More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2393 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1180  cell division protein FtsH  83.03 
 
 
617 aa  1069    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334987  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1012  ATP-dependent metalloprotease FtsH  70.2 
 
 
616 aa  892    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1229  cell division protein  61.85 
 
 
646 aa  795    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2393  FtsH peptidase  100 
 
 
619 aa  1259    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00023499  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  76.51 
 
 
617 aa  976    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00193369  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3248  ATP-dependent metalloprotease FtsH  70.89 
 
 
616 aa  894    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2884  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.73 
 
 
623 aa  901    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402765  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0272  peptidase M41, FtsH  52.33 
 
 
639 aa  619  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.520053  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.46 
 
 
671 aa  620  1e-176  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  52.61 
 
 
614 aa  615  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  53.1 
 
 
608 aa  618  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.5 
 
 
612 aa  618  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.34 
 
 
612 aa  615  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.24 
 
 
637 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.78 
 
 
621 aa  615  9.999999999999999e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.78 
 
 
656 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.89 
 
 
676 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1223  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.22 
 
 
651 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.514183  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  54.04 
 
 
649 aa  599  1e-170  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  52.15 
 
 
665 aa  600  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.03 
 
 
640 aa  600  1e-170  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0172  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.04 
 
 
646 aa  600  1e-170  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.75 
 
 
648 aa  599  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.9 
 
 
652 aa  600  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  53.87 
 
 
644 aa  597  1e-169  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  51.8 
 
 
616 aa  597  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.23 
 
 
637 aa  595  1e-169  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  50.49 
 
 
764 aa  598  1e-169  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.41 
 
 
643 aa  597  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1207  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.61 
 
 
643 aa  592  1e-168  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390556  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.54 
 
 
636 aa  592  1e-168  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.22 
 
 
645 aa  594  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.37 
 
 
617 aa  593  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  50.57 
 
 
681 aa  590  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.81 
 
 
635 aa  589  1e-167  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.76 
 
 
645 aa  590  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  50.81 
 
 
635 aa  589  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  51.24 
 
 
637 aa  589  1e-167  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.84 
 
 
647 aa  589  1e-167  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.47 
 
 
635 aa  586  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2460  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.65 
 
 
635 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.23 
 
 
652 aa  586  1e-166  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  50 
 
 
647 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  50 
 
 
647 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  51.14 
 
 
626 aa  585  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  50.32 
 
 
647 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3592  ATP-dependent metalloprotease  50.16 
 
 
647 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00319823  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  50.16 
 
 
647 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  50.16 
 
 
647 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000163816  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0366  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.96 
 
 
641 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.444728  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  50 
 
 
644 aa  581  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 
647 aa  581  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.41 
 
 
641 aa  579  1e-164  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  50 
 
 
647 aa  581  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  50 
 
 
644 aa  581  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3592  ATP-dependent metalloprotease  49.84 
 
 
647 aa  579  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000114537  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  51.71 
 
 
650 aa  581  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  49.35 
 
 
647 aa  580  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000470783  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  50 
 
 
641 aa  580  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3612  ATP-dependent metalloprotease  49.84 
 
 
644 aa  578  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000242003  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  49.35 
 
 
644 aa  579  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000683259  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  50 
 
 
644 aa  581  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  50 
 
 
647 aa  581  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.65 
 
 
634 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 
650 aa  580  1e-164  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2262  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 
641 aa  580  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000538209  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.41 
 
 
639 aa  581  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.27 
 
 
640 aa  581  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  49.76 
 
 
649 aa  582  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  49.43 
 
 
639 aa  578  1e-164  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0983  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.65 
 
 
657 aa  580  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000296667  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.27 
 
 
643 aa  580  1e-164  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  50 
 
 
644 aa  581  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  49.59 
 
 
638 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.43 
 
 
640 aa  575  1.0000000000000001e-163  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6874  cell division protein FtsH  52.41 
 
 
638 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0972491 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.06 
 
 
640 aa  578  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.51 
 
 
639 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  49.51 
 
 
639 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2841  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.89 
 
 
657 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000356985  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  49.59 
 
 
641 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3985  ATP-dependent metalloprotease  49.19 
 
 
647 aa  577  1.0000000000000001e-163  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000069949  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3288  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.06 
 
 
657 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000787677  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  49.84 
 
 
643 aa  576  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0483  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.65 
 
 
631 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000161272  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1121  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.06 
 
 
652 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000570756  unclonable  0.00000000000918847 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3352  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.67 
 
 
654 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000888182  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3246  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.06 
 
 
657 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000231825  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3424  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.06 
 
 
657 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000853792  decreased coverage  0.000155742 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1770  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.43 
 
 
651 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.292571  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0801  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.84 
 
 
651 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000253513  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  50.16 
 
 
641 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1197  cell division protein FtsH  50.4 
 
 
649 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 
630 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 
655 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.84 
 
 
638 aa  574  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642505  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1990  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.47 
 
 
659 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.144891  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1019  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.41 
 
 
657 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000780208  hitchhiker  0.000608132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1084  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.4 
 
 
657 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000445375  normal  0.0888545 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  49.35 
 
 
673 aa  572  1.0000000000000001e-162  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>