More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0867 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  100 
 
 		 429 aa  867    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  64.69 
 
 		 389 aa  463  1e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  65.06 
 
 		 390 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  61.5 
 
 		 386 aa  457  1e-127  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  59.11 
 
 		 387 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1266  proteasome-activating nucleotidase  52.41 
 
 		 404 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  50.39 
 
 		 403 aa  386  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  52.11 
 
 		 405 aa  384  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  51.18 
 
 		 405 aa  372  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  49.08 
 
 		 404 aa  372  1e-102  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  46.49 
 
 		 410 aa  371  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  50.67 
 
 		 405 aa  366  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  48.72 
 
 		 410 aa  361  2e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  50.14 
 
 		 407 aa  357  2.9999999999999997e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  48.94 
 
 		 413 aa  350  2e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  49.87 
 
 		 407 aa  350  2e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  50.57 
 
 		 407 aa  350  2e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  47.24 
 
 		 406 aa  345  1e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  48.91 
 
 		 407 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  48.91 
 
 		 407 aa  343  4e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  47.73 
 
 		 408 aa  343  4e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  48.63 
 
 		 407 aa  342  5e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  46.93 
 
 		 394 aa  342  1e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  46.06 
 
 		 436 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  46.58 
 
 		 412 aa  335  1e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  47.59 
 
 		 412 aa  332  6e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  48.65 
 
 		 415 aa  332  9e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  45.74 
 
 		 412 aa  325  7e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  43.83 
 
 		 431 aa  323  4e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  45.77 
 
 		 379 aa  322  8e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  45.25 
 
 		 404 aa  317  2e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  42.16 
 
 		 426 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  42.56 
 
 		 422 aa  311  2e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.592005 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  43.84 
 
 		 393 aa  302  8.000000000000001e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  43.68 
 
 		 405 aa  295  1e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  49.66 
 
 		 450 aa  293  4e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  47.51 
 
 		 429 aa  289  7e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  42.65 
 
 		 421 aa  288  2e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  42.53 
 
 		 438 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  46.92 
 
 		 446 aa  284  3.0000000000000004e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564069 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  48.94 
 
 		 284 aa  280  3e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  42.18 
 
 		 393 aa  276  4e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  40.22 
 
 		 443 aa  273  3e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  48.03 
 
 		 443 aa  273  4.0000000000000004e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54032  26S protease regulatory subunit 4 homolog (TAT-binding homolog 5)  40.8 
 
 		 434 aa  272  8.000000000000001e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0833723 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  39.64 
 
 		 416 aa  271  1e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  40.27 
 
 		 402 aa  271  2e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  44.55 
 
 		 425 aa  271  2e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  45.73 
 
 		 447 aa  270  2e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  40.41 
 
 		 400 aa  270  4e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  38.5 
 
 		 464 aa  266  5.999999999999999e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02213  proteasome regulatory particle subunit Rpt2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07050)  38.19 
 
 		 460 aa  265  2e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0288941 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9090  predicted protein  44.48 
 
 		 431 aa  264  2e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  43.79 
 
 		 465 aa  263  3e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  40.81 
 
 		 407 aa  264  3e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  41.32 
 
 		 389 aa  261  1e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  44.55 
 
 		 398 aa  261  1e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  37.18 
 
 		 414 aa  259  6e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  38.73 
 
 		 389 aa  259  6e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  43 
 
 		 427 aa  259  8e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30067  predicted protein  41.16 
 
 		 403 aa  256  5e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  35.86 
 
 		 417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  39.73 
 
 		 422 aa  253  5.000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  38.7 
 
 		 410 aa  250  4e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.42 
 
 		 732 aa  249  7e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.88 
 
 		 731 aa  237  2e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.17 
 
 		 721 aa  237  3e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.49 
 
 		 731 aa  236  4e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  42.71 
 
 		 759 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.48 
 
 		 731 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.49 
 
 		 731 aa  236  7e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.07 
 
 		 723 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.88 
 
 		 737 aa  232  9e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.92 
 
 		 685 aa  231  3e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.38 
 
 		 727 aa  231  3e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.49 
 
 		 760 aa  230  3e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.21 
 
 		 736 aa  229  5e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02581  cell division protein FtsH2  45.72 
 
 		 619 aa  229  5e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  49.21 
 
 		 681 aa  229  6e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  45.72 
 
 		 617 aa  229  8e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  45.72 
 
 		 617 aa  229  9e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.97 
 
 		 768 aa  228  1e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  45.59 
 
 		 754 aa  228  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  45.72 
 
 		 617 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.57 
 
 		 800 aa  227  3e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0078  microtubule-severing ATPase  46.24 
 
 		 490 aa  227  4e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.88 
 
 		 684 aa  226  4e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.53 
 
 		 739 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.92 
 
 		 687 aa  226  7e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.82 
 
 		 769 aa  226  7e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.28 
 
 		 662 aa  226  7e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.08 
 
 		 672 aa  226  7e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0613  cell division protein, ATP-dependent metalloprotease  46.62 
 
 		 692 aa  226  7e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.89 
 
 		 781 aa  226  7e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  44.02 
 
 		 775 aa  226  8e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0518  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.84 
 
 		 636 aa  225  9e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000475149  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.35 
 
 		 781 aa  225  1e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45.17 
 
 		 704 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.68 
 
 		 719 aa  225  1e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.37 
 
 		 718 aa  225  1e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>