More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_35070 on replicon NC_009363
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  100 
 
 
417 aa  856    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  76.56 
 
 
414 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  74.14 
 
 
389 aa  600  1e-170  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  74.15 
 
 
422 aa  582  1.0000000000000001e-165  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  75.07 
 
 
410 aa  560  1e-158  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  47.68 
 
 
438 aa  370  1e-101  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02213  proteasome regulatory particle subunit Rpt2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07050)  51.23 
 
 
460 aa  365  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0288941 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  47.37 
 
 
443 aa  365  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54032  26S protease regulatory subunit 4 homolog (TAT-binding homolog 5)  47.79 
 
 
434 aa  366  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0833723 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  45.5 
 
 
412 aa  338  7e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  46.37 
 
 
394 aa  337  2.9999999999999997e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  46.43 
 
 
393 aa  332  5e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  45.86 
 
 
412 aa  332  9e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  43.61 
 
 
431 aa  330  4e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  44.88 
 
 
407 aa  327  3e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  45.3 
 
 
436 aa  326  4.0000000000000003e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  43.48 
 
 
407 aa  325  1e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  44.97 
 
 
407 aa  323  3e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  44.35 
 
 
408 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  44.69 
 
 
407 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  44.74 
 
 
412 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  46.22 
 
 
404 aa  320  3e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  44.8 
 
 
422 aa  319  5e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  44.89 
 
 
426 aa  318  7.999999999999999e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  43.75 
 
 
421 aa  318  2e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  42.63 
 
 
405 aa  316  5e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  55.34 
 
 
284 aa  313  3.9999999999999997e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  45.17 
 
 
379 aa  312  5.999999999999999e-84  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  42.97 
 
 
404 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  42.43 
 
 
403 aa  307  3e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  41.89 
 
 
405 aa  306  4.0000000000000004e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  42.01 
 
 
402 aa  306  4.0000000000000004e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  42.28 
 
 
405 aa  306  5.0000000000000004e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  44.71 
 
 
405 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  42.64 
 
 
407 aa  301  2e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  35.71 
 
 
465 aa  299  5e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.110869 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  42.22 
 
 
393 aa  296  4e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  37.96 
 
 
425 aa  296  4e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  40.43 
 
 
389 aa  294  2e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  44.35 
 
 
416 aa  292  6e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  42.7 
 
 
406 aa  289  8e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  50 
 
 
429 aa  288  1e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  40.65 
 
 
400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30067  predicted protein  40.86 
 
 
403 aa  285  2.0000000000000002e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  36.08 
 
 
427 aa  283  4.0000000000000003e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  43.58 
 
 
410 aa  283  5.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1266  proteasome-activating nucleotidase  43.88 
 
 
404 aa  282  8.000000000000001e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  50.52 
 
 
398 aa  282  8.000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  49.63 
 
 
446 aa  281  2e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0564069 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9090  predicted protein  42.59 
 
 
431 aa  281  2e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  43.38 
 
 
407 aa  280  4e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  40.57 
 
 
389 aa  280  5e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  42.15 
 
 
410 aa  278  1e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  42.98 
 
 
407 aa  276  4e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  48.69 
 
 
450 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  41.62 
 
 
387 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  38.93 
 
 
386 aa  273  6e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  45.05 
 
 
443 aa  272  1e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  37.67 
 
 
464 aa  272  1e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  41.03 
 
 
390 aa  271  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  39.84 
 
 
413 aa  267  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  47.23 
 
 
447 aa  266  5.999999999999999e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  35.77 
 
 
429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  47.6 
 
 
415 aa  250  3e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.63 
 
 
757 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.55 
 
 
754 aa  232  8.000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.13 
 
 
754 aa  229  5e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.16 
 
 
732 aa  226  7e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.56 
 
 
719 aa  225  9e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  47.64 
 
 
764 aa  224  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.01 
 
 
721 aa  224  2e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.59 
 
 
731 aa  224  3e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.81 
 
 
754 aa  224  3e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.82 
 
 
754 aa  223  7e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.62 
 
 
763 aa  222  8e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.64 
 
 
723 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.26 
 
 
727 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.64 
 
 
718 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.92 
 
 
731 aa  221  3e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.95 
 
 
800 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.61 
 
 
739 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.45 
 
 
756 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.57 
 
 
784 aa  219  6e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.75 
 
 
768 aa  218  1e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.78 
 
 
769 aa  218  2e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45 
 
 
759 aa  218  2e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  45.92 
 
 
763 aa  218  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42 
 
 
781 aa  218  2e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.08 
 
 
731 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.49 
 
 
740 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.49 
 
 
743 aa  216  5e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.49 
 
 
740 aa  216  5e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  47.39 
 
 
776 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.12 
 
 
736 aa  216  7e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.88 
 
 
731 aa  215  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.35 
 
 
781 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.49 
 
 
737 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.05 
 
 
742 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.49 
 
 
742 aa  214  2.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  40.71 
 
 
803 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>