More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1180 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1180  cell division protein FtsH  100 
 
 		 617 aa  1258    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334987  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1012  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.34 
 
 		 616 aa  874    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1229  cell division protein  62.87 
 
 		 646 aa  805    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3248  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.98 
 
 		 616 aa  875    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2393  FtsH peptidase  83.03 
 
 		 619 aa  1043    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00023499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  75.32 
 
 		 617 aa  967    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00193369  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2884  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.97 
 
 		 623 aa  909    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402765  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0272  peptidase M41, FtsH  51.63 
 
 		 639 aa  634  1e-180  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.520053  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.11 
 
 		 637 aa  619  1e-176  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.35 
 
 		 621 aa  619  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  53.2 
 
 		 614 aa  617  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.82 
 
 		 671 aa  617  1e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  52.6 
 
 		 608 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.6 
 
 		 612 aa  608  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.55 
 
 		 652 aa  608  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.44 
 
 		 612 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.48 
 
 		 676 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  51.93 
 
 		 665 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1223  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.44 
 
 		 651 aa  599  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.514183  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  51.3 
 
 		 635 aa  599  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.1 
 
 		 636 aa  599  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.57 
 
 		 647 aa  601  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.3 
 
 		 635 aa  599  1e-170  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  50.66 
 
 		 647 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.85 
 
 		 656 aa  601  1e-170  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  50.33 
 
 		 647 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3592  ATP-dependent metalloprotease  50.49 
 
 		 647 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00319823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  50.49 
 
 		 647 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000163816  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  50.49 
 
 		 647 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2460  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.3 
 
 		 635 aa  598  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  50.33 
 
 		 647 aa  595  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  50.33 
 
 		 644 aa  594  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.33 
 
 		 647 aa  595  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  52.75 
 
 		 644 aa  592  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  49.92 
 
 		 644 aa  594  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000683259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  50.33 
 
 		 644 aa  594  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  51.4 
 
 		 626 aa  593  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52 
 
 		 643 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  50.33 
 
 		 644 aa  594  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  49.92 
 
 		 647 aa  594  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000470783  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  52.33 
 
 		 616 aa  592  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  50.33 
 
 		 647 aa  595  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  50.33 
 
 		 647 aa  595  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3592  ATP-dependent metalloprotease  50.16 
 
 		 647 aa  592  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000114537  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  52.92 
 
 		 649 aa  594  1e-168  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.57 
 
 		 645 aa  592  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.16 
 
 		 650 aa  595  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  50.33 
 
 		 644 aa  594  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3352  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.67 
 
 		 654 aa  589  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000888182  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.44 
 
 		 617 aa  590  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3985  ATP-dependent metalloprotease  49.75 
 
 		 647 aa  591  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000069949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.97 
 
 		 634 aa  591  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.41 
 
 		 637 aa  590  1e-167  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  49.92 
 
 		 641 aa  590  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 		 640 aa  590  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.32 
 
 		 652 aa  590  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.5 
 
 		 648 aa  589  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.57 
 
 		 630 aa  589  1e-167  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  50 
 
 		 637 aa  588  1e-167  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  50.57 
 
 		 681 aa  590  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0801  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.84 
 
 		 651 aa  589  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000253513  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  49.34 
 
 		 649 aa  589  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3612  ATP-dependent metalloprotease  50 
 
 		 644 aa  590  1e-167  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000242003  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  50.08 
 
 		 643 aa  590  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  49.75 
 
 		 638 aa  587  1e-166  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  50.73 
 
 		 641 aa  587  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2262  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.73 
 
 		 641 aa  587  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000538209  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1207  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.22 
 
 		 643 aa  587  1e-166  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  50 
 
 		 641 aa  586  1e-166  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.71 
 
 		 645 aa  587  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.9 
 
 		 640 aa  586  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.05 
 
 		 635 aa  587  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  50.49 
 
 		 639 aa  585  1e-166  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0983  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.23 
 
 		 657 aa  588  1e-166  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000296667  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1770  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.74 
 
 		 651 aa  582  1.0000000000000001e-165  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.292571  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  50.49 
 
 		 660 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000182706  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0366  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.13 
 
 		 641 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.444728  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6874  cell division protein FtsH  53.09 
 
 		 638 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0972491 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  48.8 
 
 		 764 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0483  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.49 
 
 		 631 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000161272  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.37 
 
 		 639 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.16 
 
 		 640 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0172  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.08 
 
 		 646 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.19 
 
 		 627 aa  583  1.0000000000000001e-165  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  50 
 
 		 639 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 		 639 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.33 
 
 		 673 aa  582  1.0000000000000001e-165  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0358  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.84 
 
 		 652 aa  578  1e-164  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1197  cell division protein FtsH  50.74 
 
 		 649 aa  581  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.59 
 
 		 643 aa  580  1e-164  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  49.68 
 
 		 651 aa  580  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  51.23 
 
 		 650 aa  581  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.59 
 
 		 640 aa  581  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.43 
 
 		 642 aa  578  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.59 
 
 		 642 aa  581  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.27 
 
 		 640 aa  580  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.65 
 
 		 641 aa  578  1e-164  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  50.49 
 
 		 658 aa  580  1e-164  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1019  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.74 
 
 		 657 aa  580  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000780208  hitchhiker  0.000608132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1084  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.74 
 
 		 657 aa  579  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000445375  normal  0.0888545 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>