More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1458 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  100 
 
 		 389 aa  790    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  72.8 
 
 		 386 aa  600  1e-170  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  70.93 
 
 		 387 aa  548  1e-155  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  70.77 
 
 		 390 aa  548  1e-155  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  64.69 
 
 		 429 aa  463  1e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1266  proteasome-activating nucleotidase  59.55 
 
 		 404 aa  444  1e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  53.48 
 
 		 404 aa  408  1e-113  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  55 
 
 		 405 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  56.27 
 
 		 413 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  53.17 
 
 		 403 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  53.87 
 
 		 405 aa  404  1e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  53.89 
 
 		 405 aa  399  9.999999999999999e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  54.31 
 
 		 415 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  52.03 
 
 		 410 aa  396  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  53.15 
 
 		 412 aa  384  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  51.71 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  51.6 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  51.48 
 
 		 407 aa  379  1e-104  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  52.76 
 
 		 406 aa  379  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  51.75 
 
 		 407 aa  381  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  51.98 
 
 		 412 aa  376  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  51.51 
 
 		 410 aa  375  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  51.48 
 
 		 407 aa  378  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  52.37 
 
 		 407 aa  376  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  52.62 
 
 		 407 aa  371  1e-102  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  50.4 
 
 		 407 aa  365  1e-100  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  49.21 
 
 		 412 aa  362  6e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  50 
 
 		 426 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  51.08 
 
 		 431 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  49.06 
 
 		 408 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  49.15 
 
 		 393 aa  352  8e-96  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  50.27 
 
 		 404 aa  350  3e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  50 
 
 		 422 aa  345  8.999999999999999e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  49.17 
 
 		 379 aa  343  2.9999999999999997e-93  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  44.65 
 
 		 438 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54032  26S protease regulatory subunit 4 homolog (TAT-binding homolog 5)  42.6 
 
 		 434 aa  306  4.0000000000000004e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0833723 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  50 
 
 		 425 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  50.34 
 
 		 405 aa  301  1e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  49.03 
 
 		 450 aa  301  1e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  44.34 
 
 		 443 aa  299  7e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02213  proteasome regulatory particle subunit Rpt2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07050)  41.76 
 
 		 460 aa  298  1e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0288941 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  49.83 
 
 		 465 aa  297  2e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.110869 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  44.04 
 
 		 393 aa  296  5e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  53.28 
 
 		 446 aa  295  1e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564069 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  41.96 
 
 		 402 aa  295  1e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  42.46 
 
 		 421 aa  293  4e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  46.8 
 
 		 429 aa  292  7e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  50.56 
 
 		 284 aa  290  3e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  41.38 
 
 		 407 aa  289  8e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  47.46 
 
 		 427 aa  288  1e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  52.69 
 
 		 447 aa  287  2.9999999999999996e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  49.82 
 
 		 389 aa  286  5.999999999999999e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  52.9 
 
 		 443 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  45.58 
 
 		 464 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  50.35 
 
 		 398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  40.11 
 
 		 389 aa  282  6.000000000000001e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  40.57 
 
 		 417 aa  279  7e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  44.01 
 
 		 416 aa  276  3e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  39.83 
 
 		 400 aa  276  6e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  40.21 
 
 		 414 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30067  predicted protein  41.85 
 
 		 403 aa  272  9e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  42.6 
 
 		 410 aa  265  1e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9090  predicted protein  45.45 
 
 		 431 aa  263  4.999999999999999e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  39.32 
 
 		 422 aa  261  2e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.72 
 
 		 732 aa  261  2e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.15 
 
 		 769 aa  252  8.000000000000001e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.21 
 
 		 739 aa  251  2e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.46 
 
 		 719 aa  250  2e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50 
 
 		 731 aa  250  3e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  52.17 
 
 		 722 aa  250  3e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.81 
 
 		 727 aa  249  4e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.28 
 
 		 731 aa  249  7e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.82 
 
 		 781 aa  248  1e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.97 
 
 		 768 aa  247  2e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.46 
 
 		 781 aa  247  3e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  47.67 
 
 		 775 aa  246  4e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.06 
 
 		 784 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.65 
 
 		 730 aa  246  6.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.65 
 
 		 760 aa  246  6.999999999999999e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.46 
 
 		 800 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0518  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.74 
 
 		 636 aa  244  9.999999999999999e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000475149  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  47.55 
 
 		 764 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.88 
 
 		 723 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.1 
 
 		 718 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50 
 
 		 731 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.22 
 
 		 731 aa  244  3e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  45.45 
 
 		 763 aa  241  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  51.69 
 
 		 754 aa  241  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.33 
 
 		 737 aa  241  2e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.67 
 
 		 738 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.69 
 
 		 738 aa  240  4e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50 
 
 		 810 aa  239  4e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.62 
 
 		 735 aa  240  4e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  49.79 
 
 		 754 aa  239  5e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0091  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.84 
 
 		 625 aa  239  6.999999999999999e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00172576  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  45.26 
 
 		 713 aa  239  6.999999999999999e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.74 
 
 		 740 aa  237  2e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.21 
 
 		 738 aa  237  2e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.3 
 
 		 685 aa  237  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.22 
 
 		 697 aa  237  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>