More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4254 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 332 aa  657    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  79.29 
 
 		 336 aa  497  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  54.8 
 
 		 328 aa  373  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  58.31 
 
 		 328 aa  357  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  55.28 
 
 		 328 aa  349  5e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  54.52 
 
 		 328 aa  348  6e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  53.58 
 
 		 322 aa  343  2e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  53.87 
 
 		 328 aa  340  2.9999999999999998e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  51.5 
 
 		 329 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  51.86 
 
 		 327 aa  329  4e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  51.5 
 
 		 329 aa  328  8e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  48.17 
 
 		 327 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  48.17 
 
 		 327 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  50.78 
 
 		 326 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  51.26 
 
 		 328 aa  317  1e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  48.02 
 
 		 335 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  47.11 
 
 		 335 aa  299  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  46.11 
 
 		 325 aa  291  1e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  46.75 
 
 		 336 aa  286  5e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  45.94 
 
 		 330 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  44.24 
 
 		 321 aa  280  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  44 
 
 		 327 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  45.34 
 
 		 336 aa  278  1e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  45.03 
 
 		 336 aa  276  4e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  45.34 
 
 		 336 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0010  AAA ATPase central domain protein  43.03 
 
 		 333 aa  231  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283039 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  34.34 
 
 		 326 aa  160  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  32.59 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  27.36 
 
 		 363 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  32.52 
 
 		 348 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  30.77 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  29.7 
 
 		 391 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  34.01 
 
 		 366 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  35.32 
 
 		 324 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 		 352 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  38.69 
 
 		 387 aa  144  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  34.93 
 
 		 322 aa  142  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  38.89 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  36.68 
 
 		 388 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  37.37 
 
 		 389 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  37.96 
 
 		 325 aa  139  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  34.5 
 
 		 308 aa  139  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  32.54 
 
 		 425 aa  136  5e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  36.68 
 
 		 390 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  32.81 
 
 		 332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  32.81 
 
 		 332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  31.49 
 
 		 320 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  31.91 
 
 		 360 aa  132  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  30.39 
 
 		 338 aa  132  9e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  33.01 
 
 		 323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  33.01 
 
 		 323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 		 322 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  31.06 
 
 		 370 aa  125  8.000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 		 451 aa  125  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  30.07 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  34.23 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  32.2 
 
 		 401 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  27.31 
 
 		 428 aa  119  6e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  31.02 
 
 		 477 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  30.12 
 
 		 493 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  33.65 
 
 		 369 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  31.7 
 
 		 367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  39.44 
 
 		 355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  31.58 
 
 		 419 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  29.92 
 
 		 424 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  29.31 
 
 		 430 aa  113  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  30.93 
 
 		 426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  28.24 
 
 		 468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  42.33 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  34.21 
 
 		 405 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 		 239 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  29.17 
 
 		 459 aa  109  8.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  30.13 
 
 		 388 aa  109  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  32.76 
 
 		 427 aa  108  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29 
 
 		 768 aa  102  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4998  AAA ATPase central domain protein  31.98 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.77 
 
 		 644 aa  102  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0456572 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.89 
 
 		 759 aa  101  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4836  Microtubule-severing ATPase  30.99 
 
 		 641 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4143  ATPase central domain-containing protein  30.32 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802818  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  31.82 
 
 		 425 aa  100  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  32.38 
 
 		 639 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.26 
 
 		 760 aa  100  4e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  37.82 
 
 		 613 aa  99.4  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  28.46 
 
 		 407 aa  99  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  30.67 
 
 		 803 aa  98.6  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  32.39 
 
 		 478 aa  98.2  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.25 
 
 		 723 aa  97.8  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14591  cell division protein FtsH4  32.1 
 
 		 619 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.584936 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.17 
 
 		 685 aa  97.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09061  cell division protein FtsH4  35 
 
 		 577 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0625866  hitchhiker  0.0000226946 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.65 
 
 		 781 aa  96.7  5e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.63 
 
 		 737 aa  96.7  5e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.47 
 
 		 769 aa  96.3  6e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44098  predicted protein  30.58 
 
 		 494 aa  96.3  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0738436 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.11 
 
 		 852 aa  96.3  6e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1795  ATP-dependent M41 family peptidase  29.22 
 
 		 1301 aa  96.3  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  28.05 
 
 		 407 aa  95.9  8e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1253  cell division protein FtsH  31.3 
 
 		 613 aa  95.9  9e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3062  ATPase central domain-containing protein  33.05 
 
 		 440 aa  95.9  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.584274  normal  0.939861 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>