More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1038 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  100 
 
 
412 aa  841    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  71.84 
 
 
412 aa  625  1e-178  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  74.12 
 
 
436 aa  605  9.999999999999999e-173  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  68.45 
 
 
412 aa  598  1e-170  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  61.44 
 
 
394 aa  470  1.0000000000000001e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  61.58 
 
 
404 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  56.4 
 
 
426 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  56.61 
 
 
431 aa  449  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  56.77 
 
 
422 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  55.53 
 
 
407 aa  437  1e-121  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  55.53 
 
 
407 aa  435  1e-121  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  55.78 
 
 
407 aa  436  1e-121  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  56.37 
 
 
408 aa  424  1e-117  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  58.06 
 
 
407 aa  418  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  52.49 
 
 
393 aa  396  1e-109  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  54.19 
 
 
379 aa  397  1e-109  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  47.83 
 
 
405 aa  385  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  55.31 
 
 
387 aa  384  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  51.98 
 
 
389 aa  376  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1266  proteasome-activating nucleotidase  50.88 
 
 
404 aa  376  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  47.31 
 
 
405 aa  376  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  49.61 
 
 
386 aa  372  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  48.4 
 
 
405 aa  366  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  54.65 
 
 
390 aa  365  1e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  47.45 
 
 
410 aa  362  8e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  47.57 
 
 
403 aa  360  2e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  46.02 
 
 
404 aa  359  6e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  48.95 
 
 
406 aa  352  7e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  47.54 
 
 
402 aa  352  8e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  51.63 
 
 
407 aa  352  8e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  48.05 
 
 
415 aa  352  8e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  46.87 
 
 
410 aa  350  2e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  52.12 
 
 
438 aa  349  5e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  46.87 
 
 
407 aa  346  5e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  51.16 
 
 
443 aa  345  8e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  47.8 
 
 
405 aa  345  8.999999999999999e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  46.6 
 
 
413 aa  343  4e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.583588 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  48.62 
 
 
389 aa  338  9e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54032  26S protease regulatory subunit 4 homolog (TAT-binding homolog 5)  50.15 
 
 
434 aa  337  1.9999999999999998e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0833723 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  46.58 
 
 
429 aa  335  1e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  49.43 
 
 
407 aa  332  5e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30067  predicted protein  46.7 
 
 
403 aa  332  6e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02213  proteasome regulatory particle subunit Rpt2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07050)  49.54 
 
 
460 aa  332  7.000000000000001e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0288941 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  43.81 
 
 
389 aa  328  1.0000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  46.76 
 
 
393 aa  327  3e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  46.68 
 
 
425 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  46.61 
 
 
398 aa  325  7e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  44.77 
 
 
421 aa  325  7e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  43.39 
 
 
465 aa  323  4e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  44.74 
 
 
417 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  44.74 
 
 
400 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  46.89 
 
 
446 aa  319  6e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0564069 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  44.42 
 
 
464 aa  318  1e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9090  predicted protein  44.42 
 
 
431 aa  318  1e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  44.81 
 
 
416 aa  316  6e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  42.46 
 
 
427 aa  316  6e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  48.46 
 
 
429 aa  315  9.999999999999999e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  45 
 
 
414 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  50 
 
 
450 aa  312  4.999999999999999e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  47.95 
 
 
447 aa  309  6.999999999999999e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  45.51 
 
 
422 aa  308  9e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  55.76 
 
 
284 aa  306  3e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  45.45 
 
 
443 aa  302  9e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  46.33 
 
 
410 aa  298  1e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  57.14 
 
 
732 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.55 
 
 
718 aa  258  1e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  53.81 
 
 
769 aa  257  2e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.39 
 
 
768 aa  256  4e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.04 
 
 
757 aa  256  4e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  49.23 
 
 
763 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  54.24 
 
 
740 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  55.04 
 
 
754 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  53.91 
 
 
742 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.97 
 
 
754 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.07 
 
 
739 aa  254  3e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  55.74 
 
 
727 aa  253  4.0000000000000004e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  53.41 
 
 
713 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.51 
 
 
719 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.58 
 
 
805 aa  252  9.000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  48.46 
 
 
764 aa  251  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  53.65 
 
 
709 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  53.09 
 
 
743 aa  251  1e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.64 
 
 
757 aa  251  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.84 
 
 
756 aa  251  2e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.77 
 
 
740 aa  250  3e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.41 
 
 
721 aa  249  4e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.78 
 
 
701 aa  249  5e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.6 
 
 
723 aa  248  9e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  54.62 
 
 
754 aa  248  1e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.97 
 
 
715 aa  248  1e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.48 
 
 
735 aa  248  1e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.38 
 
 
754 aa  248  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.57 
 
 
755 aa  247  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.25 
 
 
731 aa  248  2e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.26 
 
 
742 aa  247  3e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.57 
 
 
704 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.81 
 
 
730 aa  246  4e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.52 
 
 
763 aa  246  4.9999999999999997e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.14 
 
 
731 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.43 
 
 
757 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>