More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C1585 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  100 
 
 
329 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  99.7 
 
 
329 aa  669    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  73.93 
 
 
327 aa  494  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  52.91 
 
 
328 aa  352  4e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  53.4 
 
 
328 aa  346  3e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  51.85 
 
 
328 aa  332  4e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  51.25 
 
 
328 aa  331  9e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  48.94 
 
 
322 aa  331  1e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  51.5 
 
 
332 aa  330  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  49.54 
 
 
328 aa  326  3e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  53.92 
 
 
336 aa  325  6e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  47.84 
 
 
327 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  47.84 
 
 
327 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  45.21 
 
 
335 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  49.08 
 
 
321 aa  311  1e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  45.51 
 
 
335 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  52.29 
 
 
328 aa  309  5e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  44.98 
 
 
326 aa  308  5.9999999999999995e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  48.19 
 
 
325 aa  299  4e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  43.94 
 
 
327 aa  295  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  45.62 
 
 
336 aa  287  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  45.23 
 
 
330 aa  277  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  45.02 
 
 
336 aa  276  4e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  44.41 
 
 
336 aa  276  5e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  42.28 
 
 
336 aa  268  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  33.94 
 
 
348 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0010  AAA ATPase central domain protein  33.64 
 
 
333 aa  191  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283039 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  32.72 
 
 
332 aa  178  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  31.61 
 
 
335 aa  172  5.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  35.42 
 
 
335 aa  170  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  34.23 
 
 
326 aa  170  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  30.81 
 
 
338 aa  162  6e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  29.82 
 
 
391 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  32.82 
 
 
324 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  32.73 
 
 
322 aa  152  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  34.36 
 
 
366 aa  152  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  37.82 
 
 
387 aa  151  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  34.55 
 
 
322 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 
352 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  36.77 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  36.45 
 
 
369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  41.61 
 
 
325 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  30.33 
 
 
360 aa  146  6e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  31.94 
 
 
323 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  31.94 
 
 
323 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  32.22 
 
 
388 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  27.87 
 
 
363 aa  139  8.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  31.14 
 
 
369 aa  139  8.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  38.55 
 
 
390 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  32.37 
 
 
389 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  29.13 
 
 
320 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  34.14 
 
 
477 aa  135  9e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  30.12 
 
 
332 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  30.12 
 
 
332 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  30.28 
 
 
370 aa  132  6.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  31.48 
 
 
493 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  32.24 
 
 
451 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  29.92 
 
 
401 aa  129  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  34.21 
 
 
345 aa  129  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  35.38 
 
 
367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  30.77 
 
 
459 aa  124  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  30.23 
 
 
388 aa  123  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  33.19 
 
 
355 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  36.36 
 
 
239 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  29.63 
 
 
468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  32.95 
 
 
419 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  35.57 
 
 
405 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  35.45 
 
 
804 aa  114  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  29.55 
 
 
426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.19 
 
 
640 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.62 
 
 
642 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  28.66 
 
 
425 aa  110  5e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.62 
 
 
655 aa  109  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.62 
 
 
639 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  32.19 
 
 
640 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.88 
 
 
647 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44098  predicted protein  31.67 
 
 
494 aa  107  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0738436 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  31.76 
 
 
639 aa  107  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.76 
 
 
639 aa  107  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  28.74 
 
 
637 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0518  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.7 
 
 
636 aa  107  3e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000475149  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  31.76 
 
 
641 aa  107  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.1 
 
 
627 aa  105  7e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  32.83 
 
 
425 aa  105  8e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.16 
 
 
638 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642505  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.84 
 
 
630 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4836  Microtubule-severing ATPase  29.12 
 
 
641 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  30.65 
 
 
607 aa  104  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  29.41 
 
 
613 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 
419 aa  103  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.68 
 
 
639 aa  102  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  32.41 
 
 
649 aa  102  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0703  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.39 
 
 
650 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0142787  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.41 
 
 
650 aa  102  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0801  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.41 
 
 
651 aa  102  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000253513  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  28.57 
 
 
430 aa  102  8e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3352  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.41 
 
 
654 aa  102  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000888182  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.08 
 
 
599 aa  102  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1467  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.94 
 
 
644 aa  102  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179606  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  31.31 
 
 
647 aa  102  9e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>