More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0391 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  52.2 
 
 
614 aa  645    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1784  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.77 
 
 
660 aa  890    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0518301 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1990  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.57 
 
 
659 aa  903    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.144891  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.47 
 
 
612 aa  642    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1722  peptidase M41, FtsH  75.77 
 
 
631 aa  972    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.139159 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0391  peptidase M41, FtsH  100 
 
 
662 aa  1355    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0150338  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0358  ATP-dependent metalloprotease FtsH  71.78 
 
 
652 aa  984    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.28 
 
 
612 aa  641    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  52.69 
 
 
637 aa  638    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  74.5 
 
 
662 aa  1001    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.18 
 
 
621 aa  640    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.25 
 
 
637 aa  642    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0426  FtsH peptidase  71.67 
 
 
652 aa  958    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.405966  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  59.01 
 
 
616 aa  633  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  59.65 
 
 
608 aa  635  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.43 
 
 
673 aa  629  1e-179  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  52.67 
 
 
665 aa  625  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.43 
 
 
676 aa  622  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.7 
 
 
671 aa  620  1e-176  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.62 
 
 
617 aa  619  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.18 
 
 
635 aa  617  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.65 
 
 
656 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  52.29 
 
 
660 aa  609  1e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000182706  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.27 
 
 
652 aa  612  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3288  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.93 
 
 
657 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000787677  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3246  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.93 
 
 
657 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000231825  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1197  cell division protein FtsH  57.6 
 
 
649 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3424  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.93 
 
 
657 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000853792  decreased coverage  0.000155742 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1121  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.93 
 
 
652 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000570756  unclonable  0.00000000000918847 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.71 
 
 
634 aa  608  9.999999999999999e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  57.57 
 
 
659 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.81 
 
 
639 aa  606  9.999999999999999e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.89 
 
 
640 aa  607  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  51.97 
 
 
658 aa  607  9.999999999999999e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2841  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.93 
 
 
657 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000356985  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1207  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.88 
 
 
643 aa  605  9.999999999999999e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390556  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1019  membrane protease FtsH catalytic subunit  56.93 
 
 
657 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000780208  hitchhiker  0.000608132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1084  membrane protease FtsH catalytic subunit  57.6 
 
 
657 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000445375  normal  0.0888545 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1023  membrane protease FtsH catalytic subunit  57.79 
 
 
657 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000161981  hitchhiker  0.0000832625 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  57.22 
 
 
650 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  51.39 
 
 
638 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.14 
 
 
650 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000774852  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.23 
 
 
672 aa  602  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  50.41 
 
 
641 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.16 
 
 
640 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3548  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.72 
 
 
682 aa  602  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0555196  normal  0.0513542 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  52.82 
 
 
635 aa  604  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2460  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.5 
 
 
635 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.82 
 
 
635 aa  604  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3568  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.41 
 
 
657 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000520805  hitchhiker  0.00000681699 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.7 
 
 
637 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2262  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.41 
 
 
641 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000538209  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.15 
 
 
643 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  50.72 
 
 
641 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.2 
 
 
655 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  50.81 
 
 
639 aa  603  1.0000000000000001e-171  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0983  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.85 
 
 
657 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000296667  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  56.55 
 
 
651 aa  605  1.0000000000000001e-171  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0801  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.55 
 
 
651 aa  600  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000253513  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3592  ATP-dependent metalloprotease  51.64 
 
 
647 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00319823  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  50.08 
 
 
639 aa  599  1e-170  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  51.64 
 
 
647 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000163816  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.08 
 
 
639 aa  599  1e-170  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1000  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.47 
 
 
656 aa  600  1e-170  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000544697  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.08 
 
 
642 aa  599  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3352  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.09 
 
 
654 aa  599  1e-170  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000888182  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  50.56 
 
 
612 aa  600  1e-170  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  60.7 
 
 
656 aa  598  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  51.64 
 
 
647 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  51.48 
 
 
643 aa  598  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1506  ATP-dependent metallopeptidase HflB  55.27 
 
 
647 aa  600  1e-170  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1076  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.9 
 
 
701 aa  600  1e-170  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.32 
 
 
647 aa  600  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  51.48 
 
 
644 aa  597  1e-169  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.48 
 
 
647 aa  598  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  51.48 
 
 
644 aa  598  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.16 
 
 
610 aa  597  1e-169  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  51.48 
 
 
647 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  51.48 
 
 
644 aa  597  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00158  cell division protease FtsH  57.79 
 
 
646 aa  595  1e-169  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  51.48 
 
 
647 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  52.96 
 
 
649 aa  597  1e-169  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.08 
 
 
650 aa  598  1e-169  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.08 
 
 
615 aa  596  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  58.45 
 
 
641 aa  598  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1440  cell division protein  55.09 
 
 
650 aa  597  1e-169  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1229  cell division protein  50.58 
 
 
646 aa  595  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  51.48 
 
 
647 aa  598  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.75 
 
 
679 aa  596  1e-169  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  51.48 
 
 
647 aa  598  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.89 
 
 
614 aa  595  1e-169  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3592  ATP-dependent metalloprotease  51.32 
 
 
647 aa  595  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000114537  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  51.48 
 
 
647 aa  598  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1467  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.9 
 
 
644 aa  595  1e-169  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179606  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  51.48 
 
 
644 aa  597  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.58 
 
 
645 aa  598  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.22 
 
 
648 aa  598  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.65 
 
 
610 aa  598  1e-169  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  53.24 
 
 
652 aa  592  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  50 
 
 
647 aa  594  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000470783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>