More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_32343 on replicon NC_009360
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  100 
 
 
425 aa  857    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  71.43 
 
 
465 aa  583  1.0000000000000001e-165  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  69.27 
 
 
427 aa  583  1.0000000000000001e-165  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  68.08 
 
 
464 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9090  predicted protein  62.41 
 
 
431 aa  542  1e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  45.99 
 
 
394 aa  338  9.999999999999999e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  46.19 
 
 
407 aa  330  2e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  52.48 
 
 
412 aa  330  3e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  46.19 
 
 
407 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  45.94 
 
 
407 aa  327  3e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  46.68 
 
 
412 aa  326  5e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  44.92 
 
 
407 aa  325  8.000000000000001e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  50.83 
 
 
410 aa  325  1e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  44.68 
 
 
379 aa  320  1.9999999999999998e-86  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  54.68 
 
 
405 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  44.36 
 
 
405 aa  320  3e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  44.88 
 
 
412 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  44.07 
 
 
436 aa  318  1e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  50.67 
 
 
410 aa  317  4e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  44.64 
 
 
403 aa  316  6e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  43.25 
 
 
443 aa  315  9.999999999999999e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  44.05 
 
 
408 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  42.37 
 
 
404 aa  311  1e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  49.48 
 
 
438 aa  311  2e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  53.61 
 
 
407 aa  310  4e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  44.02 
 
 
405 aa  309  6.999999999999999e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  42.39 
 
 
402 aa  308  9e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  42.15 
 
 
393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  49.67 
 
 
422 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54032  26S protease regulatory subunit 4 homolog (TAT-binding homolog 5)  47.65 
 
 
434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0833723 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  50.66 
 
 
389 aa  306  5.0000000000000004e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  50 
 
 
389 aa  306  6e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.264354 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02213  proteasome regulatory particle subunit Rpt2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07050)  41.37 
 
 
460 aa  305  7e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0288941 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  41.05 
 
 
404 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  39.8 
 
 
431 aa  300  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  44.07 
 
 
407 aa  300  3e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  49.31 
 
 
405 aa  299  6e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  38.65 
 
 
414 aa  298  1e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1266  proteasome-activating nucleotidase  49.67 
 
 
404 aa  298  1e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  42.78 
 
 
422 aa  297  2e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  49.66 
 
 
407 aa  297  2e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  50.17 
 
 
429 aa  297  2e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  49.31 
 
 
390 aa  297  3e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  37.96 
 
 
417 aa  296  4e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  40.26 
 
 
389 aa  296  4e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  50.35 
 
 
406 aa  296  6e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  49.32 
 
 
398 aa  295  7e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  48.54 
 
 
450 aa  294  2e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  40.31 
 
 
387 aa  294  2e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  41.48 
 
 
426 aa  294  2e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  42.7 
 
 
410 aa  293  4e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  41.75 
 
 
447 aa  293  5e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  50.73 
 
 
284 aa  290  4e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  42.31 
 
 
400 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  47.77 
 
 
386 aa  289  8e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  40.14 
 
 
393 aa  287  2e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  37.87 
 
 
421 aa  287  2e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30067  predicted protein  49.48 
 
 
403 aa  286  5.999999999999999e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  49.28 
 
 
413 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  47.14 
 
 
446 aa  282  7.000000000000001e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0564069 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  47.48 
 
 
443 aa  275  1.0000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  49.62 
 
 
415 aa  273  6e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  44.55 
 
 
429 aa  271  2e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  38.77 
 
 
416 aa  269  5.9999999999999995e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.39 
 
 
810 aa  223  6e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1034  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.18 
 
 
510 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.06 
 
 
754 aa  220  5e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.81 
 
 
740 aa  219  7.999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45.85 
 
 
742 aa  218  2e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.19 
 
 
640 aa  218  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.59 
 
 
731 aa  218  2e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.86 
 
 
739 aa  218  2e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.54 
 
 
719 aa  218  2e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  45.38 
 
 
608 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.92 
 
 
738 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.83 
 
 
731 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  38.74 
 
 
713 aa  217  4e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.8 
 
 
638 aa  217  4e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.44 
 
 
718 aa  217  4e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  45.38 
 
 
640 aa  216  7e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45.06 
 
 
743 aa  216  8e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.93 
 
 
732 aa  216  8e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.92 
 
 
638 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.4 
 
 
759 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.92 
 
 
638 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  40.66 
 
 
722 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.92 
 
 
638 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.85 
 
 
738 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45.45 
 
 
727 aa  214  2.9999999999999995e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45.06 
 
 
742 aa  214  2.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.7 
 
 
769 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.66 
 
 
740 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44098  predicted protein  44.21 
 
 
494 aa  213  5.999999999999999e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0738436 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.54 
 
 
638 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  42.75 
 
 
754 aa  213  7e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6874  cell division protein FtsH  45.38 
 
 
638 aa  213  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0972491 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3548  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.96 
 
 
682 aa  212  9e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0555196  normal  0.0513542 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.44 
 
 
731 aa  212  1e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.85 
 
 
653 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0276  ATP-dependent Zn protease  46.78 
 
 
708 aa  211  2e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00629107  normal  0.162688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>