More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0358 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  63.56 
 
 
614 aa  652    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.8 
 
 
612 aa  643    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0358  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 
652 aa  1333    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  52.8 
 
 
641 aa  638    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2262  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.8 
 
 
641 aa  638    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000538209  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  54.01 
 
 
616 aa  646    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1722  peptidase M41, FtsH  75.81 
 
 
631 aa  983    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.139159 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0391  peptidase M41, FtsH  71.78 
 
 
662 aa  984    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0150338  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  60.12 
 
 
608 aa  641    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  54.52 
 
 
665 aa  639    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  76.62 
 
 
662 aa  1041    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  55.04 
 
 
637 aa  660    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.02 
 
 
637 aa  646    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.96 
 
 
612 aa  643    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1990  ATP-dependent metalloprotease FtsH  71.96 
 
 
659 aa  960    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.144891  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.01 
 
 
652 aa  645    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  53.28 
 
 
673 aa  644    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1784  ATP-dependent metalloprotease FtsH  72.93 
 
 
660 aa  942    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0518301 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.75 
 
 
621 aa  648    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0426  FtsH peptidase  78.15 
 
 
652 aa  1050    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.405966  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  57.87 
 
 
658 aa  634  1e-180  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  57.87 
 
 
660 aa  633  1e-180  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000182706  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.05 
 
 
639 aa  630  1e-179  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.28 
 
 
671 aa  630  1e-179  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.53 
 
 
676 aa  631  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.8 
 
 
617 aa  631  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.8 
 
 
637 aa  628  1e-178  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53 
 
 
630 aa  625  1e-178  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.19 
 
 
635 aa  627  1e-178  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.21 
 
 
636 aa  627  1e-178  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  56.39 
 
 
651 aa  625  1e-178  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.4 
 
 
656 aa  625  1e-178  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.4 
 
 
643 aa  623  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.6 
 
 
640 aa  622  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.23 
 
 
648 aa  619  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  51.8 
 
 
643 aa  620  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3548  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.68 
 
 
682 aa  619  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0555196  normal  0.0513542 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.1 
 
 
647 aa  620  1e-176  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  59.64 
 
 
639 aa  620  1e-176  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.59 
 
 
640 aa  617  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  51.64 
 
 
638 aa  617  1e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2460  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.77 
 
 
635 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.57 
 
 
640 aa  617  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.12 
 
 
645 aa  616  1e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.53 
 
 
645 aa  616  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0801  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.82 
 
 
651 aa  617  1e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000253513  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.97 
 
 
639 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  51.46 
 
 
681 aa  614  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  57.97 
 
 
639 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.44 
 
 
635 aa  612  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3612  ATP-dependent metalloprotease  50.82 
 
 
644 aa  612  9.999999999999999e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000242003  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1770  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.11 
 
 
651 aa  613  9.999999999999999e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.292571  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1207  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.8 
 
 
643 aa  613  9.999999999999999e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390556  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3592  ATP-dependent metalloprotease  50.82 
 
 
647 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00319823  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  53.44 
 
 
635 aa  612  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.78 
 
 
634 aa  615  9.999999999999999e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1467  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.76 
 
 
644 aa  613  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179606  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  50.82 
 
 
647 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.17 
 
 
642 aa  613  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.7 
 
 
655 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.18 
 
 
672 aa  613  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  50.9 
 
 
649 aa  612  9.999999999999999e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  50.98 
 
 
647 aa  615  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  57.97 
 
 
641 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  50.82 
 
 
647 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000163816  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  50.66 
 
 
644 aa  611  1e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.66 
 
 
647 aa  611  1e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  50.66 
 
 
647 aa  611  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  55.78 
 
 
659 aa  610  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.86 
 
 
634 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1121  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.51 
 
 
652 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000570756  unclonable  0.00000000000918847 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1197  cell division protein FtsH  55.33 
 
 
649 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.12 
 
 
652 aa  610  1e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  50.66 
 
 
644 aa  611  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3568  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.7 
 
 
657 aa  611  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000520805  hitchhiker  0.00000681699 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  51.96 
 
 
626 aa  609  1e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.55 
 
 
611 aa  608  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  50.66 
 
 
647 aa  611  1e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.17 
 
 
638 aa  612  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642505  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3424  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.51 
 
 
657 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000853792  decreased coverage  0.000155742 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3352  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.98 
 
 
654 aa  611  1e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000888182  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  50.66 
 
 
647 aa  609  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000470783  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3288  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.51 
 
 
657 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000787677  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  50.66 
 
 
644 aa  609  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000683259  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3592  ATP-dependent metalloprotease  50.49 
 
 
647 aa  608  1e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000114537  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.97 
 
 
639 aa  609  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  50.66 
 
 
644 aa  611  1e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  50.66 
 
 
644 aa  611  1e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.82 
 
 
650 aa  609  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  50.66 
 
 
647 aa  611  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2841  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.7 
 
 
657 aa  609  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000356985  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0983  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.14 
 
 
657 aa  608  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000296667  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  50.66 
 
 
647 aa  611  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  55.89 
 
 
650 aa  610  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3246  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.51 
 
 
657 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000231825  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.15 
 
 
647 aa  609  1e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3452  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.26 
 
 
660 aa  607  9.999999999999999e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380893  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  53.01 
 
 
644 aa  605  9.999999999999999e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0366  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.3 
 
 
641 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.444728  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1000  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.95 
 
 
656 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000544697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>