More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2301 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  100 
 
 		 415 aa  834    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  68.52 
 
 		 413 aa  584  1e-166  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1266  proteasome-activating nucleotidase  61.31 
 
 		 404 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  54.31 
 
 		 389 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  51.6 
 
 		 405 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  50.13 
 
 		 405 aa  404  1e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  52.25 
 
 		 387 aa  404  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  50.54 
 
 		 405 aa  404  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  52.86 
 
 		 390 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  50.8 
 
 		 403 aa  401  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  48.95 
 
 		 404 aa  400  9.999999999999999e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  52.92 
 
 		 386 aa  394  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  51.1 
 
 		 410 aa  384  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  50.54 
 
 		 410 aa  380  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  50.28 
 
 		 407 aa  370  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  51.22 
 
 		 407 aa  371  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  48.31 
 
 		 412 aa  365  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  49.46 
 
 		 406 aa  365  1e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  48.56 
 
 		 426 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  50.98 
 
 		 436 aa  354  1e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  49.56 
 
 		 412 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  49.32 
 
 		 394 aa  352  8e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  51.88 
 
 		 407 aa  352  1e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  46.84 
 
 		 431 aa  351  2e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  52.06 
 
 		 407 aa  348  1e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  51.46 
 
 		 407 aa  347  2e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  50.98 
 
 		 408 aa  345  1e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  47.83 
 
 		 412 aa  344  2e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  47.29 
 
 		 429 aa  344  2e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  51.46 
 
 		 407 aa  340  2e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  45.77 
 
 		 404 aa  330  3e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  42.78 
 
 		 393 aa  327  3e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  44.82 
 
 		 379 aa  323  3e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  44.8 
 
 		 402 aa  315  9.999999999999999e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  41.47 
 
 		 422 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  43.6 
 
 		 438 aa  305  8.000000000000001e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  49.32 
 
 		 450 aa  301  2e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  44.89 
 
 		 443 aa  298  1e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  46.67 
 
 		 389 aa  295  8e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  49.65 
 
 		 284 aa  293  3e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54032  26S protease regulatory subunit 4 homolog (TAT-binding homolog 5)  42.73 
 
 		 434 aa  293  5e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0833723 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  40.62 
 
 		 407 aa  292  7e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  42.42 
 
 		 405 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  49.29 
 
 		 447 aa  286  5e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02213  proteasome regulatory particle subunit Rpt2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07050)  41.74 
 
 		 460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0288941 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  48.59 
 
 		 427 aa  285  1.0000000000000001e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  50.88 
 
 		 398 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  47.69 
 
 		 446 aa  284  3.0000000000000004e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564069 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  47.87 
 
 		 429 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30067  predicted protein  42.74 
 
 		 403 aa  280  2e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  46.74 
 
 		 443 aa  279  5e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137848 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  48.25 
 
 		 393 aa  279  8e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  47.42 
 
 		 425 aa  279  8e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  45.27 
 
 		 465 aa  278  2e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  44.86 
 
 		 421 aa  271  1e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  39.57 
 
 		 400 aa  271  2e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  44.2 
 
 		 464 aa  267  2e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  38.27 
 
 		 389 aa  266  4e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  47.69 
 
 		 416 aa  265  8e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  40.7 
 
 		 414 aa  263  4.999999999999999e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.19 
 
 		 732 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9090  predicted protein  45.74 
 
 		 431 aa  261  2e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  39.52 
 
 		 417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0518  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.6 
 
 		 636 aa  253  6e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000475149  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  41.12 
 
 		 422 aa  251  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.211289 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.92 
 
 		 769 aa  250  3e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.85 
 
 		 768 aa  250  3e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  41.42 
 
 		 410 aa  250  4e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.64 
 
 		 719 aa  247  3e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50 
 
 		 731 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.89 
 
 		 731 aa  245  9e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.81 
 
 		 731 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.47 
 
 		 727 aa  243  3e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.54 
 
 		 718 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.31 
 
 		 742 aa  242  9e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.89 
 
 		 731 aa  241  1e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.34 
 
 		 743 aa  241  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.85 
 
 		 739 aa  241  2e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  51.3 
 
 		 722 aa  237  2e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.26 
 
 		 730 aa  237  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.23 
 
 		 759 aa  236  4e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.56 
 
 		 781 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.47 
 
 		 742 aa  236  6e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.84 
 
 		 735 aa  236  6e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.49 
 
 		 800 aa  236  7e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.03 
 
 		 740 aa  236  8e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.71 
 
 		 639 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44098  predicted protein  48.76 
 
 		 494 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0738436 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.91 
 
 		 736 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  52.61 
 
 		 713 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.31 
 
 		 784 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.55 
 
 		 760 aa  234  2.0000000000000002e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.36 
 
 		 738 aa  234  3e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  46.8 
 
 		 763 aa  234  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0091  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.69 
 
 		 625 aa  233  3e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00172576  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.1 
 
 		 805 aa  233  3e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.13 
 
 		 696 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.13 
 
 		 714 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  51.3 
 
 		 739 aa  233  5e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.8 
 
 		 781 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>