More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7198 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7198  Microtubule-severing ATPase  100 
 
 
663 aa  1327    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0849577  normal  0.0429658 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5435  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.39 
 
 
749 aa  632  1e-180  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0172  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.17 
 
 
646 aa  632  1e-180  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  49.75 
 
 
638 aa  559  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.51 
 
 
637 aa  546  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  50.08 
 
 
616 aa  548  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.25 
 
 
647 aa  547  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  49.01 
 
 
639 aa  544  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.68 
 
 
640 aa  543  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.01 
 
 
639 aa  544  1e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  49.09 
 
 
640 aa  542  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  48.28 
 
 
639 aa  543  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  48.59 
 
 
641 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  49.91 
 
 
626 aa  540  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.66 
 
 
639 aa  539  9.999999999999999e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.6 
 
 
642 aa  540  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1506  ATP-dependent metallopeptidase HflB  48.51 
 
 
647 aa  541  9.999999999999999e-153  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1180  cell division protein FtsH  48.92 
 
 
617 aa  537  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  47.52 
 
 
614 aa  538  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.34 
 
 
638 aa  537  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642505  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.93 
 
 
676 aa  538  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  46.96 
 
 
764 aa  536  1e-151  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.26 
 
 
640 aa  537  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.61 
 
 
617 aa  536  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00193369  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.52 
 
 
645 aa  535  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1440  cell division protein  47.94 
 
 
650 aa  537  1e-151  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3452  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.71 
 
 
660 aa  533  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380893  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  48.25 
 
 
641 aa  533  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.25 
 
 
671 aa  532  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.43 
 
 
639 aa  533  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.55 
 
 
621 aa  534  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1770  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.02 
 
 
651 aa  531  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.292571  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.95 
 
 
640 aa  530  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.39 
 
 
648 aa  531  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  46.93 
 
 
608 aa  529  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  49.92 
 
 
665 aa  531  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.09 
 
 
638 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.7 
 
 
643 aa  529  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  45.45 
 
 
681 aa  530  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48 
 
 
630 aa  529  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.23 
 
 
645 aa  530  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.74 
 
 
638 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1990  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.46 
 
 
659 aa  528  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.144891  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.43 
 
 
634 aa  527  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0801  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.17 
 
 
651 aa  526  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000253513  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.07 
 
 
640 aa  526  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1133  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.05 
 
 
630 aa  527  1e-148  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0177636  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  48 
 
 
640 aa  526  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  47.5 
 
 
647 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  47.02 
 
 
660 aa  527  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000182706  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0811  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.99 
 
 
663 aa  525  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.569146  hitchhiker  0.0043584 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.52 
 
 
638 aa  526  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  47.5 
 
 
647 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000163816  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.52 
 
 
612 aa  527  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.37 
 
 
642 aa  526  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0983  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.45 
 
 
657 aa  525  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000296667  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3592  ATP-dependent metalloprotease  47.5 
 
 
647 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00319823  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.13 
 
 
612 aa  527  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  47.67 
 
 
647 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.6 
 
 
655 aa  527  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  47.75 
 
 
644 aa  522  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.75 
 
 
647 aa  522  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  47.33 
 
 
647 aa  522  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000470783  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.37 
 
 
642 aa  524  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3248  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.42 
 
 
616 aa  523  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  48.46 
 
 
649 aa  522  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  47.75 
 
 
644 aa  522  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.52 
 
 
640 aa  525  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.62 
 
 
610 aa  522  1e-147  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3352  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.09 
 
 
654 aa  522  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000888182  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.63 
 
 
655 aa  525  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  47.75 
 
 
644 aa  522  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  46.69 
 
 
658 aa  524  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  47.75 
 
 
644 aa  522  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.57 
 
 
638 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1262  FtsH peptidase  46.98 
 
 
629 aa  523  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.37 
 
 
642 aa  524  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  47.75 
 
 
647 aa  522  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.92 
 
 
638 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  46.52 
 
 
659 aa  524  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  47.75 
 
 
647 aa  522  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.27 
 
 
637 aa  524  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1571  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.45 
 
 
656 aa  523  1e-147  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000144806  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.12 
 
 
652 aa  525  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  46.94 
 
 
612 aa  522  1e-147  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3568  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.94 
 
 
657 aa  523  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000520805  hitchhiker  0.00000681699 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  47.33 
 
 
647 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  47.27 
 
 
650 aa  525  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  48.29 
 
 
644 aa  521  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2262  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.83 
 
 
641 aa  519  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000538209  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3424  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.95 
 
 
657 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000853792  decreased coverage  0.000155742 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2841  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.95 
 
 
657 aa  521  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000356985  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.97 
 
 
631 aa  521  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1615  cell division protein FtsH  47.14 
 
 
628 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24975  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0483  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.33 
 
 
631 aa  521  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000161272  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2776  cell division protein FtsH  46.97 
 
 
628 aa  521  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182791  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3985  ATP-dependent metalloprotease  47.17 
 
 
647 aa  520  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000069949  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.34 
 
 
615 aa  520  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1512  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.14 
 
 
628 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0580139  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3612  ATP-dependent metalloprotease  47.51 
 
 
644 aa  520  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000242003  normal  0.275176 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>