More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0172 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0172  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 
646 aa  1308    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5435  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.19 
 
 
749 aa  642    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7198  Microtubule-severing ATPase  54.41 
 
 
663 aa  614  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0849577  normal  0.0429658 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  53.31 
 
 
649 aa  605  9.999999999999999e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1223  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.96 
 
 
651 aa  606  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.514183  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  53.14 
 
 
644 aa  603  1.0000000000000001e-171  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  52.94 
 
 
616 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0706  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.99 
 
 
618 aa  600  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.437381 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  50.9 
 
 
681 aa  601  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.87 
 
 
643 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.87 
 
 
648 aa  598  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2393  FtsH peptidase  49.92 
 
 
619 aa  598  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00023499  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.81 
 
 
621 aa  597  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.96 
 
 
645 aa  593  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.98 
 
 
645 aa  593  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.74 
 
 
652 aa  593  1e-168  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.18 
 
 
676 aa  589  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1180  cell division protein FtsH  50.49 
 
 
617 aa  588  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  51 
 
 
614 aa  588  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.24 
 
 
612 aa  587  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  49.83 
 
 
608 aa  585  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  49.42 
 
 
764 aa  586  1e-166  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.51 
 
 
610 aa  587  1e-166  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.51 
 
 
610 aa  588  1e-166  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  51.06 
 
 
639 aa  588  1e-166  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.12 
 
 
639 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.58 
 
 
617 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00193369  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.89 
 
 
671 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.08 
 
 
612 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  49.59 
 
 
640 aa  578  1e-164  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2884  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.43 
 
 
623 aa  580  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402765  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  50.65 
 
 
641 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3248  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.73 
 
 
616 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2262  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.65 
 
 
641 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000538209  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.15 
 
 
656 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  50.83 
 
 
665 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.08 
 
 
647 aa  577  1.0000000000000001e-163  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.33 
 
 
640 aa  576  1.0000000000000001e-163  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1012  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.97 
 
 
616 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.13 
 
 
638 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.08 
 
 
640 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1229  cell division protein  49.12 
 
 
646 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.25 
 
 
607 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.75 
 
 
642 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1770  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.27 
 
 
651 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.292571  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.75 
 
 
642 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.16 
 
 
635 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.53 
 
 
636 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1207  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52 
 
 
643 aa  574  1.0000000000000001e-162  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390556  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.01 
 
 
643 aa  568  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1133  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.17 
 
 
630 aa  569  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0177636  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.99 
 
 
640 aa  571  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0483  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.84 
 
 
631 aa  569  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000161272  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.78 
 
 
638 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  50.33 
 
 
627 aa  570  1e-161  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.59 
 
 
642 aa  571  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  49.17 
 
 
659 aa  568  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0366  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.99 
 
 
641 aa  571  1e-161  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.444728  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.34 
 
 
637 aa  569  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.74 
 
 
617 aa  567  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  48.39 
 
 
639 aa  565  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0272  peptidase M41, FtsH  50.58 
 
 
639 aa  566  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.520053  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.39 
 
 
639 aa  565  1e-160  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.81 
 
 
662 aa  565  1e-160  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0703  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.6 
 
 
650 aa  565  1e-160  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0142787  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1506  ATP-dependent metallopeptidase HflB  51.45 
 
 
647 aa  567  1e-160  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.43 
 
 
638 aa  567  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  49.84 
 
 
637 aa  566  1e-160  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.27 
 
 
637 aa  567  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  48.87 
 
 
641 aa  566  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.85 
 
 
633 aa  568  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33311  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.06 
 
 
640 aa  563  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.85 
 
 
615 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.9 
 
 
635 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  50.6 
 
 
640 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  49.83 
 
 
641 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1722  peptidase M41, FtsH  48.01 
 
 
631 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.139159 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.39 
 
 
642 aa  561  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  50.9 
 
 
635 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.86 
 
 
638 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.95 
 
 
640 aa  564  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.69 
 
 
640 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.61 
 
 
638 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.87 
 
 
638 aa  563  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642505  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49 
 
 
641 aa  564  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1440  cell division protein  49.84 
 
 
650 aa  565  1.0000000000000001e-159  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2460  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.9 
 
 
635 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.69 
 
 
640 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.4 
 
 
634 aa  560  1e-158  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  50.17 
 
 
638 aa  559  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.42 
 
 
630 aa  560  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3568  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.92 
 
 
657 aa  560  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000520805  hitchhiker  0.00000681699 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2842  cell division protease ftsH  49.51 
 
 
639 aa  558  1e-158  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2711  cell division protease ftsH  49.51 
 
 
639 aa  558  1e-158  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0358  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.36 
 
 
652 aa  559  1e-158  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  51.56 
 
 
626 aa  559  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.63 
 
 
640 aa  561  1e-158  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.36 
 
 
647 aa  559  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.75 
 
 
651 aa  561  1e-158  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1571  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.1 
 
 
656 aa  559  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000144806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>