More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_29121 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  73.4 
 
 		 443 aa  642    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  74.59 
 
 		 446 aa  656    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564069 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  100 
 
 		 429 aa  877    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  75.65 
 
 		 447 aa  658    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  71.33 
 
 		 450 aa  629  1e-179  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  55.16 
 
 		 407 aa  348  1e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  52.73 
 
 		 389 aa  332  7.000000000000001e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  51.62 
 
 		 402 aa  331  1e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  56 
 
 		 398 aa  328  8e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  51.66 
 
 		 407 aa  326  6e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  50.66 
 
 		 407 aa  324  2e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  47.06 
 
 		 405 aa  321  9.999999999999999e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  48.32 
 
 		 405 aa  321  9.999999999999999e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  50.66 
 
 		 407 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  46.88 
 
 		 400 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  50.33 
 
 		 407 aa  320  3e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  48.17 
 
 		 404 aa  319  5e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  47.66 
 
 		 421 aa  318  1e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  48.32 
 
 		 403 aa  317  2e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  48.17 
 
 		 394 aa  316  5e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  48.43 
 
 		 393 aa  316  6e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  46.22 
 
 		 443 aa  315  8e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  47.42 
 
 		 393 aa  315  9e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  45 
 
 		 438 aa  315  9e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  48.46 
 
 		 412 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  47.6 
 
 		 404 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  46.29 
 
 		 412 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  49.03 
 
 		 416 aa  314  1.9999999999999998e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  54.65 
 
 		 284 aa  314  1.9999999999999998e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  40.52 
 
 		 431 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30067  predicted protein  53.85 
 
 		 403 aa  312  6.999999999999999e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  49.2 
 
 		 422 aa  311  1e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  50.48 
 
 		 436 aa  311  2e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  52.3 
 
 		 410 aa  307  2.0000000000000002e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  47.4 
 
 		 405 aa  305  9.000000000000001e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  49.83 
 
 		 410 aa  303  4.0000000000000003e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  45.87 
 
 		 426 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02213  proteasome regulatory particle subunit Rpt2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07050)  44.24 
 
 		 460 aa  302  6.000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0288941 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9090  predicted protein  39.47 
 
 		 431 aa  302  8.000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  47.22 
 
 		 407 aa  301  2e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54032  26S protease regulatory subunit 4 homolog (TAT-binding homolog 5)  44.04 
 
 		 434 aa  301  2e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0833723 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  43.35 
 
 		 387 aa  299  8e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  46.79 
 
 		 405 aa  298  1e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  50.17 
 
 		 425 aa  297  2e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  47.64 
 
 		 408 aa  297  2e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  47.08 
 
 		 390 aa  296  4e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  44.58 
 
 		 389 aa  296  4e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  51.26 
 
 		 465 aa  295  9e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  49.16 
 
 		 464 aa  295  1e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  44.14 
 
 		 412 aa  295  1e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  45.77 
 
 		 427 aa  292  7e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  46.8 
 
 		 389 aa  292  8e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  48.32 
 
 		 406 aa  291  1e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  50.58 
 
 		 386 aa  289  6e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  47.51 
 
 		 429 aa  289  7e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  52.26 
 
 		 414 aa  288  1e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  50 
 
 		 417 aa  288  2e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  45.16 
 
 		 379 aa  286  5.999999999999999e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1266  proteasome-activating nucleotidase  47.47 
 
 		 404 aa  285  8e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  45.18 
 
 		 422 aa  285  9e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  48.94 
 
 		 413 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  43.53 
 
 		 407 aa  282  7.000000000000001e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  50 
 
 		 415 aa  280  4e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  50.19 
 
 		 410 aa  275  1.0000000000000001e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.87 
 
 		 732 aa  240  5e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  48.97 
 
 		 739 aa  233  5e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0085  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.44 
 
 		 619 aa  231  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0128077  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.46 
 
 		 651 aa  231  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0253083  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.77 
 
 		 768 aa  231  2e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.37 
 
 		 610 aa  231  2e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.7 
 
 		 769 aa  230  3e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.66 
 
 		 639 aa  230  3e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.13 
 
 		 756 aa  230  3e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.97 
 
 		 610 aa  230  4e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.53 
 
 		 643 aa  229  9e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.58 
 
 		 662 aa  228  1e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.39 
 
 		 738 aa  228  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.35 
 
 		 781 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  43.35 
 
 		 681 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.77 
 
 		 754 aa  226  6e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.93 
 
 		 721 aa  226  8e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  46.54 
 
 		 776 aa  225  1e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.86 
 
 		 719 aa  225  1e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.64 
 
 		 630 aa  224  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0518  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.41 
 
 		 636 aa  224  2e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000475149  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.05 
 
 		 640 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.68 
 
 		 615 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.08 
 
 		 656 aa  224  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.27 
 
 		 685 aa  224  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.68 
 
 		 611 aa  224  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  43.02 
 
 		 631 aa  224  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.58 
 
 		 651 aa  224  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.34 
 
 		 614 aa  223  4e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  43.58 
 
 		 627 aa  223  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  44.49 
 
 		 803 aa  223  7e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.66 
 
 		 737 aa  223  7e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1770  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.38 
 
 		 651 aa  223  7e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.292571  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.02 
 
 		 602 aa  222  8e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  41.1 
 
 		 699 aa  222  8e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.92 
 
 		 653 aa  222  8e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>