More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1761 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  98.77 
 
 		 407 aa  807    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  100 
 
 		 407 aa  813    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  89.43 
 
 		 407 aa  739    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  97.79 
 
 		 407 aa  801    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  70.9 
 
 		 408 aa  585  1e-166  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  57.11 
 
 		 412 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  59.33 
 
 		 436 aa  443  1e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  55.53 
 
 		 412 aa  435  1e-121  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  55.35 
 
 		 431 aa  428  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  56.22 
 
 		 412 aa  427  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  55.53 
 
 		 394 aa  426  1e-118  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  55.13 
 
 		 404 aa  424  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  52.58 
 
 		 426 aa  421  1e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  53.06 
 
 		 422 aa  398  1e-109  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.592005 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  53.33 
 
 		 393 aa  385  1e-106  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  54.27 
 
 		 379 aa  388  1e-106  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  50.65 
 
 		 405 aa  380  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  52.19 
 
 		 405 aa  376  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  50 
 
 		 403 aa  375  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  51.48 
 
 		 389 aa  378  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  51.6 
 
 		 405 aa  375  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1266  proteasome-activating nucleotidase  52.69 
 
 		 404 aa  373  1e-102  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  48.85 
 
 		 404 aa  363  2e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  49.74 
 
 		 387 aa  363  4e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  51.56 
 
 		 407 aa  361  1e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  49.21 
 
 		 393 aa  359  4e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  51.97 
 
 		 410 aa  358  9e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  51.82 
 
 		 405 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02213  proteasome regulatory particle subunit Rpt2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07050)  48 
 
 		 460 aa  355  6.999999999999999e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0288941 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  49.16 
 
 		 400 aa  354  2e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  48.53 
 
 		 386 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  60.71 
 
 		 410 aa  353  5e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  50.41 
 
 		 406 aa  351  1e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  45.5 
 
 		 402 aa  350  2e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  50.45 
 
 		 421 aa  350  3e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  49.85 
 
 		 443 aa  348  1e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  50.27 
 
 		 390 aa  348  1e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  49.49 
 
 		 407 aa  347  3e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54032  26S protease regulatory subunit 4 homolog (TAT-binding homolog 5)  48.66 
 
 		 434 aa  343  2e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0833723 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  48.91 
 
 		 429 aa  343  4e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  49.26 
 
 		 438 aa  342  9e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  51.25 
 
 		 416 aa  339  5e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  46.01 
 
 		 414 aa  338  8e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  51.17 
 
 		 415 aa  333  5e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  46.51 
 
 		 413 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  41.97 
 
 		 389 aa  330  4e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  48.91 
 
 		 446 aa  330  4e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564069 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  45.94 
 
 		 425 aa  327  3e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  44.15 
 
 		 407 aa  327  3e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  52.13 
 
 		 450 aa  326  6e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  48.62 
 
 		 389 aa  322  9.000000000000001e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  42.32 
 
 		 464 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  50.16 
 
 		 447 aa  321  1.9999999999999998e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  44.69 
 
 		 417 aa  320  3e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  46.07 
 
 		 398 aa  320  3e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  50.32 
 
 		 427 aa  320  3e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  50.33 
 
 		 429 aa  320  3e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  50.32 
 
 		 465 aa  317  2e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.110869 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  43.99 
 
 		 422 aa  313  2.9999999999999996e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9090  predicted protein  50 
 
 		 431 aa  313  2.9999999999999996e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30067  predicted protein  43.52 
 
 		 403 aa  313  3.9999999999999997e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  46.82 
 
 		 410 aa  312  7.999999999999999e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  47.45 
 
 		 443 aa  310  2e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  54.84 
 
 		 284 aa  305  9.000000000000001e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.38 
 
 		 732 aa  262  8e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  51.37 
 
 		 775 aa  260  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.85 
 
 		 738 aa  258  9e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.18 
 
 		 768 aa  258  1e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.53 
 
 		 739 aa  258  1e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.41 
 
 		 719 aa  258  1e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  50.37 
 
 		 754 aa  257  3e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.3 
 
 		 781 aa  256  4e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.3 
 
 		 800 aa  256  5e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.92 
 
 		 784 aa  256  6e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  54.59 
 
 		 713 aa  256  6e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  54.63 
 
 		 721 aa  256  6e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.98 
 
 		 731 aa  255  9e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  48.5 
 
 		 722 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  42.35 
 
 		 754 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.52 
 
 		 742 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.83 
 
 		 731 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  54.15 
 
 		 715 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  53.19 
 
 		 769 aa  253  6e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.64 
 
 		 639 aa  252  8.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.52 
 
 		 740 aa  250  3e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  55.95 
 
 		 727 aa  250  3e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.89 
 
 		 743 aa  250  3e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.82 
 
 		 731 aa  249  4e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.94 
 
 		 701 aa  249  5e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.63 
 
 		 754 aa  249  6e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.1 
 
 		 709 aa  249  8e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.74 
 
 		 610 aa  248  1e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.92 
 
 		 781 aa  248  1e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.64 
 
 		 731 aa  248  1e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.89 
 
 		 742 aa  248  2e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.62 
 
 		 737 aa  248  2e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.65 
 
 		 730 aa  247  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.02 
 
 		 614 aa  248  2e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.6 
 
 		 718 aa  248  2e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50 
 
 		 740 aa  247  2e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>