More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1266 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1266  proteasome-activating nucleotidase  100 
 
 		 404 aa  811    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  57.53 
 
 		 413 aa  456  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  61.31 
 
 		 415 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  54.98 
 
 		 405 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  58.97 
 
 		 387 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  56.84 
 
 		 403 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  55.41 
 
 		 405 aa  444  1e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  55.38 
 
 		 405 aa  442  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  59.55 
 
 		 389 aa  444  1e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  55.76 
 
 		 404 aa  435  1e-121  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  57.54 
 
 		 386 aa  437  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  56.99 
 
 		 390 aa  431  1e-119  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  52.41 
 
 		 429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  58.08 
 
 		 406 aa  403  1e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  56.01 
 
 		 410 aa  401  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  53.87 
 
 		 407 aa  395  1e-109  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  51.02 
 
 		 407 aa  392  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  52.82 
 
 		 436 aa  391  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  51.42 
 
 		 412 aa  376  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  54.84 
 
 		 410 aa  377  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  50.88 
 
 		 412 aa  376  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  50.65 
 
 		 431 aa  373  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  52.45 
 
 		 407 aa  373  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  52.72 
 
 		 407 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  52.69 
 
 		 407 aa  373  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  56.68 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  52.49 
 
 		 404 aa  370  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  51.59 
 
 		 408 aa  365  1e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  48.6 
 
 		 412 aa  362  4e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  50.63 
 
 		 407 aa  362  6e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  48.27 
 
 		 426 aa  359  6e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  50.53 
 
 		 422 aa  347  2e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.592005 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  49.05 
 
 		 393 aa  338  9.999999999999999e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  47.97 
 
 		 379 aa  338  9.999999999999999e-92  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  47.01 
 
 		 402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  50.48 
 
 		 389 aa  313  3.9999999999999997e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  46.26 
 
 		 407 aa  311  1e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  51.67 
 
 		 398 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54032  26S protease regulatory subunit 4 homolog (TAT-binding homolog 5)  43.01 
 
 		 434 aa  310  2.9999999999999997e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0833723 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30067  predicted protein  51.16 
 
 		 403 aa  310  4e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  43.24 
 
 		 438 aa  309  5e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  54.24 
 
 		 284 aa  304  2.0000000000000002e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02213  proteasome regulatory particle subunit Rpt2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07050)  41.19 
 
 		 460 aa  302  8.000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0288941 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  46.44 
 
 		 405 aa  301  9e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  51.23 
 
 		 421 aa  300  4e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  49.67 
 
 		 425 aa  298  1e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  44.38 
 
 		 443 aa  297  2e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  51.76 
 
 		 450 aa  295  1e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  49.3 
 
 		 393 aa  293  4e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  44.02 
 
 		 389 aa  292  6e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  49.32 
 
 		 443 aa  290  3e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137848 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  47.16 
 
 		 465 aa  288  1e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  48.28 
 
 		 464 aa  288  1e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  47.6 
 
 		 427 aa  287  2e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  47.47 
 
 		 429 aa  285  8e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  49.1 
 
 		 446 aa  283  4.0000000000000003e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564069 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  43.71 
 
 		 414 aa  282  7.000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  43.88 
 
 		 417 aa  282  8.000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  48.77 
 
 		 400 aa  281  2e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  41.38 
 
 		 422 aa  280  3e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  41.24 
 
 		 416 aa  280  3e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9090  predicted protein  48.62 
 
 		 431 aa  278  1e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  47.8 
 
 		 447 aa  275  1.0000000000000001e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  43.55 
 
 		 410 aa  271  2e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.98 
 
 		 732 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  44.05 
 
 		 713 aa  258  1e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45.42 
 
 		 769 aa  258  2e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.97 
 
 		 768 aa  258  2e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.91 
 
 		 727 aa  256  4e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.69 
 
 		 723 aa  256  5e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.78 
 
 		 731 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.44 
 
 		 731 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.78 
 
 		 731 aa  253  3e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.69 
 
 		 718 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.73 
 
 		 719 aa  252  7e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.41 
 
 		 739 aa  250  2e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.28 
 
 		 731 aa  250  3e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.67 
 
 		 740 aa  250  3e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.19 
 
 		 736 aa  250  4e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.29 
 
 		 743 aa  249  4e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50 
 
 		 735 aa  249  5e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.84 
 
 		 740 aa  249  6e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.12 
 
 		 737 aa  249  8e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.73 
 
 		 757 aa  248  1e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.32 
 
 		 738 aa  248  1e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.48 
 
 		 754 aa  248  1e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  50.99 
 
 		 754 aa  248  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  54.19 
 
 		 805 aa  246  4e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.69 
 
 		 810 aa  246  4e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.38 
 
 		 738 aa  246  4e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.35 
 
 		 754 aa  246  4e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.44 
 
 		 738 aa  246  4e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.91 
 
 		 804 aa  246  6e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.09 
 
 		 805 aa  246  8e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.03 
 
 		 781 aa  246  8e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45.83 
 
 		 759 aa  244  9.999999999999999e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.91 
 
 		 742 aa  245  9.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.97 
 
 		 742 aa  245  9.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0358  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.5 
 
 		 652 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  47.19 
 
 		 775 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>