More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4276 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 327 aa  669    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 327 aa  669    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  58.9 
 
 		 328 aa  386  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  53 
 
 		 322 aa  350  2e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  50.77 
 
 		 328 aa  341  1e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  48.17 
 
 		 332 aa  320  9.999999999999999e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  47.83 
 
 		 327 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  47.99 
 
 		 327 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  47.84 
 
 		 329 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  46.89 
 
 		 328 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  47.53 
 
 		 329 aa  311  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  47.02 
 
 		 328 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  49.04 
 
 		 336 aa  308  6.999999999999999e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  48.44 
 
 		 325 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  47.71 
 
 		 335 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  47.2 
 
 		 321 aa  301  1e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  44.17 
 
 		 328 aa  301  1e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  47.81 
 
 		 328 aa  295  5e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  46.48 
 
 		 335 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  43.22 
 
 		 326 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  42.07 
 
 		 330 aa  278  9e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  41.32 
 
 		 336 aa  277  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  41.57 
 
 		 336 aa  275  9e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  41.87 
 
 		 336 aa  273  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  41.54 
 
 		 336 aa  270  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0010  AAA ATPase central domain protein  34.14 
 
 		 333 aa  185  9e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283039 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  36.7 
 
 		 326 aa  170  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  31.94 
 
 		 335 aa  166  5.9999999999999996e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  38.89 
 
 		 366 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  31.25 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  30.06 
 
 		 348 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  29.62 
 
 		 391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  35.8 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  30.46 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  30.77 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  32.57 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  33.46 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  32.65 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  32.43 
 
 		 332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  32.43 
 
 		 332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  35.06 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  38.07 
 
 		 387 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  31.94 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  31.94 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  34.21 
 
 		 308 aa  139  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  38.89 
 
 		 325 aa  139  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  38.22 
 
 		 369 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  38.12 
 
 		 390 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  35.91 
 
 		 388 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  35.59 
 
 		 389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  35.26 
 
 		 369 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  30.36 
 
 		 363 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  35.07 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  32.05 
 
 		 405 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  27.08 
 
 		 360 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  36.46 
 
 		 239 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  35.03 
 
 		 370 aa  119  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 		 355 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  31.93 
 
 		 419 aa  116  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  30.17 
 
 		 477 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  32.98 
 
 		 367 aa  112  7.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  30.95 
 
 		 426 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  30.36 
 
 		 425 aa  108  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  30.33 
 
 		 427 aa  108  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  30.92 
 
 		 388 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  28.29 
 
 		 428 aa  107  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4998  AAA ATPase central domain protein  37.5 
 
 		 317 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.64 
 
 		 759 aa  107  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  27.78 
 
 		 419 aa  105  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  31.76 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31 
 
 		 650 aa  105  1e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  34.48 
 
 		 425 aa  105  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0001  AAA ATPase central domain protein  30.17 
 
 		 866 aa  104  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.41279 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2253  Microtubule-severing ATPase  34.92 
 
 		 414 aa  103  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.951648  normal  0.563055 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  31.87 
 
 		 401 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  34.1 
 
 		 451 aa  103  6e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1196  cell division protein FtsH  35.33 
 
 		 648 aa  103  6e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  31.1 
 
 		 459 aa  102  7e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.88 
 
 		 685 aa  102  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  28.32 
 
 		 493 aa  101  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1670  peptidase M41, FtsH  33.16 
 
 		 663 aa  101  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  32.07 
 
 		 393 aa  100  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.4 
 
 		 768 aa  101  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3258  AAA ATPase central domain protein  36.11 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69388  normal  0.0190721 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.19 
 
 		 644 aa  101  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0456572 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  33.66 
 
 		 804 aa  100  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  33.49 
 
 		 810 aa  100  4e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2600  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.06 
 
 		 641 aa  100  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  32.92 
 
 		 430 aa  100  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.29 
 
 		 852 aa  99.8  6e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0699  cell division protein FtsH  30.84 
 
 		 532 aa  99.4  7e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  35.76 
 
 		 631 aa  99.8  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38040  predicted protein  33.48 
 
 		 437 aa  99  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.990763  hitchhiker  0.00560331 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl672  cell division protein  31.36 
 
 		 650 aa  98.6  1e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  31.49 
 
 		 424 aa  99  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4143  ATPase central domain-containing protein  33.15 
 
 		 243 aa  98.6  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802818  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.56 
 
 		 769 aa  98.2  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1023  cell division protein FtsH, putative  30.51 
 
 		 538 aa  98.2  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.343665  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1262  FtsH peptidase  36.36 
 
 		 629 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.36 
 
 		 631 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>