More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0077 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  54.04 
 
 
852 aa  711    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.97 
 
 
781 aa  792    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.31 
 
 
760 aa  770    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  67.54 
 
 
743 aa  1017    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  58.57 
 
 
738 aa  837    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  49.31 
 
 
713 aa  694    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  49.37 
 
 
709 aa  676    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  53.44 
 
 
769 aa  789    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.24 
 
 
715 aa  679    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.46 
 
 
759 aa  754    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.11 
 
 
701 aa  725    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  53.15 
 
 
754 aa  725    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  54.04 
 
 
768 aa  811    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  56.93 
 
 
727 aa  811    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  55.65 
 
 
731 aa  776    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  56.2 
 
 
731 aa  785    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.61 
 
 
754 aa  720    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  56.51 
 
 
723 aa  834    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  52.99 
 
 
722 aa  731    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  53.63 
 
 
810 aa  756    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.52 
 
 
806 aa  728    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.89 
 
 
753 aa  709    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.76 
 
 
737 aa  746    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  66.16 
 
 
740 aa  1006    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.73 
 
 
801 aa  679    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.56 
 
 
781 aa  755    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  61.21 
 
 
810 aa  772    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  56.39 
 
 
754 aa  807    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  51.98 
 
 
763 aa  764    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  60.39 
 
 
775 aa  937    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  52.96 
 
 
764 aa  768    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  60.84 
 
 
805 aa  788    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  50.74 
 
 
718 aa  665    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  66.9 
 
 
742 aa  999    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.94 
 
 
735 aa  755    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.06 
 
 
730 aa  635    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.95 
 
 
772 aa  692    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.41 
 
 
801 aa  662    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  60.68 
 
 
804 aa  801    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.56 
 
 
737 aa  735    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  54.84 
 
 
736 aa  741    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  62.52 
 
 
738 aa  943    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1223  AAA family ATPase  48.75 
 
 
721 aa  694    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  55.65 
 
 
731 aa  776    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  53.6 
 
 
704 aa  713    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.91 
 
 
808 aa  739    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.36 
 
 
773 aa  701    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.77 
 
 
763 aa  679    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  53.03 
 
 
757 aa  750    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  67.49 
 
 
740 aa  1025    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.74 
 
 
754 aa  733    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.22 
 
 
800 aa  669    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  59.14 
 
 
805 aa  813    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  100 
 
 
739 aa  1479    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.78 
 
 
755 aa  732    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  58.32 
 
 
719 aa  806    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.34 
 
 
721 aa  765    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  55.99 
 
 
756 aa  795    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.61 
 
 
757 aa  736    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.45 
 
 
784 aa  764    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.51 
 
 
736 aa  759    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  58.6 
 
 
732 aa  842    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  60.3 
 
 
718 aa  855    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.88 
 
 
757 aa  727    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  54.31 
 
 
738 aa  739    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  55.39 
 
 
731 aa  773    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  53.5 
 
 
754 aa  744    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  51.68 
 
 
732 aa  672    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  67.36 
 
 
742 aa  1013    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0625  methyltransferase type 11  52.92 
 
 
826 aa  699    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  47.59 
 
 
739 aa  627  1e-178  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  44.36 
 
 
804 aa  623  1e-177  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  47.96 
 
 
806 aa  623  1e-177  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  44.75 
 
 
810 aa  616  1e-175  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  46.56 
 
 
829 aa  610  1e-173  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  44.47 
 
 
814 aa  603  1.0000000000000001e-171  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  47.86 
 
 
699 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  48.49 
 
 
703 aa  599  1e-170  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  47.17 
 
 
746 aa  599  1e-170  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  45.64 
 
 
776 aa  589  1e-167  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  51.93 
 
 
703 aa  574  1.0000000000000001e-162  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  53.72 
 
 
639 aa  537  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  45.72 
 
 
930 aa  530  1e-149  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3574  vesicle-fusing ATPase  55.74 
 
 
647 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90881  AAA+-type ATPase  47.62 
 
 
788 aa  531  1e-149  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.369927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  52.4 
 
 
613 aa  523  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  50.09 
 
 
601 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_41850  predicted protein  46.86 
 
 
685 aa  518  1.0000000000000001e-145  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  46.07 
 
 
803 aa  504  1e-141  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  47.45 
 
 
550 aa  503  1e-141  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37691  predicted protein  45.08 
 
 
691 aa  489  1e-137  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556949  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36182  predicted protein  47.36 
 
 
567 aa  484  1e-135  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32083  AAA ATPase  42.18 
 
 
832 aa  464  1e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.190339 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01366  AAA family ATPase/60S ribosome export protein Rix7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09210)  43.73 
 
 
729 aa  453  1.0000000000000001e-126  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690514  normal  0.790284 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06980  helicase, putative  40 
 
 
756 aa  441  9.999999999999999e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0189232  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0254  microtubule-severing ATPase  35.42 
 
 
750 aa  427  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0293  microtubule-severing ATPase  35.4 
 
 
748 aa  425  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.48554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0436  Adenosinetriphosphatase  39.93 
 
 
749 aa  401  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.544283 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  39.72 
 
 
607 aa  385  1e-105  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40257  predicted protein  42.88 
 
 
537 aa  382  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>