More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0272 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1180  cell division protein FtsH  52.03 
 
 		 617 aa  643    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334987  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.7 
 
 		 633 aa  676    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33311  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0272  peptidase M41, FtsH  100 
 
 		 639 aa  1291    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.520053  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.39 
 
 		 617 aa  630  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00193369  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.8 
 
 		 652 aa  629  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2393  FtsH peptidase  52.24 
 
 		 619 aa  619  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00023499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3248  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.61 
 
 		 616 aa  615  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.08 
 
 		 621 aa  617  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1012  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.03 
 
 		 616 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  51.95 
 
 		 614 aa  611  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.71 
 
 		 650 aa  610  1e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.997433  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  51.82 
 
 		 608 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1229  cell division protein  49.51 
 
 		 646 aa  598  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  51.03 
 
 		 665 aa  598  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  50.96 
 
 		 681 aa  599  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  51.89 
 
 		 644 aa  598  1e-169  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1223  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.4 
 
 		 651 aa  597  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.514183  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  49.67 
 
 		 626 aa  597  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.01 
 
 		 648 aa  597  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.01 
 
 		 643 aa  598  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  51.73 
 
 		 649 aa  596  1e-169  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2884  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.92 
 
 		 623 aa  596  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402765  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.4 
 
 		 671 aa  592  1e-168  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.78 
 
 		 639 aa  595  1e-168  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  51.63 
 
 		 616 aa  594  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  48.61 
 
 		 764 aa  592  1e-168  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.74 
 
 		 637 aa  592  1e-168  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  51.24 
 
 		 637 aa  593  1e-168  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.81 
 
 		 645 aa  593  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.92 
 
 		 676 aa  593  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.32 
 
 		 640 aa  589  1e-167  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.57 
 
 		 656 aa  591  1e-167  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.27 
 
 		 645 aa  590  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.25 
 
 		 612 aa  589  1e-167  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0483  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.25 
 
 		 631 aa  588  1e-167  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000161272  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.41 
 
 		 612 aa  591  1e-167  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0706  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.46 
 
 		 618 aa  586  1e-166  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.437381 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.68 
 
 		 647 aa  587  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.73 
 
 		 642 aa  588  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.33 
 
 		 635 aa  588  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  49.5 
 
 		 638 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.81 
 
 		 636 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.11 
 
 		 647 aa  585  1.0000000000000001e-165  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.57 
 
 		 642 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.57 
 
 		 642 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.24 
 
 		 640 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.4 
 
 		 617 aa  579  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.52 
 
 		 643 aa  580  1e-164  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.35 
 
 		 640 aa  580  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3615  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.1 
 
 		 640 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0280177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.76 
 
 		 630 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.09 
 
 		 615 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 		 647 aa  577  1.0000000000000001e-163  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.4 
 
 		 652 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  49.26 
 
 		 641 aa  575  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.75 
 
 		 638 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0714  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.52 
 
 		 634 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.87442  normal  0.0617842 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0172  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.74 
 
 		 646 aa  571  1e-161  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1020  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.3 
 
 		 659 aa  568  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000208375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.58 
 
 		 638 aa  571  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5471  cell division protein FtsH  48.24 
 
 		 642 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62860  cell division protein FtsH  48.24 
 
 		 639 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.51 
 
 		 640 aa  566  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.26 
 
 		 635 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2460  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.26 
 
 		 635 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.57 
 
 		 640 aa  568  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  48.26 
 
 		 635 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.41 
 
 		 638 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.59 
 
 		 673 aa  566  1e-160  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  47.79 
 
 		 660 aa  567  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000182706  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4718  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.35 
 
 		 637 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518421  normal  0.0121069 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4584  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.35 
 
 		 634 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4187  peptidase M41, FtsH  46.93 
 
 		 634 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000128423  normal  0.66671 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.13 
 
 		 637 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.17 
 
 		 634 aa  565  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1133  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.77 
 
 		 630 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0177636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0772  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.31 
 
 		 635 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000087079  normal  0.0618887 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6874  cell division protein FtsH  49.07 
 
 		 638 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0972491 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  47.38 
 
 		 658 aa  562  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.42 
 
 		 631 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1506  ATP-dependent metallopeptidase HflB  49.75 
 
 		 647 aa  565  1.0000000000000001e-159  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.2 
 
 		 655 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.312439  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.75 
 
 		 638 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.59 
 
 		 640 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4719  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.35 
 
 		 634 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42890  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.35 
 
 		 637 aa  564  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1990  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.57 
 
 		 659 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.144891  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0358  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.89 
 
 		 652 aa  560  1e-158  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4497  cell division protein FtsH  47.1 
 
 		 634 aa  561  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.554573  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  49.49 
 
 		 640 aa  561  1e-158  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.97 
 
 		 607 aa  560  1e-158  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1770  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.56 
 
 		 651 aa  561  1e-158  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.292571  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.07 
 
 		 638 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1207  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.17 
 
 		 643 aa  560  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1440  cell division protein  49.59 
 
 		 650 aa  561  1e-158  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2262  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.93 
 
 		 641 aa  561  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000538209  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  47.8 
 
 		 647 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  47.93 
 
 		 641 aa  561  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  47.02 
 
 		 651 aa  556  1e-157  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  47.43 
 
 		 647 aa  555  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>