83 
 
 
652 aa  659    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  53.28 
 
 
658 aa  661    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  56.1 
 
 
673 aa  677    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1023  membrane protease FtsH catalytic subunit  54.52 
 
 
657 aa  651    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000161981  hitchhiker  0.0000832625 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3985  ATP-dependent metalloprotease  55.76 
 
 
647 aa  660    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000069949  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.52 
 
 
621 aa  662    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  55.93 
 
 
644 aa  662    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000683259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>