More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1955 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  100 
 
 
430 aa  878    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  67.54 
 
 
426 aa  585  1e-166  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  55.47 
 
 
425 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  51.9 
 
 
459 aa  412  1e-114  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  48.62 
 
 
468 aa  403  1e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  47.83 
 
 
493 aa  404  1e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  50.24 
 
 
451 aa  398  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  49.88 
 
 
419 aa  395  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  48.4 
 
 
477 aa  385  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  46.6 
 
 
428 aa  376  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  42.38 
 
 
419 aa  353  4e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  43.57 
 
 
424 aa  351  1e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  41.61 
 
 
425 aa  324  2e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  40.09 
 
 
427 aa  302  8.000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  30.84 
 
 
363 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.47 
 
 
662 aa  140  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  36.1 
 
 
348 aa  139  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  32.94 
 
 
326 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  36.17 
 
 
393 aa  138  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  35.42 
 
 
405 aa  138  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  35.15 
 
 
391 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.81 
 
 
737 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.43 
 
 
737 aa  137  4e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1984  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.35 
 
 
659 aa  137  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.614445 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  34.81 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34 
 
 
612 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  33.47 
 
 
614 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1722  peptidase M41, FtsH  34.4 
 
 
631 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.139159 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1314  FtsH-2 peptidase  36.32 
 
 
623 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997053  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34 
 
 
612 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  37.18 
 
 
387 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.96 
 
 
738 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.55 
 
 
662 aa  134  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  36.29 
 
 
426 aa  134  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.04 
 
 
736 aa  133  5e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.53 
 
 
732 aa  133  6e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  36.02 
 
 
436 aa  133  6.999999999999999e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  36.97 
 
 
407 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.36 
 
 
723 aa  132  9e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.27 
 
 
644 aa  132  1.0000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0456572 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.65 
 
 
759 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.47 
 
 
625 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  37.07 
 
 
415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.35 
 
 
655 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.312439  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  36.97 
 
 
407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  35.59 
 
 
394 aa  131  3e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1429  ATPase central domain-containing protein  37.26 
 
 
464 aa  131  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4836  Microtubule-severing ATPase  35.37 
 
 
641 aa  131  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  36.55 
 
 
407 aa  131  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  42.05 
 
 
335 aa  131  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  33.48 
 
 
639 aa  131  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14491  cell division protein FtsH3  34.03 
 
 
620 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  35.69 
 
 
613 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.91 
 
 
643 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.45 
 
 
617 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.99 
 
 
731 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  33.19 
 
 
637 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.6 
 
 
621 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  34.78 
 
 
608 aa  130  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1670  peptidase M41, FtsH  34.62 
 
 
663 aa  130  6e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  36.61 
 
 
639 aa  130  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.56 
 
 
704 aa  130  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.36 
 
 
731 aa  129  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.24 
 
 
735 aa  129  8.000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  34.6 
 
 
416 aa  129  8.000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0857  atpase ec atp-dependent Zn protease  38.89 
 
 
556 aa  129  8.000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0426  FtsH peptidase  32.8 
 
 
652 aa  129  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.405966  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  34.84 
 
 
814 aa  129  9.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1023  cell division protein FtsH, putative  34.35 
 
 
538 aa  129  9.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.343665  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3570  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.33 
 
 
673 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  36.74 
 
 
367 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2543  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.33 
 
 
673 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.122057 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  34.3 
 
 
393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.33 
 
 
676 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.75 
 
 
740 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0830  cell division protein FtsH3  33.61 
 
 
624 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0358  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.02 
 
 
652 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.44 
 
 
731 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.07 
 
 
611 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.19 
 
 
650 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3484  FtsH-2 peptidase  33.07 
 
 
621 aa  128  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13071  cell division protein FtsH3  33.61 
 
 
619 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0784  putative cell division protein FtsH  33.91 
 
 
538 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.331758  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  36.44 
 
 
404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1071  putative cell division protease FtsH-like protein  35.89 
 
 
561 aa  127  3e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  33.19 
 
 
644 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.9 
 
 
731 aa  127  3e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  31.6 
 
 
829 aa  127  3e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  34.42 
 
 
400 aa  127  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  33.19 
 
 
644 aa  127  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  33.19 
 
 
644 aa  127  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  33.19 
 
 
644 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9005  predicted protein  30.6 
 
 
337 aa  127  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.299979  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.19 
 
 
757 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.32 
 
 
742 aa  128  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.26 
 
 
636 aa  127  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.73 
 
 
739 aa  127  3e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  33.19 
 
 
647 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  33.19 
 
 
647 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0489  putative cell division protease FtsH-like protein  37.75 
 
 
643 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>