More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1160 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  100 
 
 		 407 aa  810    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  77.34 
 
 		 406 aa  641    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  72.29 
 
 		 407 aa  589  1e-167  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  69.61 
 
 		 410 aa  569  1e-161  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  71.5 
 
 		 410 aa  554  1e-156  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  66.23 
 
 		 403 aa  505  9.999999999999999e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  62.66 
 
 		 404 aa  489  1e-137  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  64.04 
 
 		 405 aa  483  1e-135  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  64.83 
 
 		 405 aa  481  1e-134  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  60.98 
 
 		 405 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  52.49 
 
 		 387 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1266  proteasome-activating nucleotidase  51.02 
 
 		 404 aa  392  1e-108  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  51.9 
 
 		 413 aa  382  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  56.02 
 
 		 386 aa  374  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  52.62 
 
 		 389 aa  371  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  54.85 
 
 		 390 aa  360  3e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  51.22 
 
 		 415 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  53.18 
 
 		 394 aa  357  2.9999999999999997e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  49.74 
 
 		 408 aa  353  2e-96  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  49.09 
 
 		 436 aa  352  5.9999999999999994e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  50.67 
 
 		 412 aa  352  8.999999999999999e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  51.99 
 
 		 407 aa  351  1e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  50.57 
 
 		 429 aa  350  2e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  49.49 
 
 		 407 aa  350  4e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  49.49 
 
 		 407 aa  347  2e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  49.49 
 
 		 407 aa  347  3e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  46.87 
 
 		 412 aa  346  5e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  52.16 
 
 		 412 aa  345  6e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  48.32 
 
 		 404 aa  345  6e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  47.42 
 
 		 422 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  47.96 
 
 		 431 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  45.38 
 
 		 379 aa  320  1.9999999999999998e-86  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  45.61 
 
 		 393 aa  320  3e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  47.22 
 
 		 426 aa  317  2e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  47.99 
 
 		 389 aa  311  1e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  53.61 
 
 		 425 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  42.05 
 
 		 402 aa  308  8e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  46.32 
 
 		 438 aa  306  6e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  45.81 
 
 		 443 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  49.01 
 
 		 398 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  49.83 
 
 		 465 aa  303  4.0000000000000003e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  47.22 
 
 		 429 aa  301  2e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54032  26S protease regulatory subunit 4 homolog (TAT-binding homolog 5)  42.39 
 
 		 434 aa  301  2e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0833723 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  51.54 
 
 		 450 aa  300  3e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02213  proteasome regulatory particle subunit Rpt2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07050)  39.42 
 
 		 460 aa  300  4e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0288941 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  49.66 
 
 		 447 aa  296  4e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  49.83 
 
 		 464 aa  296  5e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30067  predicted protein  46.6 
 
 		 403 aa  295  8e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  50 
 
 		 427 aa  295  9e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  49.31 
 
 		 443 aa  294  2e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  49.3 
 
 		 446 aa  294  2e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564069 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  42.34 
 
 		 407 aa  292  8e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  40.68 
 
 		 405 aa  292  8e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  51.7 
 
 		 284 aa  291  2e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  43.01 
 
 		 389 aa  288  9e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  48.59 
 
 		 414 aa  280  3e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  43.38 
 
 		 417 aa  280  3e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9090  predicted protein  48.85 
 
 		 431 aa  280  5e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  40.05 
 
 		 393 aa  276  4e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  41.9 
 
 		 422 aa  276  5e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  43.97 
 
 		 410 aa  274  2.0000000000000002e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  40.73 
 
 		 400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  40.27 
 
 		 421 aa  268  1e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  55.36 
 
 		 743 aa  258  1e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.46 
 
 		 754 aa  257  3e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  55.36 
 
 		 742 aa  256  6e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  39.25 
 
 		 416 aa  254  2.0000000000000002e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  54.51 
 
 		 740 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  54.94 
 
 		 742 aa  253  5.000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.8 
 
 		 732 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.68 
 
 		 754 aa  250  2e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.63 
 
 		 754 aa  249  7e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  53.65 
 
 		 740 aa  248  1e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.39 
 
 		 763 aa  247  3e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45.08 
 
 		 754 aa  246  4e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.85 
 
 		 757 aa  245  9e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  54.22 
 
 		 776 aa  245  9.999999999999999e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  49.81 
 
 		 739 aa  240  4e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.46 
 
 		 610 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.4 
 
 		 769 aa  239  8e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.46 
 
 		 610 aa  239  8e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  46.67 
 
 		 713 aa  238  1e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  49.4 
 
 		 703 aa  238  1e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.65 
 
 		 718 aa  237  3e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.59 
 
 		 731 aa  237  3e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.6 
 
 		 731 aa  236  4e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.74 
 
 		 756 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.81 
 
 		 723 aa  236  6e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.2 
 
 		 731 aa  236  6e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  50.22 
 
 		 722 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.51 
 
 		 739 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.66 
 
 		 768 aa  234  3e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  47.64 
 
 		 775 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.19 
 
 		 738 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.77 
 
 		 738 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.54 
 
 		 701 aa  233  5e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.8 
 
 		 731 aa  233  5e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.51 
 
 		 653 aa  233  6e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.33 
 
 		 798 aa  233  6e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  51.93 
 
 		 754 aa  232  9e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>