More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0842 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.79 
 
 		 662 aa  655    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1293  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.58 
 
 		 608 aa  663    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 		 644 aa  1320    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0456572 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0326  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.27 
 
 		 681 aa  620  1e-176  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000432409  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0579  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.43 
 
 		 717 aa  619  1e-176  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0565  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.43 
 
 		 713 aa  619  1e-176  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.08 
 
 		 646 aa  555  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.08 
 
 		 646 aa  555  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1314  FtsH-2 peptidase  47.94 
 
 		 623 aa  546  1e-154  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4937  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.28 
 
 		 623 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206394  normal  0.640617 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.88 
 
 		 625 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1483  peptidase M41, FtsH  47.69 
 
 		 629 aa  538  1e-151  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.45624  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19161  cell division protein FtsH3  47.84 
 
 		 625 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.73 
 
 		 611 aa  537  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  46.87 
 
 		 616 aa  532  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0470  cell division protein FtsH  45.84 
 
 		 658 aa  530  1e-149  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2804  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.54 
 
 		 645 aa  531  1e-149  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0830  cell division protein FtsH3  48.02 
 
 		 624 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.34 
 
 		 615 aa  530  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.76 
 
 		 640 aa  531  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3438  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.82 
 
 		 607 aa  528  1e-149  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.588898  hitchhiker  0.000161563 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.23 
 
 		 639 aa  527  1e-148  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2234  FtsH-2 peptidase  47.81 
 
 		 645 aa  526  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0163354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.67 
 
 		 714 aa  528  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.67 
 
 		 696 aa  527  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.49 
 
 		 638 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13071  cell division protein FtsH3  46.81 
 
 		 619 aa  528  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14491  cell division protein FtsH3  46.82 
 
 		 620 aa  524  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  44.48 
 
 		 646 aa  523  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  45.18 
 
 		 608 aa  522  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.13 
 
 		 643 aa  523  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  45.96 
 
 		 631 aa  522  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3484  FtsH-2 peptidase  46.43 
 
 		 621 aa  525  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0873  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.87 
 
 		 645 aa  520  1e-146  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0168176  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3570  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.44 
 
 		 673 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.6 
 
 		 602 aa  519  1e-146  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.68 
 
 		 638 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.16 
 
 		 638 aa  520  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2188  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.43 
 
 		 649 aa  519  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350229  normal  0.438236 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  44.05 
 
 		 652 aa  520  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2543  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.44 
 
 		 673 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0193  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.1 
 
 		 607 aa  518  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1495  FtsH-2 peptidase  45.37 
 
 		 635 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.421707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.3 
 
 		 637 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4385  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.16 
 
 		 663 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.35 
 
 		 638 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2170  peptidase M41, FtsH  44.2 
 
 		 627 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415072  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  46.66 
 
 		 640 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4517  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.16 
 
 		 663 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.723361  normal  0.670531 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  45.94 
 
 		 764 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0925  FtsH-2 peptidase  47.21 
 
 		 624 aa  516  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.610523 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16831  cell division protein FtsH3  46.65 
 
 		 635 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.51 
 
 		 638 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.57 
 
 		 647 aa  516  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14251  cell division protein FtsH3  47.13 
 
 		 620 aa  514  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.520813  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  45.48 
 
 		 614 aa  514  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  45.6 
 
 		 626 aa  512  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  46 
 
 		 613 aa  514  1e-144  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  44.32 
 
 		 617 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  44.08 
 
 		 645 aa  515  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.48 
 
 		 640 aa  514  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  44.46 
 
 		 638 aa  509  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14631  cell division protein FtsH3  46.82 
 
 		 620 aa  511  1e-143  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.336719  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.08 
 
 		 642 aa  511  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  45.78 
 
 		 639 aa  510  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.29 
 
 		 640 aa  511  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.28 
 
 		 638 aa  511  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642505  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.39 
 
 		 676 aa  511  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.78 
 
 		 639 aa  510  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.87 
 
 		 607 aa  509  1e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  44 
 
 		 617 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.38 
 
 		 637 aa  509  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0076  membrane protease FtsH catalytic subunit  42.84 
 
 		 644 aa  511  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.597348  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.61 
 
 		 621 aa  509  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  45.44 
 
 		 693 aa  509  1e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.37 
 
 		 647 aa  511  1e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.5 
 
 		 671 aa  509  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  43.59 
 
 		 673 aa  511  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1526  ATP-dependent zinc metallopeptidase  43.28 
 
 		 628 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0854  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.43 
 
 		 621 aa  506  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.946153  normal  0.500418 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1013  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.43 
 
 		 621 aa  506  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  43.17 
 
 		 641 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2043  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.59 
 
 		 687 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000823852 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  44.16 
 
 		 617 aa  508  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.23 
 
 		 630 aa  505  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.37 
 
 		 656 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  45.18 
 
 		 640 aa  507  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  43.85 
 
 		 640 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  43.64 
 
 		 641 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2262  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.64 
 
 		 641 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000538209  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.69 
 
 		 640 aa  507  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.08 
 
 		 642 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.9 
 
 		 620 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.08 
 
 		 642 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.34 
 
 		 630 aa  503  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.18 
 
 		 640 aa  503  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.29 
 
 		 634 aa  503  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.83 
 
 		 640 aa  503  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.12 
 
 		 610 aa  504  1e-141  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.61 
 
 		 652 aa  502  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>