More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1990 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  52.64 
 
 
614 aa  638    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0358  ATP-dependent metalloprotease FtsH  72.11 
 
 
652 aa  956    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1784  ATP-dependent metalloprotease FtsH  78.18 
 
 
660 aa  1024    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0518301 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1722  peptidase M41, FtsH  73.38 
 
 
631 aa  929    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.139159 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0391  peptidase M41, FtsH  68.72 
 
 
662 aa  899    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0150338  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  72.97 
 
 
662 aa  968    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  52.72 
 
 
637 aa  637    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1990  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 
659 aa  1344    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.144891  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0426  FtsH peptidase  71.19 
 
 
652 aa  940    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.405966  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  52.21 
 
 
616 aa  635  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.72 
 
 
673 aa  635  1e-180  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.37 
 
 
612 aa  628  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.95 
 
 
621 aa  630  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.64 
 
 
637 aa  626  1e-178  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  59.34 
 
 
608 aa  628  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.05 
 
 
612 aa  628  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.05 
 
 
639 aa  622  1e-177  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.48 
 
 
671 aa  622  1e-177  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  50.82 
 
 
665 aa  620  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.31 
 
 
630 aa  615  1e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.96 
 
 
637 aa  617  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  49.75 
 
 
640 aa  617  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.44 
 
 
617 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  49.84 
 
 
641 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  50.64 
 
 
660 aa  614  9.999999999999999e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000182706  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2262  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.84 
 
 
641 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000538209  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  50.57 
 
 
627 aa  612  9.999999999999999e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.41 
 
 
634 aa  613  9.999999999999999e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.63 
 
 
652 aa  613  9.999999999999999e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  51.88 
 
 
650 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1197  cell division protein FtsH  51.48 
 
 
649 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0703  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.27 
 
 
650 aa  609  1e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0142787  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  50.74 
 
 
658 aa  608  1e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.64 
 
 
620 aa  610  1e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.84 
 
 
635 aa  611  1e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.48 
 
 
656 aa  610  1e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.59 
 
 
647 aa  608  1e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.59 
 
 
639 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.98 
 
 
655 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  50.65 
 
 
638 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  50.49 
 
 
651 aa  606  9.999999999999999e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  51.8 
 
 
659 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  51.39 
 
 
626 aa  607  9.999999999999999e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  50.66 
 
 
641 aa  606  9.999999999999999e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  49.59 
 
 
639 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.41 
 
 
639 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  49.43 
 
 
641 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3568  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.23 
 
 
657 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000520805  hitchhiker  0.00000681699 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.41 
 
 
640 aa  608  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.43 
 
 
638 aa  606  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642505  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.89 
 
 
615 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1084  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.31 
 
 
657 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000445375  normal  0.0888545 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0983  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.9 
 
 
657 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000296667  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.27 
 
 
640 aa  607  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.16 
 
 
642 aa  607  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1121  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.06 
 
 
652 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000570756  unclonable  0.00000000000918847 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2841  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.15 
 
 
657 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000356985  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3246  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.06 
 
 
657 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000231825  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3424  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.06 
 
 
657 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000853792  decreased coverage  0.000155742 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1207  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.26 
 
 
643 aa  604  1.0000000000000001e-171  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390556  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1019  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.15 
 
 
657 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000780208  hitchhiker  0.000608132 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3288  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.06 
 
 
657 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000787677  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.14 
 
 
611 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3548  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.8 
 
 
682 aa  603  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0555196  normal  0.0513542 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1023  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.15 
 
 
657 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000161981  hitchhiker  0.0000832625 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.27 
 
 
642 aa  598  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.27 
 
 
640 aa  599  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.57 
 
 
635 aa  601  1e-170  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.82 
 
 
655 aa  600  1e-170  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1506  ATP-dependent metallopeptidase HflB  51.23 
 
 
647 aa  599  1e-170  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  50.57 
 
 
635 aa  601  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.08 
 
 
676 aa  600  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1000  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.66 
 
 
656 aa  601  1e-170  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000544697  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  51.31 
 
 
639 aa  601  1e-170  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2460  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.41 
 
 
635 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.75 
 
 
672 aa  596  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.97 
 
 
634 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1467  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.58 
 
 
644 aa  596  1e-169  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179606  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  50 
 
 
681 aa  597  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.82 
 
 
610 aa  596  1e-169  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.41 
 
 
645 aa  596  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.57 
 
 
636 aa  597  1e-169  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1440  cell division protein  51.07 
 
 
650 aa  598  1e-169  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.66 
 
 
608 aa  592  1e-168  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1770  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.57 
 
 
651 aa  592  1e-168  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.292571  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.66 
 
 
610 aa  595  1e-168  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.91 
 
 
630 aa  592  1e-168  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.11 
 
 
642 aa  594  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0483  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.5 
 
 
631 aa  594  1e-168  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000161272  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.66 
 
 
640 aa  592  1e-168  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.11 
 
 
642 aa  594  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.11 
 
 
640 aa  594  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.5 
 
 
631 aa  592  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0074  cell division protein  57.01 
 
 
645 aa  592  1e-168  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.99 
 
 
647 aa  593  1e-168  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.07 
 
 
651 aa  592  1e-168  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.42 
 
 
648 aa  595  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.16 
 
 
650 aa  593  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000774852  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.45 
 
 
607 aa  592  1e-168  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3615  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.24 
 
 
640 aa  595  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0280177  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>