More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1467 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  100 
 
 
332 aa  662    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
332 aa  662    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  94.69 
 
 
320 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  70.66 
 
 
323 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  70.66 
 
 
323 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  50.79 
 
 
324 aa  325  5e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  52.17 
 
 
322 aa  311  9e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  49.37 
 
 
338 aa  310  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  47.38 
 
 
335 aa  307  2.0000000000000002e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  49.83 
 
 
322 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  44.9 
 
 
352 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  49.56 
 
 
366 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  39.08 
 
 
326 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  38.55 
 
 
391 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  35.44 
 
 
328 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  36.96 
 
 
326 aa  160  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  33.84 
 
 
328 aa  158  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  32.62 
 
 
322 aa  157  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  39.01 
 
 
363 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  31.73 
 
 
335 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  32.89 
 
 
328 aa  150  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  30.95 
 
 
335 aa  149  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  34.96 
 
 
327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  41.36 
 
 
405 aa  146  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  32.43 
 
 
327 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  32.43 
 
 
327 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  29.17 
 
 
348 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  41.33 
 
 
369 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  31.37 
 
 
328 aa  136  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  36.16 
 
 
387 aa  136  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  30.99 
 
 
332 aa  135  8e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  32.46 
 
 
328 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  34.51 
 
 
390 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  43.5 
 
 
369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  46.04 
 
 
355 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  37.43 
 
 
370 aa  133  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  41.62 
 
 
401 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  32.81 
 
 
332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  30.84 
 
 
388 aa  133  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  30.12 
 
 
329 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  39.11 
 
 
367 aa  132  6.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  30.12 
 
 
329 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  31.9 
 
 
325 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  30.29 
 
 
308 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  35.23 
 
 
325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  32.87 
 
 
389 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  31.54 
 
 
327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  31.76 
 
 
336 aa  129  5.0000000000000004e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  39.06 
 
 
427 aa  129  6e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  38.07 
 
 
424 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  37.17 
 
 
336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  34.47 
 
 
419 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  33.61 
 
 
335 aa  127  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  38.24 
 
 
328 aa  126  5e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  39.88 
 
 
345 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  29.84 
 
 
336 aa  123  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  37.37 
 
 
388 aa  123  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  29.17 
 
 
239 aa  122  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  34.29 
 
 
360 aa  122  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  38.2 
 
 
459 aa  122  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  43.67 
 
 
451 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  38.38 
 
 
430 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  42.86 
 
 
428 aa  120  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  34.55 
 
 
336 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  39.67 
 
 
425 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  34.67 
 
 
425 aa  119  7e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  40.24 
 
 
477 aa  118  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  39.8 
 
 
426 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  31.46 
 
 
336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  35.52 
 
 
330 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  38.1 
 
 
419 aa  116  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  36 
 
 
468 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  36.67 
 
 
493 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  29.43 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4143  ATPase central domain-containing protein  29.84 
 
 
243 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802818  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.05 
 
 
760 aa  106  5e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.51 
 
 
759 aa  106  6e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.22 
 
 
769 aa  104  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.32 
 
 
810 aa  101  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.92 
 
 
739 aa  101  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  33.86 
 
 
466 aa  99.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0010  AAA ATPase central domain protein  30.08 
 
 
333 aa  100  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283039 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31786  peroxisomal assembly protein  32.46 
 
 
1178 aa  99  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.2 
 
 
718 aa  97.1  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02925  microbody (peroxisome) biogenesis protein peroxin 6 (Eurofung)  34.64 
 
 
1476 aa  96.7  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.637827  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32083  AAA ATPase  36.02 
 
 
832 aa  96.7  5e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.190339 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.94 
 
 
735 aa  96.3  7e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.15 
 
 
737 aa  95.1  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0634  ATPase central domain-containing protein  37.02 
 
 
599 aa  95.5  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.527117  normal  0.730431 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.87 
 
 
723 aa  95.5  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.78 
 
 
666 aa  95.5  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302131  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03110  hypothetical protein  37.97 
 
 
1124 aa  94.4  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1021  ATPase central domain-containing protein  31.46 
 
 
371 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.15 
 
 
743 aa  94.7  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0925  ATPase central domain-containing protein  32.02 
 
 
371 aa  94.7  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.5 
 
 
740 aa  94.4  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.16 
 
 
768 aa  93.6  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.33 
 
 
852 aa  94  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.12 
 
 
740 aa  94  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.66 
 
 
742 aa  93.6  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>