More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2089 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
428 aa  872    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  60.19 
 
 
424 aa  526  1e-148  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  59.38 
 
 
419 aa  514  1e-144  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  54.07 
 
 
425 aa  449  1e-125  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  51.31 
 
 
427 aa  436  1e-121  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  49.51 
 
 
425 aa  389  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  48.66 
 
 
426 aa  370  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  46.37 
 
 
430 aa  368  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  42.63 
 
 
493 aa  348  8e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  45.01 
 
 
419 aa  347  3e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  44.87 
 
 
459 aa  344  2e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  42.55 
 
 
468 aa  336  5.999999999999999e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  42.03 
 
 
477 aa  332  5e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  43.61 
 
 
451 aa  327  3e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  34.01 
 
 
348 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238924 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  38.71 
 
 
814 aa  142  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  36.29 
 
 
363 aa  140  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  36.49 
 
 
391 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  32.81 
 
 
360 aa  130  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0353  peptidase M41, FtsH  33.33 
 
 
575 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.209104  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10341  cell division protein FtsH4  32.92 
 
 
575 aa  130  6e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.194795  hitchhiker  0.000108584 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.44 
 
 
737 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.75 
 
 
769 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  36.28 
 
 
829 aa  129  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  38.35 
 
 
367 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  38.86 
 
 
426 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  36.09 
 
 
326 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.83 
 
 
768 aa  128  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  34.42 
 
 
810 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  34.84 
 
 
804 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  37.8 
 
 
322 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.33 
 
 
735 aa  127  3e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2106  AAA ATPase  37.37 
 
 
371 aa  127  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.56 
 
 
738 aa  127  3e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  38.54 
 
 
322 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.74 
 
 
773 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.84 
 
 
662 aa  126  7e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.54 
 
 
731 aa  126  8.000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.75 
 
 
759 aa  125  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16182  predicted protein  43.17 
 
 
514 aa  125  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0647858  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  41.27 
 
 
320 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.59 
 
 
736 aa  125  1e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.1 
 
 
737 aa  125  1e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  37.98 
 
 
401 aa  125  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.1 
 
 
723 aa  125  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.41 
 
 
732 aa  125  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.91 
 
 
738 aa  125  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.56 
 
 
704 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0925  ATPase central domain-containing protein  30.89 
 
 
371 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9005  predicted protein  33.08 
 
 
337 aa  124  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.299979  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1787  AAA ATPase family protein  36.62 
 
 
372 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  35.19 
 
 
930 aa  124  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.24 
 
 
739 aa  124  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.5 
 
 
760 aa  124  4e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  34.92 
 
 
412 aa  124  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.33 
 
 
697 aa  123  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.33 
 
 
697 aa  123  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  39.89 
 
 
370 aa  123  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.89 
 
 
781 aa  123  7e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.11 
 
 
731 aa  123  7e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  30.04 
 
 
321 aa  123  7e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.11 
 
 
731 aa  123  8e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  37.05 
 
 
323 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  37.05 
 
 
323 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  43.54 
 
 
352 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  35.81 
 
 
394 aa  122  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.2 
 
 
709 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38040  predicted protein  36.13 
 
 
437 aa  122  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.990763  hitchhiker  0.00560331 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0698  ATPase central domain-containing protein  35.81 
 
 
385 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.24522  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  34.39 
 
 
703 aa  122  9.999999999999999e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.65 
 
 
763 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  33.06 
 
 
322 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1021  ATPase central domain-containing protein  30.65 
 
 
371 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32083  AAA ATPase  35.38 
 
 
832 aa  122  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.190339 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  36.12 
 
 
404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1197  ATPase central domain-containing protein  33.96 
 
 
371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.862014  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.56 
 
 
731 aa  121  3e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  30.33 
 
 
328 aa  121  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  30.56 
 
 
328 aa  121  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.58 
 
 
757 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  42.86 
 
 
332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  42.86 
 
 
332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  37.38 
 
 
700 aa  120  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33873  40 kDa putative membrane-spanning ATPase  39.34 
 
 
357 aa  120  4.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.767325  normal  0.0397668 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1901  FtsH-2 peptidase  37.32 
 
 
659 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1660  ATPase central domain-containing protein  31.05 
 
 
371 aa  120  6e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  31.8 
 
 
335 aa  120  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  32.54 
 
 
336 aa  120  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  33.48 
 
 
806 aa  119  7e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  38.05 
 
 
613 aa  119  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  35.94 
 
 
436 aa  119  7e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  34.27 
 
 
338 aa  119  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  27.31 
 
 
332 aa  119  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.92 
 
 
639 aa  119  9e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  43.92 
 
 
335 aa  119  9e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.68 
 
 
718 aa  119  9e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  30.2 
 
 
328 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.44 
 
 
625 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  37.39 
 
 
369 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  34.85 
 
 
335 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>