More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_33894 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  100 
 
 
398 aa  810    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  74.74 
 
 
402 aa  614  1e-175  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  73.98 
 
 
407 aa  611  9.999999999999999e-175  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30067  predicted protein  74.74 
 
 
403 aa  582  1.0000000000000001e-165  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  74.48 
 
 
389 aa  574  1.0000000000000001e-163  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  50.4 
 
 
408 aa  365  1e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  47.58 
 
 
394 aa  355  5.999999999999999e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  48.59 
 
 
404 aa  348  9e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  46.12 
 
 
447 aa  339  4e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  48.21 
 
 
405 aa  338  7e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  46.72 
 
 
412 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  46.84 
 
 
429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  46.34 
 
 
407 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  43.47 
 
 
412 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  46.07 
 
 
407 aa  335  1e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  46.13 
 
 
436 aa  334  1e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  44.27 
 
 
422 aa  333  4e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  45.58 
 
 
412 aa  332  6e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  45.8 
 
 
407 aa  332  6e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  45.53 
 
 
410 aa  332  9e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  54.78 
 
 
450 aa  329  6e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  46.65 
 
 
393 aa  327  3e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  45.79 
 
 
407 aa  326  3e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  51.08 
 
 
446 aa  326  5e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0564069 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  45.68 
 
 
421 aa  325  9e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  45.28 
 
 
403 aa  324  1e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  46.11 
 
 
400 aa  323  2e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54032  26S protease regulatory subunit 4 homolog (TAT-binding homolog 5)  46.92 
 
 
434 aa  322  6e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0833723 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  46.78 
 
 
431 aa  322  7e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  51.64 
 
 
443 aa  319  6e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1266  proteasome-activating nucleotidase  46.84 
 
 
404 aa  318  9e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  51.58 
 
 
443 aa  317  2e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  48.32 
 
 
438 aa  317  2e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  43.13 
 
 
407 aa  317  2e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  43.99 
 
 
410 aa  316  4e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  57.99 
 
 
284 aa  315  9.999999999999999e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02213  proteasome regulatory particle subunit Rpt2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07050)  47.35 
 
 
460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0288941 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  44.24 
 
 
405 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  41.99 
 
 
405 aa  310  4e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  45.15 
 
 
407 aa  309  5e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  41.77 
 
 
405 aa  309  5.9999999999999995e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  43.72 
 
 
406 aa  308  2.0000000000000002e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  44.73 
 
 
426 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  44.93 
 
 
416 aa  305  1.0000000000000001e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  42.55 
 
 
413 aa  302  7.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  43.83 
 
 
387 aa  301  2e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.681271 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  43.37 
 
 
393 aa  299  5e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  40.77 
 
 
425 aa  299  5e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  40.99 
 
 
404 aa  299  7e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  40.46 
 
 
465 aa  298  1e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  43.85 
 
 
386 aa  296  3e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  45.05 
 
 
390 aa  293  3e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  43.24 
 
 
414 aa  293  4e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  41.78 
 
 
389 aa  292  7e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  48.3 
 
 
464 aa  291  1e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  42.2 
 
 
417 aa  291  1e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  41 
 
 
379 aa  289  6e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  44.57 
 
 
422 aa  286  4e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  44.44 
 
 
389 aa  286  5.999999999999999e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  47.97 
 
 
427 aa  285  1.0000000000000001e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  53.67 
 
 
415 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9090  predicted protein  47.65 
 
 
431 aa  280  4e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  43.06 
 
 
410 aa  276  5e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  40.92 
 
 
429 aa  270  4e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45.02 
 
 
757 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.21 
 
 
781 aa  231  2e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.96 
 
 
723 aa  230  4e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.43 
 
 
732 aa  229  5e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.44 
 
 
800 aa  227  3e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.53 
 
 
781 aa  227  3e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  44.94 
 
 
713 aa  226  4e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.65 
 
 
784 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45.02 
 
 
754 aa  224  1e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  47.58 
 
 
699 aa  225  1e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0353  peptidase M41, FtsH  46.12 
 
 
575 aa  224  3e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.209104  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0665  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.64 
 
 
633 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735845  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.2 
 
 
727 aa  224  3e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2318  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.64 
 
 
633 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0771513  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0566  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.64 
 
 
633 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10341  cell division protein FtsH4  46.12 
 
 
575 aa  223  4e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.194795  hitchhiker  0.000108584 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1115  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.25 
 
 
638 aa  223  4e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48117  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45.31 
 
 
754 aa  223  6e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  48.71 
 
 
722 aa  223  6e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.27 
 
 
719 aa  223  6e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.84 
 
 
718 aa  222  8e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.93 
 
 
640 aa  222  8e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.22 
 
 
754 aa  222  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.45 
 
 
731 aa  222  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.85 
 
 
639 aa  221  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0690  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.56 
 
 
631 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.827702  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.45 
 
 
731 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.45 
 
 
610 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45.53 
 
 
759 aa  220  3e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.45 
 
 
610 aa  220  3e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.88 
 
 
637 aa  220  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.698046  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.28 
 
 
638 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.31 
 
 
754 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.06 
 
 
731 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0453  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.44 
 
 
653 aa  219  5e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.28 
 
 
638 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>