More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2011 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  100 
 
 		 407 aa  813    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  73.67 
 
 		 406 aa  594  1e-169  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  72.29 
 
 		 407 aa  589  1e-167  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  68.86 
 
 		 410 aa  557  1e-157  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  70.05 
 
 		 410 aa  542  1e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  64.49 
 
 		 403 aa  502  1e-141  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  63.02 
 
 		 405 aa  492  9.999999999999999e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  61.52 
 
 		 404 aa  489  1e-137  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  63.59 
 
 		 405 aa  479  1e-134  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  61.79 
 
 		 405 aa  480  1e-134  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1266  proteasome-activating nucleotidase  53.87 
 
 		 404 aa  395  1e-109  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  51.88 
 
 		 387 aa  384  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  51.4 
 
 		 413 aa  381  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  52.37 
 
 		 389 aa  376  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  53.02 
 
 		 386 aa  375  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  55.17 
 
 		 408 aa  375  1e-103  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  53.28 
 
 		 407 aa  368  1e-100  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  51.5 
 
 		 412 aa  366  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  50.75 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  51.56 
 
 		 407 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  51.27 
 
 		 407 aa  362  8e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  51.56 
 
 		 407 aa  361  1e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  49.45 
 
 		 394 aa  360  3e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  48.02 
 
 		 412 aa  360  3e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  52.87 
 
 		 390 aa  358  7e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  50.28 
 
 		 415 aa  358  7e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  47.56 
 
 		 436 aa  356  2.9999999999999997e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  50.14 
 
 		 429 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  51.63 
 
 		 412 aa  352  8e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  49.59 
 
 		 379 aa  347  2e-94  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  45.08 
 
 		 431 aa  339  5e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  47.46 
 
 		 393 aa  334  2e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  45.04 
 
 		 422 aa  332  8e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  49.85 
 
 		 426 aa  325  1e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  43.15 
 
 		 402 aa  318  1e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  45.59 
 
 		 389 aa  315  8e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  45.23 
 
 		 438 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  46.53 
 
 		 443 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  43.13 
 
 		 398 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  43.31 
 
 		 407 aa  301  2e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54032  26S protease regulatory subunit 4 homolog (TAT-binding homolog 5)  43.08 
 
 		 434 aa  300  4e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0833723 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  40.78 
 
 		 405 aa  299  7e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  49.66 
 
 		 425 aa  297  2e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  48.26 
 
 		 465 aa  296  5e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30067  predicted protein  41.19 
 
 		 403 aa  294  2e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02213  proteasome regulatory particle subunit Rpt2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07050)  40.91 
 
 		 460 aa  291  2e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0288941 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  44.32 
 
 		 389 aa  290  3e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  48.21 
 
 		 464 aa  290  4e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  48.8 
 
 		 443 aa  288  1e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9090  predicted protein  49.48 
 
 		 431 aa  286  2.9999999999999996e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  41.01 
 
 		 400 aa  286  4e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  43.24 
 
 		 447 aa  285  7e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  39.9 
 
 		 393 aa  285  8e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  49.07 
 
 		 284 aa  285  8e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  47.72 
 
 		 446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564069 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  42.4 
 
 		 414 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  48.08 
 
 		 427 aa  284  2.0000000000000002e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  40.62 
 
 		 421 aa  284  2.0000000000000002e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  46.51 
 
 		 450 aa  282  6.000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  43.53 
 
 		 429 aa  282  6.000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  42.98 
 
 		 417 aa  276  3e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  38.44 
 
 		 416 aa  272  9e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  42.98 
 
 		 422 aa  270  4e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  43.93 
 
 		 410 aa  269  8e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  49.08 
 
 		 763 aa  253  3e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.43 
 
 		 732 aa  250  3e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.08 
 
 		 754 aa  250  4e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  49.61 
 
 		 754 aa  246  6e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.72 
 
 		 723 aa  241  2e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.92 
 
 		 759 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.54 
 
 		 742 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50 
 
 		 757 aa  239  5e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.71 
 
 		 756 aa  239  5e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  49.02 
 
 		 754 aa  239  6.999999999999999e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  46.08 
 
 		 776 aa  238  1e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.93 
 
 		 769 aa  238  2e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.06 
 
 		 610 aa  238  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.74 
 
 		 718 aa  237  3e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.66 
 
 		 743 aa  236  5.0000000000000005e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.66 
 
 		 740 aa  236  6e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.79 
 
 		 768 aa  236  7e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.06 
 
 		 653 aa  235  9e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.1 
 
 		 742 aa  234  1.0000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  45.68 
 
 		 699 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.04 
 
 		 754 aa  235  1.0000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.33 
 
 		 719 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.36 
 
 		 610 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.42 
 
 		 735 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.1 
 
 		 727 aa  234  3e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  49.34 
 
 		 722 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1440  cell division protein  47.35 
 
 		 650 aa  233  4.0000000000000004e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.28 
 
 		 772 aa  233  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1506  ATP-dependent metallopeptidase HflB  47.35 
 
 		 647 aa  233  5e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.15 
 
 		 740 aa  233  6e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1784  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.34 
 
 		 660 aa  232  8.000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0518301 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  50.2 
 
 		 739 aa  231  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.54 
 
 		 721 aa  231  1e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0426  FtsH peptidase  47.95 
 
 		 652 aa  232  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.405966  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  48.16 
 
 		 703 aa  231  2e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.94 
 
 		 731 aa  231  2e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>