More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0613 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2600  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.39 
 
 		 641 aa  642    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0466  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.79 
 
 		 673 aa  765    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07931  putative transmembrane AAA-metalloprotease FtsH  54.31 
 
 		 691 aa  677    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.88 
 
 		 685 aa  919    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3001  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.63 
 
 		 676 aa  920    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0623369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0030  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.21 
 
 		 696 aa  820    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.876867  normal  0.384468 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0613  cell division protein, ATP-dependent metalloprotease  100 
 
 		 692 aa  1412    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1654  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.04 
 
 		 652 aa  671    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0232  hypothetical protein  65.07 
 
 		 691 aa  843    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.9 
 
 		 697 aa  689    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0047  cell division protein FtsH, putative  58.81 
 
 		 673 aa  631  1e-179  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0007  peptidase M41, FtsH  64.84 
 
 		 699 aa  617  1e-175  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.03 
 
 		 697 aa  617  1e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.849156  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.64 
 
 		 694 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.4836  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0078  peptidase M41, FtsH  52.31 
 
 		 706 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0143352  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05140  ATPase, putative  51.5 
 
 		 817 aa  600  1e-170  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0164604  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0100  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.02 
 
 		 686 aa  596  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2678  FtsH-2 peptidase  62.83 
 
 		 694 aa  593  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_23646  predicted protein  60.04 
 
 		 648 aa  593  1e-168  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0123  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.22 
 
 		 699 aa  594  1e-168  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34770  Mitochondrial respiratory chain complexes assembly protein RCA1 (TAT-binding homolog 12)  48.73 
 
 		 867 aa  590  1e-167  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00577984  normal  0.0143281 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82096  AAA+-type ATPase  47 
 
 		 787 aa  579  1e-164  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.176589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13471  predicted protein  64.67 
 
 		 476 aa  570  1e-161  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.155639  normal  0.170565 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16391  predicted protein  59.92 
 
 		 590 aa  568  1e-160  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04557  mitochondrial inner membrane AAA protease Yta12, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02680)  47.94 
 
 		 883 aa  564  1.0000000000000001e-159  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.24 
 
 		 647 aa  552  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.67 
 
 		 714 aa  548  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.31 
 
 		 639 aa  548  1e-154  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  56.29 
 
 		 646 aa  546  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.67 
 
 		 696 aa  548  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.13 
 
 		 602 aa  542  9.999999999999999e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.7 
 
 		 639 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  56.85 
 
 		 608 aa  534  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  56.44 
 
 		 614 aa  530  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  46.39 
 
 		 633 aa  529  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  46.24 
 
 		 633 aa  529  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  46.24 
 
 		 633 aa  529  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  46.24 
 
 		 633 aa  529  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54 
 
 		 666 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.643588  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5195  FtsH-2 peptidase  54.62 
 
 		 627 aa  531  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0074  FtsH-2 protease  54 
 
 		 917 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00600041  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  46.24 
 
 		 633 aa  529  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  46.91 
 
 		 633 aa  532  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  46.24 
 
 		 633 aa  529  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.67 
 
 		 633 aa  531  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  46.24 
 
 		 633 aa  529  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0389  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54 
 
 		 666 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185048  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1194  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54 
 
 		 666 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.256631  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1487  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54 
 
 		 666 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.643997  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  46.39 
 
 		 633 aa  529  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4385  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.13 
 
 		 663 aa  528  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54 
 
 		 852 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.16452  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.6 
 
 		 662 aa  526  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231073  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.21 
 
 		 615 aa  526  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4517  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.13 
 
 		 663 aa  528  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.723361  normal  0.670531 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1574  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54 
 
 		 666 aa  528  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580758  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.57 
 
 		 639 aa  522  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1526  ATP-dependent zinc metallopeptidase  52.93 
 
 		 628 aa  525  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  52.57 
 
 		 639 aa  522  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0426  FtsH peptidase  47.76 
 
 		 652 aa  522  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.405966  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.98 
 
 		 640 aa  524  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1495  FtsH-2 peptidase  53.54 
 
 		 635 aa  523  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.421707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.83 
 
 		 607 aa  522  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  46.19 
 
 		 700 aa  521  1e-146  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  53.17 
 
 		 638 aa  519  1e-146  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.16 
 
 		 645 aa  519  1e-146  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107147  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.36 
 
 		 646 aa  519  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  53.28 
 
 		 617 aa  519  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.61 
 
 		 630 aa  521  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4181  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.18 
 
 		 676 aa  520  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  53.11 
 
 		 613 aa  521  1e-146  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.9 
 
 		 631 aa  520  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.54 
 
 		 628 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1901  FtsH-2 peptidase  54.3 
 
 		 659 aa  520  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1721  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.54 
 
 		 628 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.54064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0074  cell division protein  53.16 
 
 		 645 aa  520  1e-146  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.36 
 
 		 646 aa  519  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0358  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.73 
 
 		 652 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0879  FtsH peptidase  53.73 
 
 		 611 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5357  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  52.94 
 
 		 615 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232294 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.12 
 
 		 637 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1520  FtsH-2 peptidase  53.31 
 
 		 692 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428329  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  51.48 
 
 		 641 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  48.39 
 
 		 617 aa  517  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.81 
 
 		 640 aa  518  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.83 
 
 		 676 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.71 
 
 		 638 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.58 
 
 		 638 aa  516  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642505  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.04 
 
 		 648 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2188  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.44 
 
 		 649 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350229  normal  0.438236 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  53.14 
 
 		 630 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  52.33 
 
 		 627 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  53.29 
 
 		 617 aa  518  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.83 
 
 		 643 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.04 
 
 		 611 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02481  cell division protein FtsH2  48.68 
 
 		 602 aa  517  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.53 
 
 		 652 aa  517  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3438  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.56 
 
 		 607 aa  518  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.588898  hitchhiker  0.000161563 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  45.6 
 
 		 673 aa  517  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1098  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.41 
 
 		 610 aa  514  1e-144  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0627303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>