More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3059 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
363 aa  736    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  36.36 
 
 
367 aa  231  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  38.92 
 
 
388 aa  209  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  34.63 
 
 
355 aa  189  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  35.29 
 
 
370 aa  186  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  34.19 
 
 
387 aa  183  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  37.58 
 
 
391 aa  182  6e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  32.37 
 
 
326 aa  180  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  32.8 
 
 
389 aa  180  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  33.55 
 
 
325 aa  177  4e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  33.46 
 
 
366 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  34.36 
 
 
401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  32.35 
 
 
388 aa  173  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  36.51 
 
 
335 aa  172  5.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  40.21 
 
 
322 aa  168  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  28.42 
 
 
390 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  33 
 
 
369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  30.26 
 
 
369 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  31.75 
 
 
405 aa  159  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  33.21 
 
 
430 aa  157  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  37.25 
 
 
360 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  39.01 
 
 
332 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  34.45 
 
 
324 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  39.01 
 
 
332 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  27.36 
 
 
332 aa  157  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  34.51 
 
 
323 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  34.51 
 
 
323 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  39.57 
 
 
335 aa  155  9e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  27.54 
 
 
328 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  38.64 
 
 
338 aa  153  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  39.01 
 
 
320 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  35.34 
 
 
425 aa  152  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  43.71 
 
 
352 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  32.86 
 
 
332 aa  150  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  32.72 
 
 
459 aa  149  6e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  32.19 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  29.96 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  33.46 
 
 
348 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  33.21 
 
 
451 aa  146  5e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  29.51 
 
 
336 aa  146  7.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  33.04 
 
 
345 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  32.37 
 
 
327 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  30.63 
 
 
468 aa  143  4e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  31.9 
 
 
493 aa  142  8e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  34.55 
 
 
322 aa  142  8e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  32.63 
 
 
335 aa  142  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  28.79 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  34.09 
 
 
419 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  33.06 
 
 
426 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  36.29 
 
 
428 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  27.24 
 
 
329 aa  139  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 
477 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  27.87 
 
 
329 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  32.2 
 
 
335 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  33.48 
 
 
322 aa  137  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  39.52 
 
 
424 aa  138  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  41.46 
 
 
239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  28.3 
 
 
321 aa  134  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  36.05 
 
 
419 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  27.8 
 
 
328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  28.96 
 
 
328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  24.57 
 
 
327 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  30.36 
 
 
327 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  35.4 
 
 
425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  30.36 
 
 
327 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  29.58 
 
 
325 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  26.79 
 
 
326 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  25.8 
 
 
330 aa  122  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  34.2 
 
 
336 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  36.32 
 
 
427 aa  119  6e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  26.97 
 
 
336 aa  119  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.22928 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.57 
 
 
759 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  31.05 
 
 
336 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1021  ATPase central domain-containing protein  37.28 
 
 
371 aa  116  6e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0925  ATPase central domain-containing protein  37.28 
 
 
371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  28.24 
 
 
328 aa  114  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1660  ATPase central domain-containing protein  36.69 
 
 
371 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1197  ATPase central domain-containing protein  36.09 
 
 
371 aa  113  5e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.862014  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  26.8 
 
 
336 aa  113  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06980  helicase, putative  36.69 
 
 
756 aa  110  6e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0189232  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  34.13 
 
 
407 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32083  AAA ATPase  31.97 
 
 
832 aa  108  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.190339 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  33.65 
 
 
407 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2106  AAA ATPase  30.8 
 
 
371 aa  107  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  32.44 
 
 
407 aa  107  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  28.68 
 
 
408 aa  106  5e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1795  ATP-dependent M41 family peptidase  31.82 
 
 
1301 aa  106  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1798  ATP-dependent M41 family peptidase  28.05 
 
 
1284 aa  106  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38 
 
 
852 aa  105  9e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  33.97 
 
 
431 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  33.33 
 
 
407 aa  105  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  30 
 
 
436 aa  104  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38040  predicted protein  30.7 
 
 
437 aa  104  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.990763  hitchhiker  0.00560331 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.67 
 
 
735 aa  104  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1140  ATPase central domain-containing protein  36.11 
 
 
372 aa  103  7e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4143  ATPase central domain-containing protein  33.7 
 
 
243 aa  102  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0565  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32 
 
 
713 aa  102  9e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.25 
 
 
662 aa  102  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31786  peroxisomal assembly protein  32.18 
 
 
1178 aa  102  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0579  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32 
 
 
717 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>