More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2884 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1180  cell division protein FtsH  69.97 
 
 
617 aa  909    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334987  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1229  cell division protein  59.25 
 
 
646 aa  742    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2393  FtsH peptidase  68.73 
 
 
619 aa  886    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00023499  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3248  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.88 
 
 
616 aa  863    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  72.77 
 
 
617 aa  922    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00193369  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2884  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 
623 aa  1269    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402765  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1012  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.71 
 
 
616 aa  864    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  51.47 
 
 
614 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.01 
 
 
636 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.07 
 
 
676 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.73 
 
 
621 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.08 
 
 
612 aa  598  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.74 
 
 
637 aa  597  1e-169  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.92 
 
 
612 aa  594  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  50.08 
 
 
608 aa  590  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.44 
 
 
671 aa  590  1e-167  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0272  peptidase M41, FtsH  49.92 
 
 
639 aa  585  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.520053  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  50.65 
 
 
665 aa  578  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 
635 aa  581  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.79 
 
 
656 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.57 
 
 
617 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.76 
 
 
652 aa  578  1.0000000000000001e-163  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  49.67 
 
 
673 aa  576  1.0000000000000001e-163  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48 
 
 
635 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  48 
 
 
635 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0172  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.1 
 
 
646 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2460  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.16 
 
 
635 aa  575  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.03 
 
 
647 aa  571  1e-161  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.51 
 
 
634 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  48.47 
 
 
616 aa  566  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.88 
 
 
640 aa  567  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.17 
 
 
607 aa  568  1e-160  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  48.3 
 
 
649 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  47.61 
 
 
637 aa  563  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.22 
 
 
645 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  47.45 
 
 
764 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.34 
 
 
650 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.46 
 
 
642 aa  559  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  48.3 
 
 
647 aa  561  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000470783  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  48.85 
 
 
647 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000163816  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.75 
 
 
643 aa  561  1e-158  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3985  ATP-dependent metalloprotease  48.14 
 
 
647 aa  559  1e-158  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000069949  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  48.68 
 
 
641 aa  559  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.46 
 
 
642 aa  561  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  48.3 
 
 
644 aa  561  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000683259  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.46 
 
 
642 aa  559  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.66 
 
 
640 aa  560  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  48.85 
 
 
647 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3592  ATP-dependent metalloprotease  48.85 
 
 
647 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00319823  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  48.68 
 
 
647 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  48.68 
 
 
644 aa  557  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.68 
 
 
647 aa  557  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  48.68 
 
 
644 aa  556  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3452  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.25 
 
 
660 aa  558  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380893  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.17 
 
 
640 aa  555  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  47.48 
 
 
626 aa  556  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3044  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.47 
 
 
646 aa  555  1e-157  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000897526  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  48.68 
 
 
647 aa  557  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0391  peptidase M41, FtsH  47.98 
 
 
662 aa  556  1e-157  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0150338  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  48.68 
 
 
644 aa  557  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1207  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.17 
 
 
643 aa  558  1e-157  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390556  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  48.68 
 
 
644 aa  557  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  48.68 
 
 
647 aa  558  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.23 
 
 
640 aa  557  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  48.68 
 
 
647 aa  557  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  46.47 
 
 
639 aa  555  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.47 
 
 
639 aa  555  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  48.68 
 
 
647 aa  557  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3352  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.52 
 
 
654 aa  555  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000888182  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  48.14 
 
 
643 aa  556  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  47.49 
 
 
638 aa  553  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0358  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.63 
 
 
652 aa  552  1e-156  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1223  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.15 
 
 
651 aa  553  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.514183  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2842  cell division protease ftsH  49.76 
 
 
639 aa  554  1e-156  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2711  cell division protease ftsH  49.76 
 
 
639 aa  554  1e-156  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  48.76 
 
 
650 aa  552  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  46.55 
 
 
641 aa  554  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3592  ATP-dependent metalloprotease  48.52 
 
 
647 aa  555  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000114537  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.11 
 
 
640 aa  553  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1770  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.19 
 
 
651 aa  554  1e-156  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.292571  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3612  ATP-dependent metalloprotease  47.86 
 
 
644 aa  552  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000242003  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.68 
 
 
640 aa  554  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  49.31 
 
 
644 aa  549  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  49.48 
 
 
649 aa  551  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0801  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.19 
 
 
651 aa  549  1e-155  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000253513  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.43 
 
 
639 aa  551  1e-155  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0366  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.67 
 
 
641 aa  551  1e-155  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.444728  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.4 
 
 
640 aa  548  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.91 
 
 
643 aa  548  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0706  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.43 
 
 
618 aa  550  1e-155  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.437381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6874  cell division protein FtsH  49.41 
 
 
638 aa  550  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0972491 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0983  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.78 
 
 
657 aa  549  1e-155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000296667  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.13 
 
 
637 aa  551  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0426  FtsH peptidase  48.48 
 
 
652 aa  549  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.405966  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1197  cell division protein FtsH  51.45 
 
 
649 aa  546  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  49.66 
 
 
640 aa  546  1e-154  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.07 
 
 
638 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.14 
 
 
638 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.58 
 
 
648 aa  547  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1023  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.63 
 
 
657 aa  545  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000161981  hitchhiker  0.0000832625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>