More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2215 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  75.45 
 
 
459 aa  667    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 
451 aa  907    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  68.89 
 
 
493 aa  607  9.999999999999999e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  64.67 
 
 
468 aa  586  1e-166  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  67.23 
 
 
477 aa  579  1e-164  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  52 
 
 
426 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  50.24 
 
 
430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  50.37 
 
 
425 aa  391  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  48.03 
 
 
419 aa  357  1.9999999999999998e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  43.34 
 
 
424 aa  343  2.9999999999999997e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  43.61 
 
 
428 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  39.61 
 
 
419 aa  319  5e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  42.38 
 
 
427 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  42.48 
 
 
425 aa  300  3e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  35.14 
 
 
348 aa  150  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  32.61 
 
 
363 aa  149  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  34.46 
 
 
326 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  37.39 
 
 
394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.86 
 
 
735 aa  146  9e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  37.07 
 
 
436 aa  144  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0441  putative cell division protease FtsH-like protein  36.59 
 
 
641 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.375713  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  37.39 
 
 
639 aa  141  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  36.21 
 
 
387 aa  140  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.54 
 
 
738 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.39 
 
 
737 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  33.59 
 
 
407 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  38.83 
 
 
814 aa  140  7e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  33.2 
 
 
407 aa  140  7e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  33.59 
 
 
407 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1196  cell division protein FtsH  36.18 
 
 
648 aa  139  1e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.5 
 
 
738 aa  138  2e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  35.94 
 
 
422 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.68 
 
 
730 aa  137  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.54 
 
 
723 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  36.59 
 
 
930 aa  137  5e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  37.76 
 
 
613 aa  137  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  34.35 
 
 
630 aa  137  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  33.11 
 
 
405 aa  136  7.000000000000001e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.05 
 
 
737 aa  136  8e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  35.06 
 
 
829 aa  135  9.999999999999999e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  36.99 
 
 
426 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.27 
 
 
625 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  33.47 
 
 
408 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  36.49 
 
 
386 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.58 
 
 
759 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39 
 
 
768 aa  134  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.73 
 
 
736 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  36.7 
 
 
412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.44 
 
 
732 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  35.62 
 
 
410 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0001  AAA ATPase central domain protein  39.32 
 
 
866 aa  134  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.41279 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.14 
 
 
718 aa  134  3e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  33.77 
 
 
391 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  35.47 
 
 
412 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.61 
 
 
739 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.1 
 
 
742 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0172  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.34 
 
 
646 aa  134  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  34.29 
 
 
407 aa  133  5e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  37.86 
 
 
775 aa  133  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1231  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.69 
 
 
617 aa  134  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.901618  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32083  AAA ATPase  35.78 
 
 
832 aa  133  6e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.190339 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.69 
 
 
740 aa  133  6e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2076  AAA ATPase central domain protein  34.73 
 
 
473 aa  133  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.698999  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.64 
 
 
755 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  33.33 
 
 
366 aa  133  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0489  putative cell division protease FtsH-like protein  39.71 
 
 
643 aa  132  9e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.51 
 
 
781 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  31.46 
 
 
329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.19 
 
 
742 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.09 
 
 
740 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.33 
 
 
731 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.12 
 
 
704 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  31.46 
 
 
329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  33.7 
 
 
398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.89 
 
 
731 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.8 
 
 
769 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  36.27 
 
 
810 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  34.5 
 
 
322 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  33.6 
 
 
402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0193  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.12 
 
 
607 aa  131  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.79 
 
 
756 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  37.56 
 
 
764 aa  130  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  31.82 
 
 
335 aa  131  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  33.47 
 
 
338 aa  131  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1761  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.73 
 
 
643 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4275  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.86 
 
 
667 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.07 
 
 
743 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1314  FtsH-2 peptidase  33.98 
 
 
623 aa  130  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997053  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  42.05 
 
 
335 aa  130  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01366  AAA family ATPase/60S ribosome export protein Rix7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09210)  41.14 
 
 
729 aa  130  6e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690514  normal  0.790284 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  37.32 
 
 
322 aa  130  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  36.05 
 
 
763 aa  130  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14491  cell division protein FtsH3  32.26 
 
 
620 aa  130  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3438  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.65 
 
 
607 aa  130  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.588898  hitchhiker  0.000161563 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1798  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.76 
 
 
635 aa  130  7.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.44 
 
 
731 aa  130  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  32.2 
 
 
335 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0648  AAA ATPase central domain protein  33.47 
 
 
585 aa  129  9.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1429  ATPase central domain-containing protein  32.28 
 
 
464 aa  129  9.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.05 
 
 
653 aa  129  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>