More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0254 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_34520  AAA+ family ATPase  54.28 
 
 
747 aa  663    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0185945  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0436  Adenosinetriphosphatase  58.89 
 
 
749 aa  792    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.544283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0254  microtubule-severing ATPase  100 
 
 
750 aa  1418    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0583  vesicle-fusing ATPase  52.57 
 
 
741 aa  645    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0592  vesicle-fusing ATPase  52.44 
 
 
741 aa  640    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524368  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0293  microtubule-severing ATPase  86.19 
 
 
748 aa  1177    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.48554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0432  Microtubule-severing ATPase  54.35 
 
 
734 aa  651    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0369558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0605  vesicle-fusing ATPase  52.44 
 
 
741 aa  640    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0749  vesicle-fusing ATPase  52.46 
 
 
742 aa  617  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.64662  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0155  vesicle-fusing ATPase  51.4 
 
 
729 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10440  ATPase  50.87 
 
 
728 aa  594  1e-168  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0674  Adenosinetriphosphatase  52.06 
 
 
737 aa  576  1.0000000000000001e-163  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.444846  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3711  Adenosinetriphosphatase  50.26 
 
 
733 aa  575  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.9 
 
 
739 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.27 
 
 
718 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.8 
 
 
732 aa  428  1e-118  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.8 
 
 
727 aa  425  1e-117  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.05 
 
 
759 aa  421  1e-116  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.92 
 
 
768 aa  417  9.999999999999999e-116  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.18 
 
 
735 aa  416  9.999999999999999e-116  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.14 
 
 
760 aa  414  1e-114  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  32.91 
 
 
775 aa  410  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.26 
 
 
719 aa  411  1e-113  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.65 
 
 
736 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.95 
 
 
740 aa  405  1e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.55 
 
 
756 aa  405  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.64 
 
 
723 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.35 
 
 
731 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.36 
 
 
769 aa  399  1e-109  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.46 
 
 
731 aa  399  1e-109  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.83 
 
 
737 aa  399  1e-109  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.93 
 
 
731 aa  397  1e-109  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.95 
 
 
737 aa  398  1e-109  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.9 
 
 
731 aa  395  1e-108  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.96 
 
 
808 aa  394  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.32 
 
 
742 aa  393  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  32.55 
 
 
810 aa  389  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.32 
 
 
743 aa  390  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.85 
 
 
721 aa  389  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.55 
 
 
738 aa  392  1e-107  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37 
 
 
755 aa  388  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.51 
 
 
738 aa  389  1e-106  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.92 
 
 
740 aa  389  1e-106  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.11 
 
 
738 aa  383  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.72 
 
 
806 aa  384  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.27 
 
 
742 aa  384  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.25 
 
 
754 aa  382  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.22 
 
 
754 aa  379  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.22 
 
 
757 aa  382  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  37.94 
 
 
754 aa  379  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.09 
 
 
757 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.33 
 
 
754 aa  371  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  32.9 
 
 
764 aa  372  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.27 
 
 
730 aa  372  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.67 
 
 
781 aa  367  1e-100  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.38 
 
 
757 aa  368  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  30.84 
 
 
713 aa  366  1e-100  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.92 
 
 
701 aa  365  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.54 
 
 
754 aa  365  2e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  32.2 
 
 
763 aa  363  4e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.55 
 
 
781 aa  364  4e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  37.24 
 
 
722 aa  364  4e-99  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.93 
 
 
784 aa  363  8e-99  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  40.23 
 
 
803 aa  362  1e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.2 
 
 
810 aa  362  1e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  38.21 
 
 
703 aa  361  3e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.91 
 
 
704 aa  360  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.37 
 
 
773 aa  360  6e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.11 
 
 
805 aa  360  7e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  35.73 
 
 
703 aa  359  9.999999999999999e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.66 
 
 
852 aa  359  9.999999999999999e-98  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  35.64 
 
 
739 aa  358  1.9999999999999998e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  38.22 
 
 
829 aa  358  2.9999999999999997e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.84 
 
 
736 aa  357  5e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  32.22 
 
 
810 aa  355  1e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.17 
 
 
715 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1223  AAA family ATPase  31.33 
 
 
721 aa  353  8e-96  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  34.89 
 
 
746 aa  352  2e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  38.49 
 
 
804 aa  351  3e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.24 
 
 
801 aa  351  3e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  38.81 
 
 
814 aa  351  4e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.26 
 
 
805 aa  350  7e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  41.73 
 
 
699 aa  348  2e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.87 
 
 
772 aa  347  4e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.76 
 
 
763 aa  346  7e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.7 
 
 
804 aa  346  8e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.13 
 
 
753 aa  343  5e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  38.66 
 
 
732 aa  342  1e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  37.7 
 
 
806 aa  342  1e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  32.39 
 
 
718 aa  340  7e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  35.36 
 
 
776 aa  329  1.0000000000000001e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  35.38 
 
 
930 aa  327  5e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.08 
 
 
709 aa  327  6e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.19 
 
 
801 aa  327  7e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  37.55 
 
 
550 aa  321  3e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90881  AAA+-type ATPase  36.62 
 
 
788 aa  320  9e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.369927 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36182  predicted protein  39.75 
 
 
567 aa  319  1e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37691  predicted protein  34.53 
 
 
691 aa  314  3.9999999999999997e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556949  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  39.22 
 
 
601 aa  313  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  35.85 
 
 
639 aa  312  1e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0101674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>